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鸡繁殖性状相关基因及卵巢组织差异表达基因研究

摘要第1-14页
ABSTRACT第14-17页
文献综述第17-37页
 1 家禽的繁殖生理概述第17-19页
 2 影响畜禽繁殖性能的因素第19-35页
   ·下丘脑-垂体-性腺轴对繁殖的调控第19-20页
   ·促卵泡素刺激卵泡发育第20-24页
   ·低密度脂蛋白受体基因家族介导卵黄沉积第24-26页
   ·骨形态发生蛋白家族对卵泡成熟的影响第26-30页
     ·BMP 系统和卵泡发生第27-29页
     ·BMP 系统:调节排卵率的关键成分第29-30页
   ·胰岛素样生长因子与卵泡发育的关系第30-33页
     ·IGF 系统元件第30-31页
     ·IGF 系统和卵巢卵泡发生第31-33页
   ·限饲与禽类繁殖性能的关系第33页
   ·家禽就巢性的研究第33-35页
   ·其他第35页
 3 基因表达差异的研究方法第35页
 4 本研究的目的意义第35-37页
材料与方法第37-46页
 1 试验材料第37-39页
   ·试验动物和样品采集第37页
   ·菌株和载体第37页
   ·主要仪器第37-38页
   ·酶和试剂第38页
   ·主要数据库及生物软件第38-39页
 2 试验方法第39-46页
   ·常用试剂的配制第39-40页
   ·鸡血液中 DNA 的提取第40-41页
   ·总RNA 的制备第41-42页
   ·克隆和测序第42-44页
     ·PCR 产物的纯化第42-43页
     ·连接第43页
     ·感受态细胞的制备和转化第43-44页
     ·小量制备质粒DNA第44页
     ·重组质粒的酶切鉴定和测序第44页
   ·聚丙烯酰胺凝胶电泳第44-45页
   ·统计分析第45-46页
试验一 鸡FSHR 5’调控区的克隆及其与产蛋性能的关系第46-63页
 1 试验材料第46页
 2 试验方法第46-48页
   ·鸡血液DNA 的提取第46页
   ·引物设计和扩增第46页
   ·扩增产物的克隆和测序和比对第46-47页
   ·序列多态性分析第47页
   ·统计分析第47-48页
 3 结果与分析第48-60页
   ·鸡血中提取的基因组DNA第48页
   ·鸡FSHR 5’调控区序列的克隆、测序第48-49页
     ·FSHR 5’调控区片段1 和片段2 的扩增第48-49页
     ·FSHR 5’调控区的克隆测序第49页
   ·FSHR 5’调控区的序列分析第49-55页
     ·FSHR 5’调控区的序列组装第49-50页
     ·FSHR 5’调控区的序列比对第50-55页
   ·FSHR 5’调控区-71 位点的多态性检测第55-57页
     ·PCR 扩增第55-56页
     ·多态性检测与测序第56-57页
   ·FSHR 5’调控区-237 位点的多态性检测第57-58页
     ·PCR 扩增第57页
     ·多态性检测第57-58页
   ·FSHR 5’调控区-868 位点200 BP 插入序列的多态性检测第58页
   ·数据统计及遗传效应分析第58-60页
     ·基因频率和基因型频率第58-59页
     ·FSHR 5’调控区-71、-237 和-868 位点多态性与产蛋性能的关联分析第59-60页
 4 讨论第60-63页
   ·鸡FSHR 5’调控区序列分析第60-61页
   ·三位点的等位基因分布第61页
   ·FSHR 5’调控区多态性位点与产蛋性能的关系第61-63页
试验二 鸡BMPR-ⅠB 外显子6-7 序列的克隆及其遗传效应分析第63-73页
 1 试验材料第63页
 2 试验方法第63-65页
   ·鸡血液DNA 的提取第63页
   ·PCR 扩增、测序和序列比对第63页
   ·序列多态性分析第63-64页
     ·BMPR-ⅠB 外显子6 上35 位点的 PCR 扩增第64页
     ·PCR-SSCP 检测35 位点多态性第64页
     ·PCR-RFLP 方法检测287 位 A/G 转换第64页
   ·统计分析第64-65页
 3 结果第65-71页
   ·鸡血中提取的基因组 DNA第65页
   ·BMPR-ⅠB 外显子6-7 序列克隆测序第65-67页
     ·BMPR-ⅠB 外显子6-7 序列的扩增第65-66页
     ·PCR 产物克隆测序第66-67页
   ·BMPR-ⅠB 35 位点多态性检测第67-69页
     ·PCR 扩增第67-68页
     ·多态性检测第68-69页
   ·BMPR-ⅠB 287 位点的 PCR-RFLP 检测第69页
   ·数据统计和关联分析第69-71页
     ·BMPR-ⅠB 35、287 位点基因型频率和等位基因频率第69-70页
     ·BMPR-ⅠB 35、287 位点与产蛋性能的关联分析第70-71页
 4 讨论第71-73页
试验三 鸡FSHR、BMPR-ⅠB 和IGFBP-4 MRNA 在卵巢组织和卵泡的表达第73-80页
 1 试验材料第73页
 2 试验方法第73-74页
   ·总RNA 的提取第73页
   ·半定量RT-PCR第73页
   ·统计分析第73-74页
 3 结果第74-77页
   ·提取总RNA 的检测第74-75页
   ·不同周龄鸡 FSHR MRNA 在卵巢、卵泡的表达变化第75页
   ·不同周龄鸡 BMPR-ⅠB MRNA 在卵巢、卵泡的表达变化第75-76页
   ·不同周龄鸡 IGFBP-4 MRNA 在卵巢、卵泡的表达变化第76-77页
 4 讨论第77-80页
   ·FSHR mRNA 表达与卵巢卵泡发育的关系第77-78页
   ·BMPR- Ⅰ B mRNA 表达与卵巢卵泡发育的关系第78页
   ·IGFBP-4 mRNA 表达与卵巢卵泡发育的关系第78-80页
试验四 鸡卵巢组织不同时期差异表达基因的克隆第80-95页
 1 试验材料第80页
 2 试验方法第80-83页
   ·总RNA 的提取第80页
   ·DDRT-PCR第80-82页
     ·差异显示引物第80页
     ·逆转录合成 cDNA 第一链第80-81页
     ·DD-PCR第81页
     ·6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳第81页
     ·差异片段的回收和二次扩增第81-82页
     ·二次扩增差异片段的纯化、克隆和测序第82页
     ·半定量RT-PCR第82页
   ·统计分析第82-83页
 3 结果第83-90页
   ·提取总 RNA 的检测第83页
   ·DDRT-PCR第83-84页
   ·差异表达片段的回收和二次扩增第84页
   ·差异显示片段测序第84页
   ·差异表达基因检索第84-85页
   ·半定量RT-PCR 验证差异表达基因第85-90页
 4 讨论第90-95页
   ·鸡基因组与差异表达基因的生物信息学分析第90-91页
   ·鸡卵巢组织差异表达基因第91-95页
     ·肿瘤蛋白D52 样蛋白2第91-92页
     ·DNAJC8第92-93页
     ·LDHB第93页
     ·其他基因第93-95页
结论第95-96页
参考文献第96-107页
附录第107-111页
致谢第111页

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