| 内容提要 | 第1-7页 |
| 前言 | 第7-8页 |
| 第一部分 分子动力学模拟研究AtERFs亚家族间DNA结合特异性 | 第8-24页 |
| 第一章 绪论 | 第8-11页 |
| 一、乙烯反应元件结合因子 | 第8-9页 |
| 二、分子动力学 | 第9-10页 |
| 三、研究目地和内容 | 第10-11页 |
| 第二章 材料与方法 | 第11-13页 |
| 一、实验材料 | 第11页 |
| 二、计算模拟方法 | 第11-13页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第13-20页 |
| 一、整体结构特性 | 第13-15页 |
| 二、蛋白与DNA的相互作用 | 第15-18页 |
| 三、保守氨基酸在DNA识别中的作用 | 第18-19页 |
| 四、GCCGCC模体中的关键位点 | 第19-20页 |
| 第四章 总结 | 第20-21页 |
| 参考文献 | 第21-24页 |
| 第二部分 DREBs调节靶基因的预测 | 第24-74页 |
| 第一章 绪论 | 第24-37页 |
| 一、基因的表达调控 | 第25-26页 |
| 二、转录因子调节靶基因的识别 | 第26-36页 |
| 三、DREBs家族 | 第36页 |
| 四、研究目地和意义 | 第36-37页 |
| 第二章 材料和方法 | 第37-45页 |
| 一、实验材料 | 第37页 |
| 二、计算方法 | 第37-45页 |
| 第三章 结果 | 第45-66页 |
| 一、数据集构建 | 第45-47页 |
| 二、实验流程设计 | 第47页 |
| 三、DFSs序列中显著出现的hexamers | 第47-50页 |
| 四、SVM分类器参数优化和性能评估 | 第50-51页 |
| 五、DREBs调节靶基因的预测 | 第51-62页 |
| 六、靶基因在非生物逆境条件下的表达 | 第62-64页 |
| 七、基因本体（GO）分析 | 第64-66页 |
| 第四章 讨论 | 第66-68页 |
| 第五章 总结 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-74页 |
| 攻读博士期间发表及待发表文章 | 第74-75页 |
| 致谢 | 第75-76页 |
| 中文摘要 | 第76-79页 |
| Abstract | 第79-81页 |