北冰洋深海放线菌次生代谢基因与抗菌活性筛查及其产物分离研究
| 目录 | 第1-7页 |
| CONTENTS | 第7-11页 |
| 摘要 | 第11-13页 |
| ABSTRACT | 第13-15页 |
| 1 前言 | 第15-25页 |
| ·海洋放线菌是天然活性产物的重要来源 | 第15-16页 |
| ·放线菌次级代谢产物 | 第16-18页 |
| ·大环内酯类 | 第16页 |
| ·肽类 | 第16-17页 |
| ·生物碱 | 第17页 |
| ·醌类 | 第17页 |
| ·萜类 | 第17-18页 |
| ·聚酮类 | 第18页 |
| ·放线菌次级代谢产物合成途径 | 第18-20页 |
| ·北冰洋放线菌及次生代谢研究进展 | 第20-21页 |
| ·本文研究方法 | 第21-23页 |
| ·BOX-PCR基因指纹分析 | 第21-22页 |
| ·基因的PCR筛选策略 | 第22-23页 |
| ·本论文研究路线 | 第23页 |
| ·科学技术价值、创新点及难点 | 第23-25页 |
| ·科学技术价值 | 第23-24页 |
| ·创新点 | 第24页 |
| ·难点 | 第24-25页 |
| 2 研究方法 | 第25-45页 |
| ·菌株信息 | 第25-26页 |
| ·材料和仪器 | 第26-28页 |
| ·培养基 | 第26页 |
| ·试剂 | 第26-27页 |
| ·仪器 | 第27-28页 |
| ·BOX-PCR产物的核酸分离和基因图谱分析 | 第28-29页 |
| ·引物 | 第28页 |
| ·PCR反应 | 第28页 |
| ·BOX-PCR产物的琼脂糖凝胶电泳及图谱分析 | 第28-29页 |
| ·16SrRNA基因扩增及系统发育树分析 | 第29-30页 |
| ·基因组DNA提取及检测 | 第29页 |
| ·16SrRNA基因扩增 | 第29-30页 |
| ·PCR产物检测 | 第30页 |
| ·PCR产物纯化 | 第30页 |
| ·16SrRNA基因序列测序及聚类分析 | 第30页 |
| ·7种次级代谢产物合成酶基因的PCR筛选 | 第30-35页 |
| ·KS结构域的克降及分析 | 第35-38页 |
| ·KS结构域的PCR扩增 | 第35页 |
| ·PCR产物检测及纯化 | 第35页 |
| ·PCR产物与T载体连接 | 第35-36页 |
| ·转化 | 第36页 |
| ·蓝白斑筛选 | 第36-37页 |
| ·PCR检测 | 第37页 |
| ·序列测序及聚类分析 | 第37-38页 |
| ·抗菌活性测定 | 第38-39页 |
| ·564F菌株的发酵 | 第39-40页 |
| ·564F发酵产物的提取分离 | 第40-45页 |
| ·564F发酵产物的提取 | 第40页 |
| ·564F发酵产物的分离 | 第40-45页 |
| 3 结果 | 第45-73页 |
| ·菌株排重 | 第45-46页 |
| ·菌株的物种多样性分析 | 第46-51页 |
| ·评价菌株产生多样次级代谢产物的潜力 | 第51-61页 |
| ·次级代谢产物酶基因的PCR筛选 | 第51-53页 |
| ·KS氨基酸序列的分析 | 第53-61页 |
| ·抗菌活性测定 | 第61-64页 |
| ·潜力菌株的选择 | 第64页 |
| ·564F菌株次级代谢产物分离 | 第64-73页 |
| 4 讨论 | 第73-81页 |
| ·BOX-PCR是菌株排重的优质方法 | 第73页 |
| ·链霉菌是深海沉积物放线菌的优势菌 | 第73-74页 |
| ·次生代谢基因筛选、活性筛选及化学筛选模式 | 第74-76页 |
| ·水平基因转移(HGT) | 第76-77页 |
| ·展望 | 第77-81页 |
| 5 结论 | 第81-83页 |
| 参考文献 | 第83-91页 |
| 致谢 | 第91-93页 |
| 攻读学位期间参与的学术会议目录 | 第93页 |
| 攻读学位期间参与的项目 | 第93-94页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第94页 |