摘要 | 第1-14页 |
ABSTRACT | 第14-17页 |
文献综述 | 第17-37页 |
1 家禽的繁殖生理概述 | 第17-19页 |
2 影响畜禽繁殖性能的因素 | 第19-35页 |
·下丘脑-垂体-性腺轴对繁殖的调控 | 第19-20页 |
·促卵泡素刺激卵泡发育 | 第20-24页 |
·低密度脂蛋白受体基因家族介导卵黄沉积 | 第24-26页 |
·骨形态发生蛋白家族对卵泡成熟的影响 | 第26-30页 |
·BMP 系统和卵泡发生 | 第27-29页 |
·BMP 系统:调节排卵率的关键成分 | 第29-30页 |
·胰岛素样生长因子与卵泡发育的关系 | 第30-33页 |
·IGF 系统元件 | 第30-31页 |
·IGF 系统和卵巢卵泡发生 | 第31-33页 |
·限饲与禽类繁殖性能的关系 | 第33页 |
·家禽就巢性的研究 | 第33-35页 |
·其他 | 第35页 |
3 基因表达差异的研究方法 | 第35页 |
4 本研究的目的意义 | 第35-37页 |
材料与方法 | 第37-46页 |
1 试验材料 | 第37-39页 |
·试验动物和样品采集 | 第37页 |
·菌株和载体 | 第37页 |
·主要仪器 | 第37-38页 |
·酶和试剂 | 第38页 |
·主要数据库及生物软件 | 第38-39页 |
2 试验方法 | 第39-46页 |
·常用试剂的配制 | 第39-40页 |
·鸡血液中 DNA 的提取 | 第40-41页 |
·总RNA 的制备 | 第41-42页 |
·克隆和测序 | 第42-44页 |
·PCR 产物的纯化 | 第42-43页 |
·连接 | 第43页 |
·感受态细胞的制备和转化 | 第43-44页 |
·小量制备质粒DNA | 第44页 |
·重组质粒的酶切鉴定和测序 | 第44页 |
·聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第44-45页 |
·统计分析 | 第45-46页 |
试验一 鸡FSHR 5’调控区的克隆及其与产蛋性能的关系 | 第46-63页 |
1 试验材料 | 第46页 |
2 试验方法 | 第46-48页 |
·鸡血液DNA 的提取 | 第46页 |
·引物设计和扩增 | 第46页 |
·扩增产物的克隆和测序和比对 | 第46-47页 |
·序列多态性分析 | 第47页 |
·统计分析 | 第47-48页 |
3 结果与分析 | 第48-60页 |
·鸡血中提取的基因组DNA | 第48页 |
·鸡FSHR 5’调控区序列的克隆、测序 | 第48-49页 |
·FSHR 5’调控区片段1 和片段2 的扩增 | 第48-49页 |
·FSHR 5’调控区的克隆测序 | 第49页 |
·FSHR 5’调控区的序列分析 | 第49-55页 |
·FSHR 5’调控区的序列组装 | 第49-50页 |
·FSHR 5’调控区的序列比对 | 第50-55页 |
·FSHR 5’调控区-71 位点的多态性检测 | 第55-57页 |
·PCR 扩增 | 第55-56页 |
·多态性检测与测序 | 第56-57页 |
·FSHR 5’调控区-237 位点的多态性检测 | 第57-58页 |
·PCR 扩增 | 第57页 |
·多态性检测 | 第57-58页 |
·FSHR 5’调控区-868 位点200 BP 插入序列的多态性检测 | 第58页 |
·数据统计及遗传效应分析 | 第58-60页 |
·基因频率和基因型频率 | 第58-59页 |
·FSHR 5’调控区-71、-237 和-868 位点多态性与产蛋性能的关联分析 | 第59-60页 |
4 讨论 | 第60-63页 |
·鸡FSHR 5’调控区序列分析 | 第60-61页 |
·三位点的等位基因分布 | 第61页 |
·FSHR 5’调控区多态性位点与产蛋性能的关系 | 第61-63页 |
试验二 鸡BMPR-ⅠB 外显子6-7 序列的克隆及其遗传效应分析 | 第63-73页 |
