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重金属铅胁迫下玉米苗期根系miRNA的鉴定及相关miRNA的表达分析

摘要第1-6页
英文摘要第6-12页
第一部分 文献综述第12-30页
 1 重金属污染第12-17页
   ·重金属的来源、毒性及其危害第12页
   ·重金属铅第12-13页
     ·铅污染的来源第12-13页
     ·铅对人体的危害第13页
   ·重金属在作物体内的积累第13-14页
   ·重金属对作物生长发育的影响第14-16页
     ·重金属对作物外部形态的影响第14-15页
     ·重金属对作物生理生化的影响第15-16页
   ·重金属胁迫下作物的抗性机理研究第16-17页
     ·作物对重金属胁迫的避性第16-17页
     ·作物对重金属胁迫的耐性第17页
 2 miRNA概述第17-28页
   ·miRNA的发现及研究第17-19页
   ·植物miRNA的特征第19页
   ·植物miRNA的功能第19-24页
     ·miRNA与植物生长发育第20-21页
       ·miRNA对根发育的影响第20页
       ·miRNA对茎和叶发育的影响第20-21页
       ·miRNA对花发育的影响第21页
     ·miRNA对植物生长素信号的调控第21-22页
     ·miRNA与逆境胁迫第22-23页
     ·重金属胁迫相关miRNA的研究进展第23-24页
   ·植物miRNA的研究方法第24-28页
     ·miRNA的鉴定第24-26页
       ·miRNA克隆第24页
       ·miRNA芯片法第24-25页
       ·生物信息学预测miRNA第25页
       ·深度测序技术第25-26页
     ·miRNA的表达分析方法第26-27页
       ·应用杂交方法的miRNA表达检测第26-27页
       ·实时荧光定量PCR检测第27页
     ·miRNA的功能分析方法第27-28页
 3 本研究的目的与意义第28-29页
 4 试验技术路线第29-30页
第二部分 材料与方法第30-44页
 1 试验材料第30-32页
   ·供试玉米材料第30页
   ·酶与生化试剂第30页
     ·试剂盒第30页
     ·主要酶类和相关试剂第30页
   ·PCR引物第30-31页
     ·实时荧光定量PCR引物第30-31页
     ·半定量RT-PCR引物第31页
   ·使用的数据库和软件第31页
   ·主要仪器设备第31-32页
 2 试验方法第32-44页
   ·Solexa深度测序第32-35页
     ·材料的培养及处理第32页
     ·材料总RNA的制备第32-33页
     ·测序原理第33-35页
       ·试验流程第33页
       ·信息分析流程第33-35页
   ·深度测序结果的生物信息学分析第35页
     ·序列的初步分析第35页
     ·根系中鉴定的miRNA第35页
     ·miRNA的靶基因预测第35页
   ·Pb胁迫下玉米根系miRNA及其靶基因的表达分析第35-44页
     ·材料的培养及处理第35-36页
     ·荧光定量PCR检测miRNA的表达模式第36-41页
       ·小分子RNA(≤200 nt)的提取第36-37页
       ·候选miRNA的荧光定量PCR验证及表达分析第37-41页
     ·miRNA靶基因的半定量RT-PCR分析第41-44页
       ·总RNA的提取第41页
       ·cDNA第一链合成第41-42页
       ·模板均一化第42-43页
       ·靶基因半定量RT-PCR检测第43-44页
第三部分 结果与分析第44-72页
 1 Pb胁迫下玉米根系小分子RNA的深度测序第44-61页
   ·小分子RNA的序列信息第44-45页
   ·根系中已知的miRNA分析第45-53页
     ·根系中保守的miRNA及前体分析第45页
     ·根系中保守miRNA的丰度分析第45-46页
     ·根系中已知miRNA的靶基因预测第46-53页
   ·根系中新发现的miRNA分析第53-61页
     ·根系中新发现的miRNA及前体分析第53-54页
     ·miRNA家族的同源性及保守性分析第54-56页
     ·根系中新发现的miRNA的靶基因预测第56-61页
 2 Pb胁迫下玉米根系相关miRNA及靶基因的表达分析第61-72页
   ·候选miRNA的荧光定量PCR分析第61-69页
     ·≤200 nt的小分子RNA的检测第61-62页
     ·miRNA的真实性鉴定第62-63页
     ·候选miRNA的荧光定量PCR分析第63-69页
       ·5s rRNA和miRNA加尾产物扩增熔解曲线第63页
       ·荧光定量标准曲线第63页
       ·miRNA的相对定量表达第63-69页
         ·zma-root-miR24的相对表达量第64-65页
         ·zma-root-miR65的相对表达量第65-66页
         ·zma-root-miR69的相对表达量第66页
         ·zma-root-miR71的相对表达量第66-67页
         ·zma-root-miR95的相对表达量第67-68页
         ·zma-root-miR149的相对表达量第68-69页
   ·候选miRNA靶基因的半定量RT-PCR分析第69-72页
     ·总RNA的检测第69-70页
     ·cDNA第一链合成第70页
     ·模板均一化第70页
     ·靶基因半定量RT-PCR结果第70-72页
第四部分 讨论第72-83页
 1 miRNA的鉴定方法比较第72-73页
 2 Pb胁迫下玉米根系miRNA第73-75页
 3 miRNA的靶基因预测第75-78页
 4 几个与Pb胁迫相关的miRNA及靶基因的表达分析第78-80页
   ·zma-root-miR69第78页
   ·zma-root-miR71第78-79页
   ·zma-root-miR95第79页
   ·zma-root-miR149第79-80页
 5 玉米根系响应重金属Pb胁迫可能的机制第80-81页
 6 今后的研究方向第81-83页
第五部分 结论第83-85页
参考文献第85-102页
致谢第102-104页
博士在读期间发表的论文第104页

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