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番茄VKOR基因的克隆、生物信息学分析及功能初步研究

符号说明第1-9页
中文摘要第9-11页
Abstract第11-13页
1 前言第13-22页
   ·原核生物催化二硫键形成的酶系统第13-14页
   ·真核细胞细胞器催化二硫键形成的酶学系统第14-17页
     ·真核生物内质网内催化二硫键形成的酶学系统第14-15页
     ·真核生物线粒体内催化二硫键形成的酶学系统第15-17页
   ·维生素 K 环氧化物还原酶的研究第17-19页
     ·动物维生素 K 环氧化物还原酶的研究第17页
     ·微生物维生素 K 环氧化物还原酶的研究第17-18页
     ·植物维生素 K 环氧化物还原酶的研究第18-19页
   ·叶绿体内的氧化折叠的研究进展第19-20页
   ·本实验的目的意义第20-22页
2 材料与方法第22-44页
   ·实验材料第22-23页
     ·植物材料第22页
     ·菌株与质粒第22页
     ·酶与各种生化试剂第22-23页
     ·引物第23页
   ·主要试剂的配制第23-27页
     ·实验相关试剂溶液的配制第23-26页
       ·CTAB 法提取植物 DNA 提取液的配制第23-24页
       ·碱法大提质粒相关试剂的配制第24页
       ·LeVKOR 功能鉴定相关试剂的配制第24-25页
       ·MS 培养基母液的配制第25页
       ·5×M63 储存液的配制第25-26页
     ·实验所需培养基的配制第26-27页
       ·LB 培养基第26页
       ·MS 培养基第26页
       ·M63 培养基第26-27页
   ·实验方法第27-44页
     ·番茄 VKOR 基因的扩增、克隆及序列测定第27-31页
       ·番茄 VKOR 基因的引物设计第27页
       ·PCR 扩增第27页
       ·PCR 扩增产物的胶回收第27-28页
       ·胶回收产物与 pMD18-T simple 载体连接第28页
       ·大肠杆菌感受态 DHB4 的制备第28-29页
       ·连接产物转化 DHB4 感受态细胞第29页
       ·阳性克隆的筛选第29-31页
     ·用 RACE 方法扩增番茄全长基因第31-32页
       ·内外侧引物的设计第31页
       ·用 RACE 扩番茄 VKOR 3′端序列第31-32页
       ·用全长引物扩番茄 VKOR 全长第32页
     ·番茄 VKOR 基因生物信息学分析第32-33页
     ·原核表达载体的构建第33-34页
       ·番茄 VKOR 基因全长的扩增第33页
       ·目的片段和表达载体 pTrc99a 的双酶切第33页
       ·目的片段与质粒酶切胶回收产物连接第33-34页
     ·植物表达载体的构建第34-35页
       ·碱法大量提取载体 pBI121 质粒第34-35页
       ·正义表达载体的构建第35页
       ·反义表达载体的构建第35页
     ·农杆菌介导的番茄遗传转化体系的建立第35-37页
       ·根癌农杆菌 LBA4404 感受态细胞的制备与转化第35-36页
       ·农杆菌介导的转化番茄第36-37页
     ·转基因植株的筛选第37页
       ·植物基因组 DNA 的提取(CTAB 法)第37页
       ·转基因植株的 PCR 筛选第37页
     ·转基因植株 RNA 水平表达量检测第37-39页
       ·TRIZOL 法提取植物 RNA第37-38页
       ·RNA 的反转录第38页
       ·实时定量 PCR第38-39页
     ·转基因植株蛋白水平表达量检测第39-42页
       ·植物类囊体蛋白的提取第39-40页
       ·聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)第40-41页
       ·半干式转膜(PVDF 膜)第41页
       ·免疫检测第41-42页
       ·ECL 发光底物第42页
     ·H_2O_2与 O_2~—染色分析第42页
     ·催化二硫键形成功能的方法第42-44页
       ·Motility 方法检测第42-43页
       ·X-gal 方法检测第43-44页
3 结果与分析第44-58页
   ·番茄 VKOR 基因全长的克隆第44-47页
     ·克隆 NCBI 数据库中番茄 VKOR 序列第44页
     ·番茄 VKOR 序列分析第44-45页
     ·RACE 扩增番茄 VKOR 3′端序列第45-46页
     ·番茄 VKOR 基因全长克隆第46页
     ·番茄 VKOR 基因全长序列分析第46-47页
   ·植物 VKOR 生物信息学分析第47-52页
     ·LeVKOR 信号肽及亚细胞定位的预测第47-49页
       ·软件预测 LeVKOR 的信号肽及亚细胞定位第47-48页
       ·免疫印迹实验证明 LeVKOR 定位于叶绿体的类囊体上第48页
       ·植物 VKOR 信号肽及亚细胞定位的预测第48-49页
     ·LeVKOR 高级结构的预测第49-50页
     ·LeVKOR 与植物 VKOR 的氨基酸序列分析第50-52页
     ·LeVKOR 与植物 VKOR 的进化树分析第52页
   ·LeVKOR 基因在大肠杆菌中进行功能的研究第52-53页
     ·LeVKOR 能够弥补大肠杆菌缺陷型菌株二硫键的形成第52-53页
   ·LeVKOR 基因在番茄中的遗传转化第53-56页
     ·LeVKOR 正义、反义和干涉表达载体的构建第53-55页
       ·LeVKOR 正义表达载体的构建第53页
       ·LeVKOR 反义表达载体的构建第53-54页
       ·LeVKOR 干涉表达载体的构建第54-55页
     ·LeVKOR 转基因番茄遗传转化再生体系的建立第55-56页
   ·LeVKOR 基因在正义反义转基因番茄中表达分析第56-57页
     ·LeVKOR 转基因植株 RNA 水平表达分析第56-57页
   ·LeVKOR 基因在正义反义转基因番茄中活性氧积累分析第57-58页
4 讨论第58-61页
5 结论第61-62页
参考文献第62-68页
致谢第68页

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