| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-36页 |
| ·蛋白质通论 | 第16-17页 |
| ·蛋白质构象 | 第16-17页 |
| ·蛋白质分类 | 第17页 |
| ·蛋白质折叠概述 | 第17-21页 |
| ·蛋白质体内折叠与体外折叠 | 第18页 |
| ·蛋白质折叠的热力学与动力学研究 | 第18-19页 |
| ·蛋白质折叠类型 | 第19页 |
| ·蛋白质折叠机理 | 第19-21页 |
| ·蛋白质折叠速率预测研究进展 | 第21-33页 |
| ·基于三级结构的预测方法 | 第22-26页 |
| ·基于二级结构的预测方法 | 第26-27页 |
| ·基于一级结构的预测方法 | 第27-31页 |
| ·各种方法比较 | 第31-33页 |
| ·本文的主要研究工作 | 第33-35页 |
| ·本文的组织结构 | 第35-36页 |
| 第二章 基于遗传算法—神经网络的蛋白质折叠速率预测 | 第36-62页 |
| ·神经网络基本理论 | 第37-46页 |
| ·神经元模型 | 第38-40页 |
| ·神经网络学习类型 | 第40页 |
| ·神经网络分类 | 第40-42页 |
| ·BP 神经网络概述 | 第42-46页 |
| ·遗传算法基本知识 | 第46-50页 |
| ·遗传算法运算流程 | 第46-49页 |
| ·遗传算法的基本操作 | 第49-50页 |
| ·折叠速率预测的实现 | 第50-55页 |
| ·数据的搜集整理 | 第50-52页 |
| ·神经网络结构设计 | 第52页 |
| ·遗传算法的实现 | 第52-53页 |
| ·数据预处理 | 第53-55页 |
| ·预测模型的检验方法与衡量指标 | 第55-57页 |
| ·预测精度衡量指标 | 第55-56页 |
| ·预测模型检验方法 | 第56-57页 |
| ·预测结果与方法比较 | 第57-60页 |
| ·预测模型的执行结果 | 第57-58页 |
| ·不同方法间的比较 | 第58-60页 |
| ·结论 | 第60-62页 |
| 第三章 基于相关的蛋白质折叠速率预测 | 第62-80页 |
| ·引言 | 第62页 |
| ·材料与方法 | 第62-66页 |
| ·数据集 | 第63-65页 |
| ·评价方法 | 第65-66页 |
| ·基于伪氨基酸组成的蛋白质折叠速率预测 | 第66-74页 |
| ·伪氨基酸组成 | 第66-68页 |
| ·序列特征提取 | 第68-69页 |
| ·预测结果 | 第69-70页 |
| ·方法比较 | 第70-73页 |
| ·对认识折叠机理的启示 | 第73页 |
| ·该方法的不足之处 | 第73-74页 |
| ·基于n 阶偶联组成的蛋白质折叠速率预测 | 第74-78页 |
| ·n 阶偶联组成 | 第74-75页 |
| ·序列特征提取 | 第75-76页 |
| ·预测结果 | 第76-77页 |
| ·方法比较 | 第77-78页 |
| ·结果讨论 | 第78-79页 |
| ·本章小结 | 第79-80页 |
| 第四章 基于蒙特卡洛方法的蛋白质折叠速率预测 | 第80-95页 |
| ·蒙特卡洛方法介绍 | 第81-83页 |
| ·蒙特卡洛方法的基本思想 | 第81页 |
| ·蒙特卡洛方法的理论基础 | 第81-82页 |
| ·蒙特卡洛方法的操作步骤 | 第82-83页 |
| ·蒙特卡洛方法的优点 | 第83页 |
| ·奇异值分解模型 | 第83-85页 |
| ·奇异值分解的定义 | 第83-84页 |
| ·奇异值分解的性质 | 第84-85页 |
| ·材料与方法 | 第85-90页 |
| ·数据集 | 第85-86页 |
| ·伪氨基酸组成 | 第86页 |
| ·蒙特卡洛方法的实现 | 第86-90页 |
| ·评价方法 | 第90页 |
| ·结果分析与讨论 | 第90-93页 |
| ·预测结果 | 第90-91页 |
| ·对认识折叠机理的启示 | 第91-92页 |
| ·方法比较 | 第92-93页 |
| ·方法的不足与可能存在的改进 | 第93-94页 |
| ·本章小结 | 第94-95页 |
| 第五章 网络服务 | 第95-101页 |
| ·引言 | 第96-97页 |
| ·网络服务的描述 | 第97-100页 |
| ·网络服务的键入 | 第98-99页 |
| ·网络服务的输出 | 第99-100页 |
| ·网络服务的附加信息 | 第100页 |
| ·本章小结 | 第100-101页 |
| 第六章 总结与讨论 | 第101-105页 |
| ·全文总结 | 第102-103页 |
| ·存在的问题与讨论 | 第103页 |
| ·后续工作展望 | 第103-105页 |
| 致谢 | 第105-106页 |
| 参考文献 | 第106-121页 |
| 攻博期间取得的研究成果 | 第121-122页 |
| 一、攻博期间完成和发表的论文 | 第121页 |
| 二、攻博期间参加的科研项目 | 第121-122页 |