基于EST全基因组定位的基因结构注释研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 1 绪论 | 第9-17页 |
| ·课题来源 | 第9页 |
| ·研究背景、目的与意义 | 第9-10页 |
| ·研究现状 | 第10-15页 |
| ·主要研究内容 | 第15-17页 |
| 2 EST 与基因组序列分析 | 第17-28页 |
| ·EST 概述 | 第17页 |
| ·EST 的产生过程 | 第17-19页 |
| ·EST 序列特点 | 第19-21页 |
| ·EST 序列质量 | 第21-24页 |
| ·基因组序列的复杂性 | 第24-28页 |
| 3 研究方案 | 第28-33页 |
| ·消除外源序列影响 | 第28页 |
| ·重复序列的处理 | 第28-29页 |
| ·序列比对工具 | 第29页 |
| ·EST-基因组比对结果挑选 | 第29-30页 |
| ·EST 聚类 | 第30页 |
| ·剪接变体预测 | 第30-33页 |
| 4 系统实现 | 第33-40页 |
| ·总体流程 | 第33页 |
| ·EST 序列提取 | 第33页 |
| ·外源序列去除 | 第33-35页 |
| ·EST-基因组比对 | 第35-36页 |
| ·比对结果筛选 | 第36-37页 |
| ·比对结果聚类 | 第37页 |
| ·剪接变体预测 | 第37-39页 |
| ·数据库的建立 | 第39页 |
| ·注释结果展示 | 第39-40页 |
| 5 结果测试与分析 | 第40-44页 |
| ·测评指标 | 第40-41页 |
| ·测评数据集 | 第41-42页 |
| ·讨论 | 第42-44页 |
| 6 总结与展望 | 第44-45页 |
| 致谢 | 第45-46页 |
| 参考文献 | 第46-52页 |
| 附录 攻读学位期间发表论文 | 第52页 |
