| 第一章 绪论 | 第1-15页 |
| ·人类基因组计划(HGP) 和模式生物基因组计划 | 第8-10页 |
| ·生物信息学 | 第10-11页 |
| ·原核生物基因组和原核生物基因识别 | 第11-12页 |
| ·与本论文相关的生物学知识 | 第12-15页 |
| 第二章 DNA序列的Z曲线方法 | 第15-20页 |
| ·DNA序列的Z曲线方法 | 第15-17页 |
| ·Z曲线方法的应用 | 第17-20页 |
| 第三章 ZCURVE 1.02 原核生物基因识别程序的研发 | 第20-33页 |
| ·引言 | 第20-21页 |
| ·ZCURVE 1.02 程序的组成 | 第21-27页 |
| ·寻找种子ORFs (seed ORFs) 和候选ORFs | 第22-24页 |
| ·基因识别的核心算法 | 第24-26页 |
| ·排除重叠ORFs的方法 | 第26-27页 |
| ·结果和讨论 | 第27-32页 |
| ·基因预测能力的评价指标 | 第27页 |
| ·比较ZCURVE 1.02 和ZCURVE 1.0 以及Glimmer 2.02 | 第27-32页 |
| ·ZCURVE 1.02 的一些特点 | 第32-33页 |
| 第四章 微生物必需基因的分析 | 第33-42页 |
| ·引言 | 第33页 |
| ·微生物必需基因数据库(DEG) 的描述 | 第33-35页 |
| ·微生物必需基因数据的采集和DEG 1.1 的研发 | 第33-34页 |
| ·微生物必需基因数据库的应用 | 第34-35页 |
| ·必需基因和非必需基因的核苷酸分布 | 第35-37页 |
| ·微生物必需基因的预测 | 第37-42页 |
| ·材料和方法 | 第37-39页 |
| ·结果和讨论 | 第39-40页 |
| ·总结 | 第40-42页 |
| 参考文献 | 第42-47页 |
| 发表论文和科研情况说明 | 第47-48页 |
| 附录 | 第48-55页 |
| 致谢 | 第55页 |
