| 目录 | 第1-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 缩略词表 | 第11-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-38页 |
| 第一节 药用植物转录组学的研究进展 | 第13-21页 |
| ·转录组学的概念 | 第13页 |
| ·药用植物转录组学的研究意义 | 第13-14页 |
| ·转录组学的研究方法 | 第14-15页 |
| ·高通量测序技术的发展及在药用植物转录组学研究中的应用 | 第15-21页 |
| 第二节 基于转录组学的药用植物次生代谢物生物合成途径研究进展 | 第21-24页 |
| ·药用植物次生代谢物的生物合成途径 | 第21-23页 |
| ·药用植物次生代谢物的获取途径 | 第23-24页 |
| ·转录组学在药用植物次生代谢物生物合成途径中的应用 | 第24页 |
| 第三节 石斛属生物碱的研究进展 | 第24-26页 |
| ·石斛生物碱的分类及其结构 | 第25页 |
| ·石斛生物碱的含量 | 第25-26页 |
| ·石斛生物碱的药理作用 | 第26页 |
| 第四节 人参属植物人参皂苷生物合成途径相关基因的研究进展 | 第26-28页 |
| ·人参皂苷的生物合成途径及相关酶基因的研究 | 第26-27页 |
| ·转录组学在人参皂苷生物合成途径中的应用 | 第27-28页 |
| 第五节 本研究的目的和意义 | 第28-30页 |
| ·药用植物转录组研究的目的与意义 | 第29页 |
| ·人参皂苷生物合成途径酶基因的克隆及分析的目的与意义 | 第29-30页 |
| 参考文献 | 第30-38页 |
| 第二章 铁皮石斛转录组测序、石斛生物碱生物合成途径基因的发掘及分子标记的研究 | 第38-74页 |
| 第一节 研究背景 | 第38-42页 |
| 第二节 材料与方法 | 第42-50页 |
| ·材料、试剂与方法 | 第42页 |
| ·实验方法 | 第42-50页 |
| 第三节 结果与分析 | 第50-69页 |
| ·RNA的提取和454转录组文库的构建 | 第50-51页 |
| ·454测序和EST拼接 | 第51-54页 |
| ·铁皮石斛茎转录组的功能注释与功能分类 | 第54-57页 |
| ·铁皮石斛茎转录组的代谢途径分析 | 第57-59页 |
| ·铁皮石斛生物碱生物合成和转运相关的候选基因 | 第59-66页 |
| ·铁皮石斛茎转录组中SSR的分布特征 | 第66-69页 |
| 第四节 讨论 | 第69-72页 |
| ·铁皮石斛转录组测序与功能注释 | 第69-70页 |
| ·铁皮石斛生物碱合成相关基因的大量发掘与分析 | 第70-71页 |
| ·铁皮石斛转录组中SSR位点的分布特征 | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-74页 |
| 第三章 人参转录组测序、人参皂苷生物合成途径基因的发掘、microRNAs和SSR分子标记的研究 | 第74-96页 |
| 第一节 研究背景 | 第74-76页 |
| 第二节 材料与方法 | 第76-78页 |
| ·材料、试剂与仪器 | 第76-77页 |
| ·实验方法 | 第77-78页 |
| 第三节 结果与分析 | 第78-92页 |
| ·RNA的提取和454转录组文库的构建 | 第78-80页 |
| ·454测序和ESTs拼接 | 第80-81页 |
| ·人参皂苷生物合成途径中功能基因的注释和挖掘 | 第81-87页 |
| ·人参根、茎、叶、花独立基因数目的比较和分类 | 第87-88页 |
| ·人参中miRNA的预测 | 第88-91页 |
| ·人参转录组中SSR的分布特征 | 第91-92页 |
| 第四节 讨论 | 第92-94页 |
| ·四年生人参转录组文库的构建及与其他人参属植物转录组的比较 | 第92-93页 |
| ·高通量测序对miRNA研究的推动 | 第93-94页 |
| ·人参转录组中SSR位点的分布特性 | 第94页 |
| 参考文献 | 第94-96页 |
| 第四章 三七中人参皂苷生物合成途径基因克隆、分析与表达 | 第96-124页 |
| 第一节 研究背景 | 第96-97页 |
| 第二节 材料与方法 | 第97-106页 |
| ·实验材料 | 第97页 |
| ·实验方法 | 第97-106页 |
| 第三节 结果与分析 | 第106-120页 |
| ·三七甲羟戊酸激酶PnMVK1基因的克隆和生物信息学分析 | 第106-111页 |
| ·三七糖基转移酶PnUGT02086和PnUGT13895基因的克隆、生物信息学分析和蛋白表达 | 第111-120页 |
| 第四节 讨论 | 第120-121页 |
| ·生物信息学在功能基因分析上的运用 | 第120页 |
| ·功能基因的组织特异性表达 | 第120-121页 |
| ·糖基转移酶PnUGT02086和PnUGT13895的原核表达 | 第121页 |
| 参考文献 | 第121-124页 |
| 附录 | 第124-134页 |
| 致谢 | 第134-135页 |
| 个人简历 | 第135-136页 |
