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野鸭源H6N1亚型禽流感病毒分子生物学特征研究及其进化分析

摘要第1-5页
Abstract第5-8页
1 绪论第8-19页
   ·课题背景第8页
   ·禽流感病毒的病原学研究第8-15页
     ·禽流感病毒的分类及主要特征第8-9页
     ·禽流感病毒基因组及其编码的蛋白质功能第9-13页
     ·禽流感病毒的理化性质第13页
     ·禽流感病毒的致病力第13-14页
     ·禽流感病毒的抗原变异第14-15页
   ·野生鸟类在禽流感病毒传播和进化中的作用第15-18页
     ·野生鸟类禽流感病毒进化特点第15页
     ·野生鸟类对禽流感病毒的传播第15-16页
     ·野生鸟类感染高致病性禽流感病毒情况第16-17页
     ·野生鸟类禽流感病毒疫情监测第17-18页
   ·本课题研究的目的和意义第18-19页
2 材料和方法第19-25页
   ·实验材料第19-21页
     ·病毒第19页
     ·主要实验用品第19页
     ·主要实验仪器第19-20页
     ·特异性扩增引物第20页
     ·主要实验材料的制备第20-21页
   ·实验方法第21-25页
     ·病毒的分离及初步鉴定第21-22页
     ·病毒核酸的提取及其反转录第22页
     ·病毒全基因序列PCR扩增第22页
     ·PCR产物回收纯化第22-23页
     ·连接转化以及细菌的培养第23页
     ·单克隆的制备以及菌液PCR鉴定第23-24页
     ·基因序列测定及分析第24-25页
3 实验结果与分析第25-53页
   ·RT-PCR电泳检测结果第25-27页
   ·核昔酸及其推导的氨基酸序列第27-36页
   ·核昔酸序列同源性比对第36-45页
   ·遗传进化分析第45-50页
   ·HA基因序列分析第50-51页
     ·裂解为点分析第50页
     ·可能存在的受体结合位点分析第50页
     ·潜在糖基化位点分析第50-51页
   ·五株H6NI亚型流感病毒NA基因序列分析第51-53页
     ·NA基因颈部氨基酸缺失情况分析第51页
     ·NA基因氨基酸抗原位点分析第51-52页
     ·NA基因氨基酸糖基化位点分析第52-53页
4 讨论第53-59页
   ·A/mallard/Sanjiang/380/2007(H6N1)毒株基因序列特殊位点分析第53-55页
   ·五株野鸭源H6N1亚型NA基因序列特殊位点分析第55-56页
   ·A/mallard/Sanjiang/380/2007(H6N1)毒株基因同源性比对及进化分析第56-57页
   ·五株野鸭源H6N1亚型流感病毒NA基因同源性比对及进化分析第57-59页
5 结论第59-60页
6 参考文献第60-65页
7 附录第65-66页
8 攻读学位期间发表的学术论文第66-67页
9 致谢第67-68页

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