| 致谢 | 第4-8页 |
| 英文缩略表 | 第8-9页 |
| 摘要 | 第9-11页 |
| 1 文献综述 | 第11-25页 |
| 1.1 甜瓜的特性 | 第11-13页 |
| 1.1.1 甜瓜的起源与分类 | 第11页 |
| 1.1.2 我国甜瓜栽培概况 | 第11页 |
| 1.1.3 甜瓜的营养价值 | 第11-12页 |
| 1.1.4 甜瓜果实发育 | 第12-13页 |
| 1.2 分子标记 | 第13-17页 |
| 1.2.1 基因组SSR开发和应用 | 第14-15页 |
| 1.2.2 转录组SSR的开发应用 | 第15-16页 |
| 1.2.3 SNP分子标记技术及应用 | 第16-17页 |
| 1.3 甜瓜果实性状遗传研究进展 | 第17-19页 |
| 1.3.1 甜瓜果实性状的遗传研究 | 第17页 |
| 1.3.2 果实QTL的研究进展 | 第17-19页 |
| 1.4 关联分析 | 第19-23页 |
| 1.4.1 关联分析的原理和方法 | 第19页 |
| 1.4.2 连锁不平衡 | 第19-22页 |
| 1.4.3 关联分析在植物中的研究情况 | 第22-23页 |
| 1.5 研究目的和技术路线 | 第23-25页 |
| 1.5.1 本研究的目的意义 | 第23-24页 |
| 1.5.2 技术路线 | 第24-25页 |
| 2 引言 | 第25-26页 |
| 3 材料与方法 | 第26-34页 |
| 3.1 植物材料 | 第26页 |
| 3.2 田间试验与表型性状调查 | 第26-27页 |
| 3.2.1 育苗、定植和田间管理 | 第26页 |
| 3.2.2 果实性状的调查 | 第26页 |
| 3.2.3 甜瓜果实性状变异分析 | 第26-27页 |
| 3.3 DNA提取与检测 | 第27-29页 |
| 3.3.1 DNA的提取 | 第27页 |
| 3.3.2 DNA的检测 | 第27-29页 |
| 3.4 SSR标记全基因组扫描 | 第29-30页 |
| 3.4.1 引物的开发与筛选 | 第29页 |
| 3.4.2 PCR反应条件的确定 | 第29-30页 |
| 3.4.3 聚丙烯酰胺凝胶的制备及电泳 | 第30页 |
| 3.5 SSR标记的遗传多样性分析 | 第30-32页 |
| 3.5.1 分子标记数据统计 | 第30页 |
| 3.5.2 SSR分子标记数据分析 | 第30-31页 |
| 3.5.3 群体结构分析 | 第31页 |
| 3.5.4 亲缘关系分析 | 第31页 |
| 3.5.5 聚类分析 | 第31-32页 |
| 3.5.6 主坐标分析 | 第32页 |
| 3.6 果实性状与SSR标记的全基因组关联分析 | 第32-33页 |
| 3.6.1 LD分析 | 第32页 |
| 3.6.2 果实性状与SSR标记的关联分析 | 第32-33页 |
| 3.7 优异等位变异的发掘 | 第33-34页 |
| 4 结果与分析 | 第34-59页 |
| 4.1 甜瓜果实性状变异性分析 | 第34-37页 |
| 4.1.1 质量性状多样性分析 | 第34页 |
| 4.1.2 数量性状多样性分析 | 第34-37页 |
| 4.2 分子标记多样性分析 | 第37-39页 |
| 4.3 群体结构分析 | 第39-41页 |
| 4.4 亲缘关系分析 | 第41页 |
| 4.5 分子标记聚类和主坐标分析 | 第41-43页 |
| 4.5.1 分子标记聚类分析 | 第41-43页 |
| 4.5.2 主坐标分析 | 第43页 |
| 4.6 连锁不平衡分析 | 第43-45页 |
| 4.7 单标记性状关联扫描结果 | 第45-50页 |
| 4.7.1 GLM模型分析结果 | 第45-48页 |
| 4.7.2 加入亲缘关系控制的MLM模型分析 | 第48-50页 |
| 4.8 不同模型的比较 | 第50-51页 |
| 4.9 优异等位基因的发掘 | 第51-59页 |
| 4.9.1 初选等位变异 | 第51-52页 |
| 4.9.2 初选等位基因的表型值差异显著性分析 | 第52-56页 |
| 4.9.3 优异等位基因的效应及载体材料 | 第56-59页 |
| 5 结论与讨论 | 第59-68页 |
| 5.1 结论 | 第59-60页 |
| 5.1.1 甜瓜种质果实性状多样性和SSR扩增多态性 | 第59页 |
| 5.1.2 群体结构、亲缘关系和主坐标分析 | 第59页 |
| 5.1.3 甜瓜基因组连锁不平衡和关联分析 | 第59页 |
| 5.1.4 优异等位位点的发掘 | 第59-60页 |
| 5.2 讨论 | 第60-66页 |
| 5.2.1 甜瓜染色体组连锁不平衡 | 第60-61页 |
| 5.2.2 不同检测模型的比较 | 第61页 |
| 5.2.3 关联位点及其应用 | 第61-65页 |
| 5.2.4 核心种质在关联分析中的应用 | 第65-66页 |
| 5.3 问题和展望 | 第66-68页 |
| 5.3.1 问题和改进 | 第66-67页 |
| 5.3.2 展望 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-79页 |
| 附录 1：192份甜瓜材料来源 | 第79-82页 |
| 附录 2：典型种质果实图片 | 第82-83页 |
| 作者在读期间发表的学术论文 | 第83-84页 |
| ABSTRACT | 第84-86页 |