| 提要 | 第1-7页 |
| 第一章 引言 | 第7-18页 |
| ·研究背景 | 第7-9页 |
| ·转录起始和启动子 | 第9-10页 |
| ·RNA 聚合酶如何找到启动子序列 | 第10-11页 |
| ·基因表达数据的分析与处理 | 第11-12页 |
| ·研究目的及内容 | 第12-18页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第18-31页 |
| ·获取启动子序列 | 第18-19页 |
| ·自由能计算 | 第19-21页 |
| ·局域可弯曲性（BENDIBILITY）预测 | 第21-24页 |
| ·宏观可弯曲性（CURVATURE）预测 | 第24-27页 |
| ·蛋白质诱导的可变性（DEFORMABILITY）预测 | 第27-29页 |
| ·启动子区域的核苷酸组成 | 第29-30页 |
| ·编程实现 | 第30-31页 |
| 第三章 实验结果 | 第31-43页 |
| ·启动子区域的自由能 | 第31-33页 |
| ·启动子区域可弯曲性（BENDABILITY）预测 | 第33-34页 |
| ·启动子区域的核苷酸组成分析 | 第34-36页 |
| ·拟南芥启动子区域的自由能和基因表达相关性分析 | 第36-43页 |
| 第四章 讨论 | 第43-48页 |
| 结论 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-55页 |
| 摘要 | 第55-58页 |
| ABSTRACT | 第58-60页 |
| 致谢 | 第60-61页 |
| 导师简介 | 第61页 |