| 摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 缩略词表 | 第12-13页 |
| 资源家系测定性状的英文缩写 | 第13-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-30页 |
| 1 引言 | 第14页 |
| 2 遗传育种中常用的分子标记技术概述 | 第14-16页 |
| ·RFLP标记 | 第14页 |
| ·RAPD标记 | 第14-15页 |
| ·AFLP标记 | 第15页 |
| ·PCR-SSCP标记 | 第15页 |
| ·微卫星标记 | 第15-16页 |
| ·线粒体DNA标记 | 第16页 |
| 3 分子标记技术在猪育种中的应用 | 第16-18页 |
| ·遗传多样性的研究 | 第16页 |
| ·基因图谱的构建 | 第16-17页 |
| ·猪的起源及群体亲缘关系的研究 | 第17页 |
| ·猪的抗病育种 | 第17页 |
| ·标记辅助选择(MAS) | 第17-18页 |
| ·标记辅助导入 | 第18页 |
| ·猪数量性状主基因的检测 | 第18页 |
| ·杂种优势预测 | 第18页 |
| 4 根据EST分离基因 | 第18-21页 |
| ·依据 | 第18-19页 |
| ·EST简介及其应用 | 第19页 |
| ·利用EST发现和克隆新基因 | 第19-21页 |
| 5 比较基因组学在分离新基因中的应用 | 第21-22页 |
| 6 位置克隆在分离新基因中的应用 | 第22页 |
| 7 猪体内脂肪沉积的QTL定位研究现状 | 第22-24页 |
| 8 与脂肪沉积相关的候选基因 | 第24-27页 |
| 9 两个拟候选基因研究现状 | 第27-28页 |
| 10 本研究的目的和意义 | 第28-30页 |
| 第二章 材料与方法 | 第30-40页 |
| 1 前言 | 第30页 |
| 2 试验材料 | 第30-32页 |
| ·试验样品及性状测定 | 第30页 |
| ·主要仪器和设备 | 第30-31页 |
| ·主要药品及试剂 | 第31页 |
| ·缓冲液和常用试剂的配制 | 第31-32页 |
| 3 试验方法 | 第32-38页 |
| ·猪基因组DNA的提取 | 第32页 |
| ·基因组DNA的浓度测定和质量检测 | 第32-33页 |
| ·利用RT-PCR方法扩增cDNA片段 | 第33-34页 |
| ·候选基因的确定及引物设计 | 第34页 |
| ·PCR产物的回收、纯化、克隆测序 | 第34-36页 |
| ·PCR产物回收与纯化 | 第34-35页 |
| ·回收DNA片段与载体的连接 | 第35页 |
| ·感受态细胞的制备(CaCl_2法制备感受态) | 第35-36页 |
| ·连接产物的转化 | 第36页 |
| ·阳性克隆子鉴定及测序 | 第36页 |
| ·生物信息学分析相应软件 | 第36-37页 |
| ·猪候选基因组序列的扩增及部分SNP的PCR-RFLP检测 | 第37-38页 |
| 4 统计分析 | 第38页 |
| ·分子标记在不同猪种中的等位基因频率及基因型频率计算 | 第38页 |
| ·分子标记的基因效应分析 | 第38页 |
| 5 组织表达谱分析 | 第38-40页 |
| 第三章 结果与分析 | 第40-63页 |
| 1 总RNA的提取 | 第40页 |
| 2 猪USF1基因 | 第40-52页 |
| ·根据猪EST信息设计特异性引物及RT-PCR扩增结果 | 第40-41页 |
| ·猪USF1基因cDNA序列生物信息学分析结果 | 第41-42页 |
| ·推导的USF1蛋白质的基本特征分析 | 第42-44页 |
| ·猪USF1基因组序列的克隆、测序和序列分析 | 第44-48页 |
| ·猪USF1基因第10内含子遗传变异多态性检测 | 第48页 |
| ·猪USF1基因的PCR-Alu I-RFLP多态性在不同猪群种的分布结果 | 第48-49页 |
| ·猪USF1基因第10内含子PCR-AluI-RFLP基因型与生产性状的统计分析 | 第49-52页 |
| 3 猪MBF1基因 | 第52-63页 |
| ·根据猪EST信息设计特异性引物及RT-PCR扩增结果 | 第52页 |
| ·猪MBF1基因cDNA序列生物信息学分析结果 | 第52-53页 |
| ·推导的MBF1蛋白质的基本特征分析 | 第53-56页 |
| ·猪MBF1基因组序列的克隆、测序和序列分析 | 第56-57页 |
| ·猪MBF1基因第4外显子遗传变异多态性检测 | 第57-58页 |
| ·猪MBF1基因的PCR-Taq I-RFLP多态性在不同猪群种的分布结果 | 第58-59页 |
| ·猪MBF1基因第4外显子PCR-Taq I-RFLP基因型与生产性状的统计分析 | 第59-61页 |
| ·猪MBF1基因的组织表达谱分析 | 第61-63页 |
| 第四章 讨论 | 第63-69页 |
| 1 分离猪基因cDNA序列的策略 | 第63页 |
| 2 猪USF1/CD转录本 | 第63-64页 |
| 3 猪USF1、MBF1基因SNPs在基因组的分布 | 第64-65页 |
| 4 SNPs的生物学效应 | 第65-66页 |
| 5 猪USF1和MBF1基因在不同群体中基因型频率分布 | 第66页 |
| 6 猪USF1和MBF1基因遗传效应分析 | 第66-67页 |
| 7 关于USF1和MBF1蛋白的进化树分析 | 第67页 |
| 8 组织表达谱分析 | 第67-69页 |
| 小结 | 第69-71页 |
| 本研究获得的主要成果 | 第69页 |
| 本研究的创新点与特色 | 第69-70页 |
| 本研究的不足和引出的问题 | 第70-71页 |
| 下一步工作计划 | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-78页 |
| 在读期间发表论文 | 第78-79页 |
| 附录 | 第79-90页 |
| 致谢 | 第90页 |
