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GRASP蛋白介导的高尔基体堆叠机制及内吞作用蛋白SGIP1的结构生物学研究

摘要第1-7页
Abstract第7-13页
第一章 引言(第一部分)第13-30页
 第一节 高尔基体的形态结构与功能第13-15页
     ·高尔基体顺面膜囊结构(cis Golgi network,CGN)第14页
     ·高尔基体中间膜囊结构(medial Golgi network)第14页
     ·高尔基体反面膜囊结构(trans Golginetwork,TGN)第14页
     ·高尔基体周围大小不同的囊泡第14-15页
 第二节 高尔基体相关的基质蛋白第15-17页
 第三节 GRASP家族蛋白的发现第17-18页
 第四节 GRASP55和GRASP65能够形成同源二聚体第18-19页
 第五节 GRASP55和GRASP65在高尔基体堆叠过程中的作用第19-21页
 第六节 GRASP蛋白C端的SPR结构域可以被磷酸化调节第21-23页
 第七节 有丝分裂过程中GRASP蛋白参与高尔基体的形态学变化第23-25页
 第八节 BFA处理能够可逆的改变高尔基体的形态第25-26页
 第九节 GRASP55和GRASP65其他研究进展第26-29页
     ·GRASP蛋白参与非常规途径下物质运输第26-27页
     ·GRASP蛋白与细胞凋亡第27-29页
 第十节 本课题的主要研究内容及意义第29-30页
第二章 实验材料与原理第30-56页
 第一节 实验材料第30-35页
     ·实验仪器第30-31页
     ·实验试剂第31-32页
     ·实验室所用菌株或细胞系第32页
     ·实验试剂配制第32-35页
 第二节 实验方法第35-56页
     ·GRASP55全长与GRASP55_N215的原核表达载体构建第35-38页
     ·重组蛋白质的表达系统简介第38-40页
     ·GRASP55蛋白在大肠杆菌中的表达第40-41页
     ·蛋白的纯化方法简介第41-44页
     ·GRASP55蛋白的纯化第44-45页
     ·X-射线晶体学简介(X-ray crystallography)第45-52页
     ·GRASP蛋白的定点突变第52-53页
     ·细胞学实验第53-54页
     ·EGS-Crosslink化学交联实验第54页
     ·聚丙烯酰胺凝胶电泳第54-55页
     ·Western Blotting分析第55-56页
第三章 结果与分析第56-88页
 第一节 GRASP55全长的克隆与表达第56-57页
 第二节 GRASP55全长的二级结构预测及目的片段的截短第57-59页
 第三节 GRASP55_N215的克隆,表达和纯化第59-61页
 第四节 GRASP55_N215的晶体生长第61-63页
 第五节 GRASP55_N215的数据收集第63-65页
 第六节 GRASP55_N215的硒代甲硫氨酸置换体的晶体生长与数据处理第65-69页
 第七节 GRASP55_N215的结构解析第69-72页
 第八节 GRASP55_N215的结构及分析第72-73页
 第九节 GRASP55_N215与分子置换模型3RLE的比较第73-74页
 第十节 GRASP55_N215与GRASP65_N210的结构对比第74-76页
 第十一节 基于晶体结构基础的GRASP蛋白聚集因素第76-85页
     ·GRASP domain的PDZ2-PDZ2相互作用第76-79页
     ·GRASP蛋白C-Terminal tail内部配体的插入作用第79-83页
     ·GRASP65_N210与GRASP_N228的聚集超速离心分析第83-85页
 第十二节 基于GRASP55/GRASP65的高尔基体堆叠模型第85-88页
第四章 引言(第二部分)第88-103页
 第一节 细胞生命活动中的内吞作用第88-89页
 第二节 有被小泡介导的细胞内物质运输第89-91页
 第三节 囊泡运输中的一些关键因子第91-92页
 第四节 囊泡运输中的衔接蛋白复合物第92-94页
 第五节 SGIP1在内吞过程中的作用第94-99页
     ·SGIP1参与组织细胞能量代谢平衡第94-95页
     ·SGIP1能与内质网分子伴侣Calnexin相互作用第95-96页
     ·SGIP1能与EPS15相互作用第96-97页
     ·SGIP1能与ITSN1相互作用第97-98页
     ·SGIP1的旁系同源蛋白Fcho1研究现状第98-99页
 第六节 μHD domain相关研究进展第99-102页
     ·AP-2 Complex中μ2亚基的结构生物学研究第99-100页
     ·酵母同源蛋白Syp1的μHD domain结构生物学研究第100-102页
 第七节 本实验研究内容及意义第102-103页
第五章 实验材料和方法第103-109页
 第一节 SGIP1基因的分子克隆第103-105页
     ·SGIP1基因全长cDNA的获取第103-104页
     ·体外DNA片段的PCR扩增、连接及转化第104-105页
 第二节 SGIP1目的蛋白表达、纯化及晶体生长第105页
 第三节 硒代甲硫氨酸标记的SGIP1蛋白的表达与纯化第105-106页
 第四节 反常散射法寻找相位第106-107页
 第五节 分析型超速离心实验第107页
 第六节 激光扫描共聚焦实验第107-109页
第六章 结果与分析第109-129页
 第一节 μHD domain的二级结构预测及克隆第109-110页
 第二节 SGIP1 μHD domain的表达纯化第110-112页
 第三节 晶体生长及数据收集第112-115页
 第四节 SGIP1 μHD domain硒代甲硫氨酸置换体的表达纯化、晶体生长及数据收集第115-119页
 第五节 SGIP1 μHD domain的结构解析第119-123页
 第六节 SGIP1 μHD domain的结构分析第123-126页
     ·SGIP1 μHD domain与Syp1 μHD domain的结构比较第124页
     ·SGIP1 μHD domain与AP-2 Complex中μ2亚基的结构比较第124-126页
 第七节 SGIP1在溶液中的聚集状态分析第126-127页
 第八节 SGIP1在细胞内的定位第127-129页
第七章 结论第129-131页
 第一部分 结论第129-130页
 第二部分 结论第130-131页
参考文献第131-139页
致谢第139页

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