| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-27页 |
| ·研究背景 | 第9-10页 |
| ·序列比对算法 | 第10-11页 |
| ·DNA 序列进化距离研究概况 | 第11-24页 |
| ·p 距离 | 第11页 |
| ·核苷酸替代的数学模型及进化距离d | 第11-23页 |
| ·Jukes-Cantor 模型及其进化距离 | 第12-14页 |
| ·Kimura 双参数模型及其进化距离 | 第14-16页 |
| ·Equal-input 模型及其进化距离 | 第16-18页 |
| ·Tamura 模型及其进化距离 | 第18-20页 |
| ·Tamura-Nei 模型及其进化距离 | 第20-23页 |
| ·Γ距离 | 第23-24页 |
| ·基于非序列比对的进化距离 | 第24页 |
| ·系统进化树 | 第24-27页 |
| 第二章 DNA 序列选择进化距离及其应用 | 第27-37页 |
| ·选择模型的主要思想 | 第27-28页 |
| ·选择模型在不同核苷酸替代模型下的应用 | 第28-32页 |
| ·Jukes-Cantor 模型的选择进化距离dJ-C (y) | 第28页 |
| ·Kimura 双参数模型的选择进化距离dK (y) | 第28-29页 |
| ·Equal-input 模型的选择进化距离dE (y) | 第29-30页 |
| ·Tamura 模型的选择进化距离dT (y) | 第30-31页 |
| ·Tamura-Nei 模型的选择进化距离dT -N(y) | 第31-32页 |
| ·动力学参数b 的性质 | 第32-33页 |
| ·b 的估计与应用举例 | 第33-37页 |
| ·b 的估计 | 第33-34页 |
| ·应用举例 | 第34-35页 |
| ·各种进化距离的比较 | 第35-37页 |
| 第三章 结论与讨论 | 第37-38页 |
| ·结论 | 第37页 |
| ·讨论 | 第37-38页 |
| 参考文献 | 第38-42页 |
| 附录 | 第42-43页 |
| 致谢 | 第43-44页 |
| 作者简介 | 第44页 |
