| 摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-25页 |
| ·线粒体基因组概述 | 第14-18页 |
| ·线粒体基因组结构 | 第14-16页 |
| ·鱼类线粒体基因组遗传及进化特点 | 第16页 |
| ·鱼类 mtDNA 的应用 | 第16-18页 |
| ·虾虎鱼类的研究概述 | 第18-25页 |
| ·虾虎鱼类介绍 | 第18-19页 |
| ·虾虎鱼类分类研究进展 | 第19-25页 |
| 第二章 16 种虾虎鱼类线粒体全基因组结构及特征分析 | 第25-66页 |
| ·材料与方法 | 第25-30页 |
| ·主要仪器与试剂 | 第25-26页 |
| ·样品采集和 DNA 提取 | 第26-28页 |
| ·扩增引物的查找与设计 | 第28页 |
| ·PCR 扩增、产物纯化及克隆实验 | 第28-29页 |
| ·线粒体全基因组序列拼接注释、提交及结构分析 | 第29-30页 |
| ·实验结果 | 第30-62页 |
| ·红狼牙虾虎鱼(Odontamblyopus rubicundus) mtDNA 结构与特征 | 第30-32页 |
| ·孔虾虎鱼(Trypauchen vagina) mtDNA 结构与特征 | 第32-34页 |
| ·绿斑细棘虾虎鱼(Acentrogobius chlorostigmatoide) mtDNA 结构与特征 | 第34-36页 |
| ·普氏细棘虾虎鱼(Acentrogobius pflaumii) mtDNA 结构与特征 | 第36-38页 |
| ·舟山缰虾虎鱼(Amoya chusanensis) mtDNA 结构与特征 | 第38-40页 |
| ·台湾丝虾虎鱼(Cryptocentrus yatsui) mtDNA 结构与特征 | 第40-42页 |
| ·钝吻舌虾虎鱼(Glossogobius circumspectus) mtDNA 结构与特征 | 第42-44页 |
| ·斑纹舌虾虎鱼(Glossogobius olivaceus) mtDNA 结构与特征 | 第44-46页 |
| ·睛尾蝌蚪虾虎鱼(Lophiogobius ocellicauda) mtDNA 结构与特征 | 第46-48页 |
| ·斑尾刺虾虎鱼(Acanthogobius ommaturus) mtDNA 结构与特征 | 第48-50页 |
| ·平头竿虾虎鱼(Luciogobius platycephalus) mtDNA 结构与特征 | 第50-52页 |
| ·髭缟虾虎鱼(Tridentiger barbatus) mtDNA 结构与特征 | 第52-54页 |
| ·双带缟虾虎鱼(Tridentiger bifasciatus) mtDNA 结构与特征 | 第54-56页 |
| ·犬齿背眼虾虎鱼(Oxuderces dentatus) mtDNA 结构与特征 | 第56-58页 |
| ·青弹涂鱼(Scartelaos histophorus) mtDNA 结构与特征 | 第58-60页 |
| ·中华乌塘鳢(Bostrychus sinensis) mtDNA 结构与特征 | 第60-62页 |
| ·讨论 | 第62-66页 |
| ·虾虎鱼类 mtDNA 全序列结构的保守性 | 第62-63页 |
| ·虾虎鱼类非编码区结构 | 第63-66页 |
| 第三章 基于线粒体基因组所有编码基因序列的26种虾虎鱼类系统发育关系及虾虎鱼科种类分化时间估计 | 第66-73页 |
| ·材料与方法 | 第66-68页 |
| ·线粒体全基因组数据的获得 | 第66-67页 |
| ·基因组数据处理及系统发育分析 | 第67页 |
| ·分化时间估算 | 第67-68页 |
| ·分析结果 | 第68-70页 |
| ·26 种虾虎鱼类系统发育关系 | 第68-69页 |
| ·虾虎鱼科种类分化时间估算 | 第69-70页 |
| ·讨论 | 第70-73页 |
| ·溪鳢科，沙塘鳢科及塘鳢科种类系统发育关系探讨 | 第70-71页 |
| ·虾虎鱼科种类系统发育关系探讨及其起源与分化 | 第71-73页 |
| 总结 | 第73-74页 |
| 参考文献 | 第74-80页 |
| 致谢 | 第80-81页 |
| 在读期间发表的学术论文及研究成果 | 第81页 |
