| 中文摘要 | 第1-4页 |
| 英文摘要 | 第4-9页 |
| 1 前言 | 第9-24页 |
| ·五针松在中国的分布 | 第9-11页 |
| ·红松的分布 | 第10页 |
| ·华山松的分布 | 第10页 |
| ·偃松的分布 | 第10页 |
| ·西伯利亚红松的分布 | 第10-11页 |
| ·乔松，华南五针松，海南五针松的分布 | 第11页 |
| ·台湾五针松，台湾果松的分布 | 第11页 |
| ·大别山五针松的分布 | 第11页 |
| ·五针松的经济价值 | 第11-12页 |
| ·红松 | 第11-12页 |
| ·华山松 | 第12页 |
| ·偃松 | 第12页 |
| ·西伯利亚红松 | 第12页 |
| ·五针松的研究概况 | 第12-15页 |
| ·五针松地理起源的研究 | 第12-13页 |
| ·五针松比较形态学研究 | 第13-14页 |
| ·五针松树脂道类型 | 第13-14页 |
| ·松属种鳞排列模式研究 | 第14页 |
| ·分子标记在五针松分类中的应用 | 第14-15页 |
| ·ISSR分子标记技术 | 第15-17页 |
| ·ISSR分子标记的原理 | 第15-16页 |
| ·ISSR分子标记的优点 | 第16页 |
| ·ISSR分子标记的应用 | 第16-17页 |
| ·用于分子系统学研究的主要基因种类及其进化规律 | 第17-21页 |
| ·叶绿体基因组 | 第17-18页 |
| ·线粒体基因组 | 第18-19页 |
| ·核基因组中常用的核糖体内转录间隔区(ITS) | 第19-21页 |
| ·利用rDNA的ITS序列进行系统发育研究的原理 | 第19-20页 |
| ·rDNA的ITS序列在系统发育研究中的应用 | 第20-21页 |
| ·目前五针松系统分类中存在的问题 | 第21-23页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第23-24页 |
| 2 材料与方法 | 第24-41页 |
| ·实验方案 | 第24页 |
| ·实验材料及仪器、试剂 | 第24-28页 |
| ·材料 | 第24-25页 |
| ·主要仪器与试剂 | 第25-26页 |
| ·主要仪器 | 第25-26页 |
| ·主要试剂 | 第26页 |
| ·所用溶液及配制 | 第26-28页 |
| ·实验方法 | 第28-41页 |
| ·ISSR实验方法 | 第28-32页 |
| ·五针松基因组DNA的提取 | 第28-29页 |
| ·ISSR反应体系的建立 | 第29-30页 |
| ·ISSR反应扩增程序 | 第30页 |
| ·ISSR-PCR引物筛选及PCR产物的检测 | 第30页 |
| ·ISSR-PCR扩增产物的电泳检测 | 第30页 |
| ·ISSR谱带的记录 | 第30-31页 |
| ·ISSR数据的统计分析 | 第31-32页 |
| ·五针松的ITS序列测定方法 | 第32-41页 |
| ·ITS-1和ITS-2序列PCR扩增 | 第32-33页 |
| ·ITS-1和ITS-2序列扩增产物回收 | 第33页 |
| ·ITS-1和ITS-2序列的克隆 | 第33-37页 |
| ·ITS-1和ITS-2的序列测定 | 第37-39页 |
| ·ITS-1和ITS-2序列的分析 | 第39-40页 |
| ·五针松ITS区段基因的系统发育学分析 | 第40-41页 |
| 3 结果与分析 | 第41-54页 |
| ·五针松ISSR分析 | 第41-44页 |
| ·五针松总DNA的提取 | 第41页 |
| ·多态位点比率 | 第41-43页 |
| ·有效等位基因数ne~* | 第43页 |
| ·利用Shannon指数估测五针松各种群的遗传多样性 | 第43页 |
| ·利用Nei指数估测五针松种间及种内的遗传分化 | 第43页 |
| ·五针松种间遗传一致度与遗传聚类分析 | 第43-44页 |
| ·五针松ITS序列分析 | 第44-54页 |
| ·五针松ITS-1和ITS-2特异性引物设计 | 第44-46页 |
| ·五针松ITS-1和ITS-2 PCR扩增 | 第44-45页 |
| ·五针松ITS-1和ITS-2 PCR产物直接测序分析 | 第45页 |
| ·ITS序列的突变位点和信息位点的分析 | 第45-46页 |
| ·DNA重组体的构建及初步筛选 | 第46页 |
| ·重组质粒的PCR检测鉴定结果 | 第46-47页 |
| ·五针松的ITS-1和ITS-2序列 | 第47-49页 |
| ·不同地区同一树种序列分析 | 第49页 |
| ·ITS-1和ITS-2区序列变异性 | 第49-50页 |
| ·ITS-1、5.8S rDNA和ITS-2序列测定结果 | 第49页 |
| ·ITS序列长度及变异 | 第49-50页 |
| ·13种五针松的ITS序列的同源性及转换／颠换分析 | 第50页 |
| ·基于ITS-1和ITS-2区段基因的系统发育学分析 | 第50-54页 |
| ·13种五针松总ITS基因的系统发育学分析 | 第50-52页 |
| ·20种五针松总ITS基因的系统发育学分析 | 第52-54页 |
| 4 讨论 | 第54-60页 |
| ·ITS序列分析长度的选择 | 第54页 |
| ·各种五针松ITS序列的变异 | 第54-55页 |
| ·聚类结果分析 | 第55-60页 |
| ·偃松与乔松类群形态结构相似属“同源”还是“趋同进化” | 第56页 |
| ·华山松属于乔松类群，还是红松类群 | 第56-57页 |
| ·美国白皮松的归属问题 | 第57-58页 |
| ·墨西哥五针松与哪种五针松亲缘关系近 | 第58页 |
| ·日本五针松的归属问题 | 第58-59页 |
| ·西伯利亚红松与瑞士石松，山白松与北美乔松的亲缘关系最近 | 第59-60页 |
| 5 结论 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-68页 |
| 附页 | 第68-83页 |
| 致谢 | 第83页 |
