| 中文摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 微RNA及其起源、进化研究现状 | 第9-28页 |
| ·微RNA及其生物学功能 | 第9-13页 |
| ·微RNA的生物发生 | 第10-11页 |
| ·微RNA的生物学作用机理 | 第11-13页 |
| ·微RNA起源、进化的研究现状 | 第13-26页 |
| ·微RNA、微RNA家族的命名及其在miRbase 18数据库中的统计 | 第13-16页 |
| ·基于统计的微RNA起源、进化研究方法 | 第16-19页 |
| ·基于功能性转移(functional shifts)比较的微RNA起源、进化研究方法 | 第19-21页 |
| ·基于序列比对和聚类分析的微RNA起源、进化研究方法 | 第21-26页 |
| ·基于微RNA-转录因子-功能基因共进化分析的微RNA起源、进化研究方法 | 第26页 |
| ·本论文的研究内容 | 第26-28页 |
| 第二章 生物发生律学说及其在生物系统发生研究上的优势 | 第28-32页 |
| ·何为生物发生律 | 第28-30页 |
| ·本研究中对生物发生律的应用 | 第30-31页 |
| ·对于后生生物微RNA起源研究采用生物发生律方法的优势 | 第31-32页 |
| 第三章 组织、胚层特异性微RNA家族的鉴定 | 第32-40页 |
| ·组织、胚层特异性微RNA家族的定义 | 第32页 |
| ·组织、胚层特异性微RNA家族的计算方法 | 第32-35页 |
| ·人体微RNA表达谱数据来源和计算方法 | 第33-34页 |
| ·以微RNA家族为视角对于数据中微RNA数据的再处理 | 第34-35页 |
| ·以胚层来源为视角对于数据中具体组织、器官数据的再处理 | 第35页 |
| ·组织、胚层特异性微RNA家族名单 | 第35-40页 |
| ·组织特异性微RNA家族的鉴定 | 第36-37页 |
| ·非组织特异性微RNA家族的鉴定 | 第37-38页 |
| ·胚层特异性微RNA家族的鉴定 | 第38-40页 |
| 第四章 生物发生律原理下微RNA家族起源图谱的构建 | 第40-51页 |
| ·组织特异性微RNA家族起源时间追溯 | 第40-43页 |
| ·非组织特异性微RNA家族实验数据测得最古物种起源时间追溯 | 第43-44页 |
| ·胚层特异性微RNA家族起源时间追溯 | 第44-46页 |
| ·起源图谱的构建与讨论 | 第46-51页 |
| 第五章 总结及展望 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-56页 |
| 附录一 人体微RNA表达谱原始数据 | 第56-64页 |
| 附录二 组织/器官、胚层特异性打分PERL脚本代码 | 第64-66页 |
| 附录三 归类后的微RNA家族名单 | 第66-67页 |
| 研究生期间研究成果 | 第67-68页 |
| 致谢 | 第68-69页 |
