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猪IGF1基因启动子活性分析及其表达调控的相关研究

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
英文缩写词第8-13页
1 前言第13-26页
    1.1 养猪业的重要性第13页
    1.2 IGF1基因的研究进展第13-18页
        1.2.1 IGF1的研究历史第13-14页
        1.2.2 IGF1基因的结构及定位第14页
        1.2.3 IGF1基因的生物学功能第14-15页
            1.2.3.1 IGF1促生长作用第14-15页
            1.2.3.2 IGF1对胚胎发育的作用第15页
        1.2.4 IGF1基因的表达量第15-16页
        1.2.5 IGF1基因的多态性第16-17页
        1.2.6 IGF1的调控第17-18页
            1.2.6.1 IGFBPs的调控第17-18页
            1.2.6.2 激素对IGF1的调控第18页
    1.3 Poly(dA:dT) tract的研究进展第18-22页
        1.3.1 Poly(dA:dT) tracts在体内的重要功能第18-19页
        1.3.2 Poly(dA:dT) tracts在体内排斥核小体第19-20页
        1.3.3 Poly(dA:dT) tracts拥有不寻常的结构与动态特性第20-22页
    1.4 转录因子C/EBPα的研究进展第22-25页
        1.4.1 C/EBPs的研究历史第22-24页
        1.4.2 C/EBPα的调控机理第24-25页
    1.5 研究目的及意义第25页
    1.6 本研究的技术路线第25-26页
2 材料与方法第26-52页
    2.1 实验材料第26-31页
        2.1.1 供试样品第26页
        2.1.2 主要仪器与设备第26-27页
        2.1.3 主要试剂来源和配制第27-30页
            2.1.3.1 酶类、试剂和试剂盒第27页
            2.1.3.2 试剂的配置第27-30页
        2.1.4 细胞株、菌株和质粒第30页
        2.1.5 主要分子生物学软件与数据库第30-31页
    2.2 实验方法第31-52页
        2.2.1 基因组DNA和总RNA抽提第31-33页
            2.2.1.1 基因组DNA的抽提第31页
            2.2.1.2 总RNA抽提第31-32页
            2.2.1.3 总RNA的DNase-Ⅰ处理第32页
            2.2.1.4 总RNA检测及浓度测定第32-33页
        2.2.2 总RNA反转录第33页
        2.2.3 猪IGF1基因 5′调控区克隆第33-38页
            2.2.3.1 猪IGF1基因 5′调控区扩增第34页
            2.2.3.2 目的片段的回收和纯化第34-36页
            2.2.3.3 目的片段的T载体克隆第36-37页
            2.2.3.4 T-IGF1的质粒抽提第37-38页
        2.2.4 猪IGF1基因启动子报告基因重组体的构建及活性分析第38-44页
            2.2.4.1 启动子 5′端系列缺失报告基因重组体的构建第38-40页
            2.2.4.2 猪IGF1基因缺失片段的PCR扩增第40页
            2.2.4.3 各缺失片段PCR产物的回收第40页
            2.2.4.4 缺失片段PCR产物和pGL3-basic载体双酶切第40-41页
            2.2.4.5 酶切产物回收第41页
            2.2.4.6 酶切产物的连接第41页
            2.2.4.7 酶切连接产物的转化第41页
            2.2.4.8 无内毒素质粒抽提方法第41-42页
            2.2.4.9 各重组质粒纯化与检测第42页
            2.2.4.10 猪胎儿成纤维细胞体外培养体系的建立第42-43页
            2.2.4.11 瞬时转染第43-44页
            2.2.4.12 荧光素酶报告基因活性检测第44页
        2.2.5 含不同基因型poly(dA:dT) tract的IGF1核心启动子的报告基因重组体的构建及活性分析第44-45页
            2.2.5.1 含不同基因型poly(dA:dT) tract的IGF1核心启动子的报告基因重组体的构建第44页
            2.2.5.2 含不同基因型poly(dA:dT) tract的IGF1核心启动子片段的PCR扩增第44-45页
            2.2.5.3 各启动子片段PCR产物的回收第45页
            2.2.5.4 各启动子片段PCR产物和pGL3-basic载体双酶切第45页
            2.2.5.5 酶切产物回收第45页
            2.2.5.6 酶切产物的连接第45页
            2.2.5.7 酶切连接产物的转化第45页
            2.2.5.8 无内毒素质粒抽提第45页
            2.2.5.9 猪胎儿成纤维细胞体外培养体系的建立第45页
            2.2.5.10 瞬时转染第45页
            2.2.5.11 荧光素酶报告基因活性检测第45页
        2.2.6 猪IGF1基因相关转录因子鉴定第45-52页
            2.2.6.1 C/EBPα超表达载体的构建第45-52页
                2.2.6.1.1 引物设计及合成第45-46页
                2.2.6.1.2 目的片段的回收和纯化第46页
                2.2.6.1.3 PCR产物和pcDNA3.1 载体双酶切第46页
                2.2.6.1.4 酶切产物的回收第46页
                2.2.6.1.5 酶切产物的连接第46页
                2.2.6.1.6 酶切连接产物的转化第46-47页
                2.2.6.1.7 无内毒素质粒抽提第47页
                2.2.6.1.8 猪胎儿成纤维细胞体外培养体系的建立第47页
                2.2.6.1.9 pcDNA3.1- C/EBPα与含不同基因型poly(dA:dT) tract的P5报告基因重组体共转染第47页
                2.2.6.1.10 超表达后mRNA水平的检测第47-48页
                2.2.6.1.11 定量结果的数据分析处理第48页
                2.2.6.1.12 C/EBPα干扰实验第48-49页
                2.2.6.1.13 染色质免疫共沉淀(ChIP)第49-52页
3 结果与分析第52-64页
    3.1 DNA提取结果第52-53页
    3.2 总RNA提取结果第53页
    3.3 猪IGF15′调控区序列获得第53-54页
    3.4 猪IGF1基因启动子报告基因重组体的构建及活性分析第54-58页
        3.4.1 猪IGF1基因启动子转录因子结合位点的预测第54-55页
        3.4.2 启动子报告基因重组体的构建第55页
        3.4.3 猪原代胎儿成纤维细胞的培养第55-57页
        3.4.4 启动子活性分析第57-58页
    3.5 含不同基因型poly(dA:dT) tract的IGF1核心启动子的活性分析第58页
    3.6 猪IGF1基因核转录因子鉴定第58-64页
        3.6.1 C/EBPα超表达载体构建第58-59页
        3.6.2 pcDNA3.1-C/EBPα与含不同基因型poly(dA:dT) tract的P5报告基因重组体共转染第59-60页
        3.6.3 pcDNA3.1-C/EBPα的超表达第60-61页
        3.6.4 C/EBPα干扰实验第61-63页
        3.6.5 IGF1基因启动子ChIP检测结果第63-64页
4 讨论与结论第64-77页
    4.1 IGF1基因对动物机体的作用第64页
    4.2 猪IGF1基因 5′调控区序列的获得第64-65页
    4.3 猪IGF1基因启动子活性分析第65-68页
        4.3.1 猪IGF1基因 5′调控区重要调控元件分析第65-67页
        4.3.2 猪IGF1基因启动子活性分析第67-68页
    4.4 Poly(dA:dT) tract对IGF1基因的调控第68-71页
    4.5 C/EBPα对IGF1基因的调控第71-73页
    4.6 Poly(dA:dT) tract对C/EBPα调控IGF1基因的影响第73-75页
    4.7 结论第75-77页
致谢第77-78页
参考文献第78-92页
附录第92-93页

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