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香蕉枯萎病区土壤微生物多样性研究

摘要第1-7页
Abstract第7-15页
1 绪论第15-29页
   ·香蕉枯萎病发生及其防治研究概况第15-17页
     ·香蕉枯萎病的化学防治第15-16页
     ·香蕉枯萎病的生物防治第16页
     ·抗病育种第16-17页
     ·其他防治措施第17页
   ·土壤因子对土传病害影响的研究进展第17-18页
   ·土壤微生物多样性研究进展第18-26页
     ·土壤微生物多样性的科学内涵第18页
     ·土壤微生物多样性与土传病害的关系第18-19页
     ·土壤微生物多样性影响因素第19-22页
       ·土壤条件第20页
       ·植被第20页
       ·农药第20-21页
       ·施肥第21-22页
       ·土地耕作方式第22页
     ·土壤微生物多样性的评价方法第22-26页
       ·微生物平板计数法第23页
       ·Biolog微平板法第23-24页
       ·磷脂脂肪酸方法(PLFA)第24-25页
       ·现代分子生物学方法第25-26页
   ·本课题研究背景与研究意义第26-28页
   ·主要研究内容及技术路线第28页
   ·创新点第28-29页
2 材料与方法第29-39页
   ·材料第29-32页
     ·供试土样第29-30页
     ·供试培养基第30-31页
       ·可培养微生物分离所用培养基第30-31页
       ·Biolog-ECO微平板碳源种类第31页
       ·构建细菌16S rDNA克隆文库所用培养基第31页
     ·供试试剂第31页
     ·菌株与载体第31页
     ·PCR引物第31-32页
   ·方法第32-37页
     ·土壤因子测定方法第32页
     ·土壤可培养微生物分离、计数方法第32-33页
     ·土壤可培养微生物鉴定方法第33页
     ·土壤微生物群落功能多样性研究方法第33-34页
     ·细菌遗传多样性研究方法第34-37页
       ·土壤总DNA的提取第34页
       ·细菌16S rDNA PCR扩增第34-35页
       ·PCR产物的纯化第35页
       ·连接反应第35页
       ·转化第35-36页
       ·16S rDNA克隆文库构建第36页
       ·菌落PCR扩增第36页
       ·16S rDNA扩增片段的限制性酶切分析第36-37页
       ·DNA序列测定第37页
       ·16S rDNA的系统发育分析第37页
   ·数据处理与统计方法第37-38页
     ·土壤因子与微生物物种多样性数据处理与统计方法第37页
     ·微生物功能多样性数据处理与统计方法第37-38页
     ·细菌遗传多样性数据处理与统计方法第38页
   ·主要仪器设备第38-39页
3 结果与分析第39-93页
   ·香蕉枯萎病区土壤理化因子分析第39-44页
     ·患病样地与健康样地土壤理化因子分析第39页
     ·患病样地中不同感病级别土壤理化因子分析第39-41页
     ·根际与非根际土壤理化因子分析第41页
     ·土壤因子聚类分析第41-44页
   ·香蕉枯萎病区土壤微生物物种多样性分析第44-62页
     ·枯萎病区可培养微生物数量第44-52页
       ·患病样地与健康样地可培养微生物数量第44-46页
       ·患病样地中不同感病级别土壤可培养微生物数量第46-50页
       ·根际土壤与非根际土壤可培养微生物数量第50-51页
       ·可培养微生物数量的聚类分析与MDS排序分析第51-52页
     ·枯萎病区可培养微生物种类第52-60页
       ·患病样地与健康样地可培养微生物种类第52-54页
       ·患病样地不同感病级别土壤可培养微生物种类第54-58页
       ·根际土壤与非根际土壤可培养微生物种类第58页
       ·可培养微生物类群的聚类分析与MDS排序分析第58-60页
     ·土壤因子与蕉园土壤可培养微生物群落结构的相关性第60-62页
   ·香蕉枯萎病区土壤微生物功能多样性分析第62-77页
     ·枯萎病区土壤微生物利用全部碳源的动力学特征第62-63页
       ·患病样地与健康样地土壤微生物利用全部碳源的动力学特征第62页
       ·患病样地中不同感病级别土壤微生物利用全部碳源的动力学特征第62-63页