1 试验材料 | 第63页 |
2 试验方法 | 第63-65页 |
·鸡血液DNA 的提取 | 第63页 |
·PCR 扩增、测序和序列比对 | 第63页 |
·序列多态性分析 | 第63-64页 |
·BMPR-ⅠB 外显子6 上35 位点的 PCR 扩增 | 第64页 |
·PCR-SSCP 检测35 位点多态性 | 第64页 |
·PCR-RFLP 方法检测287 位 A/G 转换 | 第64页 |
·统计分析 | 第64-65页 |
3 结果 | 第65-71页 |
·鸡血中提取的基因组 DNA | 第65页 |
·BMPR-ⅠB 外显子6-7 序列克隆测序 | 第65-67页 |
·BMPR-ⅠB 外显子6-7 序列的扩增 | 第65-66页 |
·PCR 产物克隆测序 | 第66-67页 |
·BMPR-ⅠB 35 位点多态性检测 | 第67-69页 |
·PCR 扩增 | 第67-68页 |
·多态性检测 | 第68-69页 |
·BMPR-ⅠB 287 位点的 PCR-RFLP 检测 | 第69页 |
·数据统计和关联分析 | 第69-71页 |
·BMPR-ⅠB 35、287 位点基因型频率和等位基因频率 | 第69-70页 |
·BMPR-ⅠB 35、287 位点与产蛋性能的关联分析 | 第70-71页 |
4 讨论 | 第71-73页 |
试验三 鸡FSHR、BMPR-ⅠB 和IGFBP-4 MRNA 在卵巢组织和卵泡的表达 | 第73-80页 |
1 试验材料 | 第73页 |
2 试验方法 | 第73-74页 |
·总RNA 的提取 | 第73页 |
·半定量RT-PCR | 第73页 |
·统计分析 | 第73-74页 |
3 结果 | 第74-77页 |
·提取总RNA 的检测 | 第74-75页 |
·不同周龄鸡 FSHR MRNA 在卵巢、卵泡的表达变化 | 第75页 |
·不同周龄鸡 BMPR-ⅠB MRNA 在卵巢、卵泡的表达变化 | 第75-76页 |
·不同周龄鸡 IGFBP-4 MRNA 在卵巢、卵泡的表达变化 | 第76-77页 |
4 讨论 | 第77-80页 |
·FSHR mRNA 表达与卵巢卵泡发育的关系 | 第77-78页 |
·BMPR- Ⅰ B mRNA 表达与卵巢卵泡发育的关系 | 第78页 |
·IGFBP-4 mRNA 表达与卵巢卵泡发育的关系 | 第78-80页 |
试验四 鸡卵巢组织不同时期差异表达基因的克隆 | 第80-95页 |
1 试验材料 | 第80页 |
2 试验方法 | 第80-83页 |
·总RNA 的提取 | 第80页 |
·DDRT-PCR | 第80-82页 |
·差异显示引物 | 第80页 |
·逆转录合成 cDNA 第一链 | 第80-81页 |
·DD-PCR | 第81页 |
·6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第81页 |
·差异片段的回收和二次扩增 | 第81-82页 |
·二次扩增差异片段的纯化、克隆和测序 | 第82页 |
·半定量RT-PCR | 第82页 |
·统计分析 | 第82-83页 |
3 结果 | 第83-90页 |
·提取总 RNA 的检测 | 第83页 |
·DDRT-PCR | 第83-84页 |
·差异表达片段的回收和二次扩增 | 第84页 |
·差异显示片段测序 | 第84页 |
·差异表达基因检索 | 第84-85页 |
·半定量RT-PCR 验证差异表达基因 | 第85-90页 |
4 讨论 | 第90-95页 |
·鸡基因组与差异表达基因的生物信息学分析 | 第90-91页 |
·鸡卵巢组织差异表达基因 | 第91-95页 |
·肿瘤蛋白D52 样蛋白2 | 第91-92页 |
·DNAJC8 | 第92-93页 |
·LDHB | 第93页 |
·其他基因 | 第93-95页 |
结论 | 第95-96页 |
参考文献 | 第96-107页 |
附录 | 第107-111页 |
致谢 | 第111页 |