| 摘要 | 第8-11页 |
| Abstract | 第11-13页 |
| 1 前言 | 第14-27页 |
| 1.1 昆虫的触角 | 第15-16页 |
| 1.2 昆虫的嗅觉感受器 | 第16-18页 |
| 1.2.1 毛形感器 | 第17页 |
| 1.2.2 刺形感器 | 第17-18页 |
| 1.2.3 锥形感器 | 第18页 |
| 1.2.4 腔锥形感器 | 第18页 |
| 1.3 昆虫嗅觉系统的分子机制 | 第18-24页 |
| 1.3.1 气味受体OR | 第19-21页 |
| 1.3.2 离子型受体IR | 第21页 |
| 1.3.3 气味结合蛋白OBP | 第21-23页 |
| 1.3.4 化学感受蛋白CSP | 第23-24页 |
| 1.4 昆虫嗅觉基因识别的历史与方法 | 第24-26页 |
| 1.5 本研究的目的与意义 | 第26-27页 |
| 2 棉蚜基因组中嗅觉基因的识别与鉴定 | 第27-45页 |
| 2.1 材料与方法 | 第27-31页 |
| 2.1.1 基因组中嗅觉基因的人工注释流程 | 第27页 |
| 2.1.2 嗅觉基因的基因组位点识别 | 第27-28页 |
| 2.1.3 嗅觉基因外显子人工拼接 | 第28-29页 |
| 2.1.4 供试昆虫 | 第29页 |
| 2.1.5 组织样本收集与反转录 | 第29-30页 |
| 2.1.6 qRT-PCR引物的设计 | 第30页 |
| 2.1.7 使用quantitative-RT-PCR分析表达水平 | 第30-31页 |
| 2.2 结果 | 第31-42页 |
| 2.2.1 嗅觉受体AgoOR家族 | 第31-36页 |
| 2.2.2 离子型受体AgoIR家族 | 第36-41页 |
| 2.2.3 棉蚜嗅觉相关基因的表达差异研究 | 第41-42页 |
| 2.3 讨论 | 第42-45页 |
| 3 二化螟成虫触角转录组中嗅觉基因的注释 | 第45-68页 |
| 3.1 材料与方法 | 第46-52页 |
| 3.1.1 供试昆虫 | 第46页 |
| 3.1.2 总RNA的提取 | 第46-47页 |
| 3.1.3 Illumina测序文库的构建与测序 | 第47页 |
| 3.1.4 组装 | 第47-48页 |
| 3.1.5 功能注释 | 第48页 |
| 3.1.6 嗅觉受体基因OR注释 | 第48-49页 |
| 3.1.7 气味结合蛋白OBP的注释 | 第49-50页 |
| 3.1.8 化学感受蛋白CSP的注释 | 第50页 |
| 3.1.9 离子型受体IR的注释 | 第50-51页 |
| 3.1.10 RT-PCR引物的设计 | 第51页 |
| 3.1.11 使用semi-quantitative-RT-PCR分析表达水平 | 第51-52页 |
| 3.2 结果 | 第52-66页 |
| 3.2.1 触角转录组概况 | 第52-54页 |
| 3.2.2 二化螟嗅觉受体基因CsupOR的鉴定和分析 | 第54-57页 |
| 3.2.3 二化螟离子型受体CsupIR的识别 | 第57-60页 |
| 3.2.4 二化螟气味结合蛋白CsupOBP的识别 | 第60-63页 |
| 3.2.5 二化螟化学感受蛋白CSP的识别 | 第63页 |
| 3.2.6 组织表达差异验证 | 第63-66页 |
| 3.3 讨论 | 第66-68页 |
| 4 小菜蛾触角转录组中嗅觉相关基因的注释 | 第68-85页 |
| 4.1 材料与方法 | 第68-69页 |
| 4.1.1 供试昆虫 | 第68-69页 |
| 4.1.2 总RNA的提取 | 第69页 |
| 4.1.3 测序、组装与注释 | 第69页 |
| 4.1.4 嗅觉相关基因的注释 | 第69页 |
| 4.2 结果 | 第69-83页 |
| 4.2.1 测序与组装 | 第69-72页 |
| 4.2.2 小菜蛾嗅觉受体PxylOR的识别 | 第72-74页 |
| 4.2.3 小菜蛾离子型受体PxylIR的识别 | 第74-78页 |
| 4.2.4小菜蛾气味结合蛋白PxylOBP的识别 | 第78-79页 |
| 4.2.5 小菜蛾化学感受蛋白PxylCSP的识别 | 第79-83页 |
| 4.3 讨论 | 第83-85页 |
| 5 美洲棉铃虫、阿根廷棉铃虫触角转录组中的嗅觉基因 | 第85-104页 |
| 5.1 材料与方法 | 第86页 |
| 5.1.1 美洲棉铃虫 | 第86页 |
| 5.1.2 阿根廷棉铃虫 | 第86页 |
| 5.1.3 总RNA的提取 | 第86页 |
| 5.1.4 测序、组装与注释 | 第86页 |
| 5.1.5 嗅觉相关基因的注释 | 第86页 |
| 5.2 结果与讨论 | 第86-104页 |
| 5.2.1 测序与组装 | 第86-87页 |
| 5.2.2 美洲棉铃虫嗅觉受体HzeaOR的识别 | 第87-92页 |
| 5.2.3 美洲棉铃虫离子型受体HzeaIR的识别 | 第92页 |
| 5.2.4 美洲棉铃虫气味结合蛋白HzeaOBP的识别 | 第92-96页 |
| 5.2.5 阿根廷棉铃虫嗅觉受体HgelOR的识别 | 第96-100页 |
| 5.2.6 阿根廷棉铃虫离子型受体HgelIR的识别 | 第100页 |
| 5.2.7 阿根廷棉铃虫气味结合蛋白HgelOBP的识别 | 第100-104页 |
| 6 铃夜蛾属4个近缘物种的系统进化分析 | 第104-113页 |
| 6.1 材料与方法 | 第104-106页 |
| 6.1.1 数据与组装 | 第104-105页 |
| 6.1.2 直系同源基因簇的识别 | 第105页 |
| 6.1.3 phylogenomics分析 | 第105-106页 |
| 6.2 结果与讨论 | 第106-113页 |
| 6.2.1 直系同源基因簇 | 第106-107页 |
| 6.2.2 Phylogenomics分析 | 第107页 |
| 6.2.3 直系同源基因的达尔文选择分析 | 第107-109页 |
| 6.2.4 铃夜蛾属家族嗅觉受体基因分析 | 第109-110页 |
| 6.2.5 铃夜蛾属直系同源OR基因的达尔文选择分析 | 第110-113页 |
| 7 全文总结 | 第113-117页 |
| 7.1 棉蚜嗅觉相关基因的识别 | 第113页 |
| 7.2 二化螟嗅觉相关基因的识别 | 第113-114页 |
| 7.3 小菜蛾嗅觉相关基因的识别 | 第114-115页 |
| 7.4 铃夜蛾属近缘物种的嗅觉基因与系统发生关系 | 第115页 |
| 7.5 全文总结 | 第115-117页 |
| 参考文献 | 第117-157页 |
| 附录 攻读博士期间发表文章 | 第157-158页 |
| 致谢 | 第158-159页 |
