HIF1A基因对高原高血压影响因素研究
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-11页 |
| ·高原高血压及其研究重要性 | 第8页 |
| ·高原高血压研究进展 | 第8-9页 |
| ·本论文主要研究内容 | 第9-11页 |
| 第二章 生物信息学与高通量测序 | 第11-20页 |
| ·生物数据和生物数据库 | 第11-13页 |
| ·生物数据 | 第11页 |
| ·生物数据中心和数据库 | 第11-12页 |
| ·生物学数据库的应用 | 第12-13页 |
| ·高通量测序技术 | 第13-15页 |
| ·高通量测序技术的应用 | 第14页 |
| ·高通量测序与生物信息学 | 第14-15页 |
| ·生物信息学相关软件、工具和分析平台 | 第15-19页 |
| ·biolinux系统平台 | 第15-16页 |
| ·数据处理分析程序及编程语言 | 第16-17页 |
| ·可视化分析平台 | 第17-19页 |
| ·本章小结 | 第19-20页 |
| 第三章 Biomart数据分析平台构建及应用 | 第20-32页 |
| ·Ensembl数据库与biomart | 第20-21页 |
| ·Biomart平台搭建 | 第21-29页 |
| ·基本搭建流程 | 第21页 |
| ·虚拟机的安装配置 | 第21-23页 |
| ·JAVA环境搭建 | 第23-24页 |
| ·biomart平台搭建 | 第24-29页 |
| ·BioMart检索方法及过程 | 第29-31页 |
| ·本章小结 | 第31-32页 |
| 第四章 HIF1A的基因组结合位点分析 | 第32-47页 |
| ·HIF1A基因和SNP研究发展 | 第32-33页 |
| ·ChiP-Seq技术进展 | 第33页 |
| ·分析工具介绍 | 第33-34页 |
| ·序列比对工具bowtie | 第33-34页 |
| ·软件SIPeS | 第34页 |
| ·数据来源 | 第34-36页 |
| ·分析过程 | 第36-41页 |
| ·数据的预处理 | 第36-39页 |
| ·序列比对 | 第39-40页 |
| ·构建分析数据的片段模型 | 第40-41页 |
| ·SIPeS数据处理 | 第41页 |
| ·结果与分析 | 第41-45页 |
| ·序列比对基因组长度计算 | 第41-42页 |
| ·SIPeS分析 | 第42-45页 |
| ·本章小结 | 第45-47页 |
| 第五章 总结与展望 | 第47-49页 |
| ·总结 | 第47-48页 |
| ·展望 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-53页 |
| 致谢 | 第53-54页 |
| 个人简历 | 第54-55页 |
| 攻读硕士学位期间的学术论文 | 第55页 |
