| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 符号说明 | 第11-12页 |
| 第一部分 文献综述 | 第12-39页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-39页 |
| 1 单子叶和双子叶植物间的差异 | 第12-16页 |
| ·单子叶和双子叶植物 | 第12-14页 |
| ·单子叶和双子叶植物的差异 | 第14-15页 |
| ·单子叶和双子叶植物差异的进化分析 | 第15-16页 |
| 2 进化论的研究进展 | 第16-24页 |
| ·主要进化学说的发展 | 第16-20页 |
| ·前达尔文进化论 | 第17页 |
| ·达尔文进化论 | 第17-18页 |
| ·后达尔文进化论 | 第18-19页 |
| ·现代进化论 | 第19-20页 |
| ·分子进化的发展 | 第20-24页 |
| ·生物大分子的进化 | 第20-21页 |
| ·分子进化的中性学说 | 第21-22页 |
| ·生物大分子的进化速率 | 第22-23页 |
| ·分子系统发育 | 第23-24页 |
| 3 储藏球蛋白基因家族的研究进展 | 第24-30页 |
| ·球蛋白是重要的贮藏蛋白 | 第24-26页 |
| ·11S球蛋白基因家族的研究进展 | 第26-29页 |
| ·大豆11S球蛋白基因家族的研究进展 | 第26-27页 |
| ·水稻11S球蛋白基因家族的研究进展 | 第27-28页 |
| ·拟南芥11S球蛋白基因家族的研究进展 | 第28-29页 |
| ·7S球蛋白基因家族的研究进展 | 第29-30页 |
| ·11S和7S球蛋白基因家族起源于同一祖先 | 第30页 |
| 4 淀粉合成相关基因家族的研究进展 | 第30-37页 |
| ·淀粉的结构 | 第31-32页 |
| ·淀粉合成的关键酶 | 第32-36页 |
| ·ADP-葡萄糖焦磷酸化酶 | 第32-33页 |
| ·颗粒结合淀粉合成酶 | 第33页 |
| ·淀粉合成酶 | 第33-34页 |
| ·淀粉分枝酶 | 第34-35页 |
| ·淀粉去分枝酶 | 第35-36页 |
| ·淀粉合成途径的进化 | 第36-37页 |
| 5 本研究的目的与研究内容 | 第37-39页 |
| 第二部分 研究报告 | 第39-108页 |
| 第二章 11S球蛋白和7Sβ伴球蛋白基因家族在大豆中的分子进化 | 第40-62页 |
| 1 引言 | 第40-41页 |
| 2 材料和方法 | 第41-44页 |
| ·序列收集 | 第41-42页 |
| ·共线性分析 | 第42页 |
| ·进化树分析 | 第42页 |
| ·K_S的计算以及基因复制时间的计算 | 第42-43页 |
| ·正选择分析 | 第43-44页 |
| 3 结果与分析 | 第44-53页 |
| ·序列收集结果与分析 | 第44-45页 |
| ·共线性分析 | 第45页 |
| ·进化树分析结果 | 第45-51页 |
| ·大豆11S球蛋白和β伴球蛋白基因家族的复制 | 第51-52页 |
| ·正选择分析 | 第52-53页 |
| 4 讨论 | 第53-62页 |
| ·Gy7正在丢失其功能 | 第53-55页 |
| ·大豆11S球蛋白和β伴球蛋白起源于大豆全基因复制和串联重复 | 第55-57页 |
| ·复制基因的分化 | 第57-59页 |
| ·基因复制和快速进化可能促进了大豆合成蛋白的能力 | 第59-62页 |
| 第三章 11S球蛋白基因家族在单、双子叶植物间的比较分子进化 | 第62-76页 |
| 1 引言 | 第62-63页 |
| 2 材料和方法 | 第63-66页 |
| ·序列收集 | 第63-65页 |
| ·进化树分析 | 第65页 |
| ·基因复制和丢失估算 | 第65页 |
| ·d_N/d_S比率估算 | 第65-66页 |
| ·正选择分析 | 第66页 |
| 3 结果与分析 | 第66-71页 |
| ·序列的收集结果 | 第66-67页 |
| ·进化树分析 | 第67-68页 |
| ·基因复制和丢失分析 | 第68页 |
| ·基因的进化速率分析 | 第68-71页 |
| ·11S球蛋白基因家族正选择分析 | 第71页 |
| 4 讨论 | 第71-76页 |
| ·复制较多及进化较快是双子叶植物11S球蛋白基因家族的特点 | 第71-74页 |
| ·基因复制可能促进了双子叶植物合成11S球蛋白的能力 | 第74-75页 |
| ·快速进化可能促进了双子叶植物合成11S球蛋白的能力 | 第75-76页 |
| 第四章 淀粉合成关键基因家族在单、双子叶植物间的比较分子进化 | 第76-106页 |
| 1 引言 | 第76-78页 |
| 2 材料和方法 | 第78-79页 |
| ·序列收集 | 第78页 |
| ·进化树分析 | 第78页 |
| ·基因的复制和丢失估算 | 第78-79页 |
| ·d_N/d_S比率的估算 | 第79页 |
| ·正选择分析 | 第79页 |
| 3 结果与分析 | 第79-100页 |
| ·序列收集结果与分析 | 第79-83页 |
| ·AGPase基因家族成员 | 第79-82页 |
| ·SS基因家族成员 | 第82-83页 |
| ·SBE基因家族成员 | 第83页 |
| ·DBE基因家族成员 | 第83页 |
| ·进化树分析 | 第83-92页 |
| ·AGPase基因家族进化树分析 | 第83-86页 |
| ·SS基因家族进化树分析 | 第86-90页 |
| ·SBE基因家族进化树分析 | 第90页 |
| ·DBE基因家族进化树分析 | 第90-92页 |
| ·单子叶和双子叶植物的基因复制与丢失 | 第92-96页 |
| ·单子叶和双子叶植物的进化速率 | 第96-100页 |
| ·单子叶和双子叶植物的选择模式 | 第100页 |
| 4 讨论 | 第100-106页 |
| ·猜测1:基因复制促进了单子叶植物合成淀粉的能力 | 第103页 |
| ·猜测2:较快的进化速度促进了单子叶植物合成淀粉的能力 | 第103-104页 |
| ·AGPS基因家族的进化支持了本研究的猜测 | 第104-106页 |
| 第五章 全文结论及创新点 | 第106-108页 |
| 1 全文结论 | 第106-107页 |
| 2 创新点 | 第107-108页 |
| 参考文献 | 第108-120页 |
| 致谢 | 第120-121页 |
| 攻读博士学位期间发表及待发表的论文 | 第121页 |
