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不同盐碱胁迫条件下玉米根部基因的差异表达谱分析

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
第一章 绪论第11-24页
   ·我国盐碱地概况第11-13页
     ·我国盐碱地的分布与分类第11页
     ·盐碱土的改良和利用第11-13页
   ·盐碱胁迫对植物产生的危害第13-14页
     ·盐碱胁迫引起植物的生理干旱第13页
     ·盐碱胁迫对植物代谢的影响第13-14页
     ·盐碱胁迫对植物膜结构的影响第14页
   ·植物的耐盐碱机制第14-17页
     ·植物的渗透调节第15页
     ·植物的离子调节第15-16页
     ·植物的抗氧化调节第16-17页
   ·玉米转录组的研究进展第17-18页
   ·转录组学的研究方法第18-22页
     ·传统的研究方法第18-19页
     ·基于新一代测序技术的研究方法第19-22页
   ·数据分析方法第22-23页
   ·本研究的目的和意义第23-24页
第二章 材料与方法第24-32页
   ·实验材料第24-25页
     ·植物材料第24页
     ·主要仪器第24页
     ·主要试剂第24-25页
     ·引物合成和表达谱测序第25页
   ·实验方法第25-32页
     ·玉米幼苗培养和处理第25-26页
     ·玉米根部总 RNA 的提取第26页
     ·数字基因表达谱测序第26-27页
     ·测序结果的生物信息学分析第27-29页
     ·荧光定量 PCR第29-32页
第三章 实验结果第32-57页
   ·胁迫模型的建立第32-33页
   ·RNA 提取及质量检测第33-34页
   ·测序评估结果分析第34-39页
     ·数据比对统计第34-35页
     ·测序 reads 质量评估第35-36页
     ·测序饱和度分析第36-37页
     ·测序随机性的统计分析第37-38页
     ·Reads 在参考基因组上的分布第38-39页
   ·基因表达量统计第39-41页
   ·差异表达基因筛选第41-46页
     ·差异表达基因统计第41-45页
     ·不同胁迫条件之间的差异表达基因第45-46页
   ·GO 功能显著性富集分析第46-51页
   ·Pathway 显著性富集分析第51-52页
   ·荧光定量 PCR 验证第52-57页
第四章 实验讨论第57-60页
   ·玉米水培模型的建立第57-58页
   ·数字基因表达谱测序技术在差异基因组学研究中的应用第58页
   ·不同盐碱胁迫条件下差异表达基因的分析第58-60页
第五章 结论第60-61页
参考文献第61-66页
致谢第66页

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