     ·枯萎病区土壤微生物对不同碳源的利用强度第63-68页
       ·患病样地与健康样地土壤微生物对不同碳源的利用强度第63-65页
       ·患病样地中不同感病级别土壤微生物对不同碳源的利用强度第65-68页
     ·枯萎病区土壤微生物群落碳源利用的主成分分析第68-73页
       ·患病样地与健康样地土壤微生物群落碳源利用的主成分分析第68-70页
       ·患病样地中不同感病级别土壤微生物群落碳源利用的主成分分析第70-73页
     ·枯萎病区土壤微生物利用碳源的多样性指数第73-75页
       ·患病样地与健康样地土壤微生物群落多样性指数第73-74页
       ·患病样地中不同感病级别土壤微生物群落多样性指数第74-75页
     ·土壤因子与微生物功能多样性的相关性分析第75-77页
   ·香蕉枯萎病区土壤细菌遗传多样性分析第77-93页
     ·细菌16S rDNA序列扩增第77页
     ·细菌16S rDNA克隆文库构建第77页
     ·细菌16S rDNA扩增片段的限制性酶切分析第77-79页
     ·患病样地与健康样地土壤细菌多样性及其系统发育分析第79-88页
       ·患病样地与健康样地细菌16S rRNA基因文库多样性指数第79-80页
       ·患病样地与健康样地土壤细菌16S rRNA基因文库系统发育分析第80-87页
       ·不同样地细菌群落相似性比较第87-88页
     ·患病样地不同感病级别土壤细菌多样性与系统发育分析第88-93页
       ·发病土和健康土细菌16S rRNA基因文库多样性指数第88-89页
       ·健康土和发病土细菌16S rRNA基因文库系统发育分析第89-93页
4 讨论第93-101页
   ·香蕉枯萎病发生与土壤因子的相关性第93-94页
     ·香蕉根际与非根际土壤理化特性比较第93页
     ·枯萎病患病与土壤因子的相关性第93-94页
   ·香蕉枯萎病发生与土壤微生物多样性的相关性第94-99页
     ·枯萎病患病与土壤微生物物种多样性的相关性第94-96页
       ·枯萎病患病程度与可培养微生物数量的相关性第95页
       ·枯萎病患病程度与可培养微生物类群的相关性第95-96页
     ·枯萎病发生与土壤微生物群落功能多样性的相关性第96-98页
       ·枯萎病患病程度与土壤微生物群落代谢活性的相关性第96页
       ·枯萎病患病程度与土壤微生物群落对6类碳源利用强度的相关性第96-97页
       ·枯萎病患病程度与土壤微生物群落功能多样性指数的相关性第97-98页
     ·枯萎病发生与土壤细菌遗传多样性的相关性第98-99页
       ·枯萎病患病程度与土壤16S rDNA细菌多样性指数的相关性第98页
       ·枯萎病患病程度与土壤细菌群落结构的相关性第98-99页
   ·土壤因子与土壤微生物多样性的相关性第99-100页
   ·三种研究方法结果的比较第100-101页
   ·问题与展望第101页
5 结论第101-103页
参考文献第103-120页
附录第120-140页
 附表1 Biolog-ECO板31种碳源组成及其分子式第120-121页
 附表2 尖峰样地不同感病级别根际与非根际土壤养分含量第121-122页
 附表3 十月田样地不同感病级别根际与非根际土壤养分含量第122-123页
 附表4 冲坡样地不同感病级别根际与非根际土壤养分含量第123-124页
 附表5 五个样地根际与非根际土壤可培养微生物数量第124-125页
 附表6 五个样地根际与非根际土壤可培养细菌种类第125-127页
 附表7 五个样地根际与非根际土壤可培养放线菌种类第127-129页
 附表8 五个样地根际与非根际可培养真菌种类第129-131页
 附表9 五个样地可培养微生物菌株鉴定结果第131-133页
 附图1 尖峰样地16S rRNA基因克隆文库系统发育树第133-134页
 附图2 十月田样地细菌16S rRNA基因克隆文库系统发育树第134-135页
 附图3 冲坡样地细菌16S rRNA基因克隆文库系统发育树第135-136页
 附图4 临高样地细菌1 6S rRNA基因克隆文库系统发育树第136-137页
 附图5 广州样地16S rRNA基因克隆文库系统发育树第137-138页
 附图6 健康土细菌16S rRNA基因克隆文库系统发育树第138-139页
 附图7 发病土细菌16S rRNA基因克隆文库系统发育树第139-140页
致谢第140页

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