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山东省东平湖四种常见淡水鱼肠道菌群分析

中文摘要第1-12页
英文摘要第12-14页
1 引言第14-31页
   ·鱼肠道菌群的概述第14-18页
     ·鱼肠道菌群的形成第14页
     ·鱼肠道菌群的特性、数量和组成第14-15页
     ·鱼肠道菌群的分布第15-16页
     ·鱼肠道菌群的作用第16-18页
       ·屏障作用第16页
       ·营养作用第16-17页
       ·辅助消化作用第17页
       ·免疫作用第17-18页
   ·鱼肠道菌群的研究进展第18-20页
     ·国外研究进展第18-19页
     ·国内研究进展第19-20页
   ·鱼肠道菌群的研究方法第20-24页
     ·培养鉴定法第20页
     ·现代分子生物学方法第20-24页
       ·荧光原位杂交技术(FISH)第20-21页
       ·脉冲场凝胶电泳(PFGE)第21页
       ·PCR‐DGGE 方法第21-22页
       ·实时荧光定量PCR第22-23页
       ·ERIC‐PCR 技术第23-24页
   ·ERIC‐PCR 技术特点及其应用第24-29页
     ·ERIC‐PCR 技术第24页
     ·肠杆菌基因间重复共有序列(ERIC)的发现与分布第24页
     ·ERIC 结构特征及功能第24-25页
     ·ERIC‐PCR 的原理及特点第25页
     ·ERIC‐PCR 产物形成规律第25-26页
     ·ERIC‐PCR 技术的应用第26-28页
       ·在菌株分类和鉴定中的应用第26-27页
       ·在混合菌样品中的应用第27-28页
       ·ERIC‐PCR 在流行病调查中的应用第28页
     ·存在的问题和展望第28-29页
   ·本研究的目的和意义第29-30页
   ·本研究技术路线第30-31页
2 材料与方法第31-40页
   ·材料第31-34页
     ·实验鱼类第31页
     ·实验仪器第31-32页
     ·主要试剂及配制第32页
     ·主要工作液配制第32-33页
       ·DNA 提取缓冲液第32页
       ·凝胶电泳缓冲液(50×TAE)第32页
       ·TE 缓冲液第32-33页
       ·196琼脂糖凝胶第33页
     ·主要选择性培养基制备第33-34页
       ·糖发酵试验第33页
       ·尿素酶试验第33页
       ·甲基红(M‐R)试验第33页
       ·维培(V‐P)二氏试验第33页
       ·硝酸盐还原试验第33页
       ·接触酶试验第33-34页
       ·明胶液化试验第34页
       ·淀粉液化能力第34页
       ·产气试验第34页
       ·运动性试验第34页
       ·硫化氢试验第34页
   ·试验方法第34-40页
     ·取材第34页
     ·细菌的培养及筛选第34-35页
     ·鉴定试验第35-37页
       ·糖和醇发酵试验第35页
       ·脲酶试验第35页
       ·甲基红试验第35页
       ·V‐P 试验第35页
       ·硝酸盐还原试验第35-36页
       ·接触酶试验第36页
       ·明胶液化试验第36页
       ·淀粉液化试验第36页
       ·运动性试验第36页
       ·产气试验第36页
       ·硫化氢试验第36-37页
     ·细菌鉴定技术体系第37页
     ·肠道细菌总DNA 的提取第37-38页
     ·ERIC‐PCR 反应及分析第38-40页
       ·引物的合成第38页
       ·最佳反应体系和反应条件的确立第38-40页
       ·各肠道菌群的PCR 扩增第40页
       ·电泳第40页
       ·PCR 产物分析第40页
3 结果及分析第40-44页
   ·鉴定结果第40-41页
   ·不同鱼种鱼体内菌群的分布第41-42页
     ·草鱼肠道菌群组成第41页
     ·鲢鱼肠道菌群组成第41-42页
     ·鲤鱼肠道菌群组成第42页
     ·鲫鱼肠道菌群组成第42页
   ·总 DNA 的提取第42-43页
   ·ERIC-PCR 反应的最优条件第43页
   ·ERIC-PCR 指纹图谱建立第43-44页
   ·ERIC-PCR 图谱分析与肠道细菌组成分析第44页
4 讨论第44-48页
   ·生化试验对四种常见淡水鱼的肠道菌群分析第44-45页
   ·肠道内容物中优势菌群 DNA 的提取第45-46页
   ·ERIC-PCR 对四种淡水鱼肠道菌群多样性的分析第46-48页
5 结论第48-49页
参考文献第49-57页
攻读学位期间发表论文情况第57-58页
致谢第58-59页

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