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耐辐射异常球菌非编码RNA drrA氧化抗性功能分析

摘要第6-7页
abstract第7-8页
第一章 引言第13-30页
    1.1 细菌非编码RNA研究进展第13-23页
        1.1.1 非编码RNA概述第13-14页
        1.1.2 非编码RNA的功能与鉴定第14-19页
        1.1.3 非编码RNA调控作用的分子机制第19-23页
    1.2 耐辐射异常球菌及其非编码RNA第23-28页
        1.2.1 耐辐射异常球菌基本特征第23-24页
        1.2.2 耐辐射异常球菌极端抗性第24-26页
        1.2.3 耐辐射异常球菌的非编码RNA第26-28页
    1.3 立题依据和技术路线第28-30页
        1.3.1 立题依据第28-29页
        1.3.2 技术路线第29-30页
第二章 耐辐射异常球菌中drrA的进化分析与表达特性第30-44页
    2.1 材料和方法第30-36页
        2.1.1 实验菌株及培养基第30页
        2.1.2 实验材料第30-31页
        2.1.3 细菌的培养第31页
        2.1.4 细菌总RNA的提取第31-32页
        2.1.5 总RNA基因组的消化与反转录第32页
        2.1.6 荧光实时定量PCR第32-34页
        2.1.7 Northern blot第34-36页
        2.1.8 5‘RACE第36页
    2.2 结果与分析第36-42页
        2.2.1 drrA基因的基本特征和生物信息学分析第36-38页
        2.2.2 drrA的Northern blot验证第38页
        2.2.3 drrA转录起始位点和方向第38-39页
        2.2.4 不同生长时期drrA的表达特征第39-40页
        2.2.5 不同非生物胁迫条件下drrA的表达第40-41页
        2.2.6 氧化胁迫条件下drrA的表达第41-42页
    2.3 讨论第42-44页
第三章 耐辐射异常球菌 ΔdrrA突变株的构建和氧化功能分析第44-61页
    3.1 材料和方法第45-52页
        3.1.1 实验菌株和质粒第45页
        3.1.2 试剂耗材与仪器第45页
        3.1.3 培养基与抗生素第45-46页
        3.1.4 细菌的培养第46页
        3.1.5 细菌基因组总DNA和质粒DNA的提取第46页
        3.1.6 引物设计与PCR反应第46-48页
        3.1.7 DNA片段回收与纯化第48页
        3.1.8 DNA片段的酶切与连接第48-49页
        3.1.9 E.coli大肠杆菌细胞感受态的转化第49-50页
        3.1.10 耐辐射异常球菌感受态制备及DNA线性转化第50页
        3.1.11 耐辐射异常球菌生长曲线测定第50页
        3.1.12 氧化胁迫条件下菌株的生长第50-51页
        3.1.13 其他非生物胁迫条件下菌株的生长第51页
        3.1.14 细菌总RNA的提取第51页
        3.1.15 总RNA中基因组的消化与反转录第51页
        3.1.16 荧光实时定量PCR第51页
        3.1.17 β-半乳糖苷酶活性测定第51-52页
    3.2 结果与分析第52-58页
        3.2.1 缺失突变株 ΔdrrA的构建和验证第52-54页
        3.2.2 drrA基因缺失对邻近基因表达的影响第54-55页
        3.2.3 drrA基因缺失对菌株生长的影响第55-56页
        3.2.4 drrA基因缺失降低菌株的氧化胁迫抗性第56-57页
        3.2.5 drrA基因缺失对菌株耐受其他非生物胁迫的影响第57页
        3.2.6 drrA基因缺失对氧化相关基因表达的影响第57-58页
    3.3 讨论第58-61页
第四章 全文结论第61-62页
参考文献第62-72页
致谢第72-73页
作者简历第73页

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