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鸭瘟病毒UL51基因部分特性及其基因工程蛋白应用的研究

本论文的创新性工作第1-14页
中文摘要第14-17页
ABSTRACT第17-21页
常用英文缩写词汇第21-23页
第一部分 文献综述第23-35页
 第一章 疱疹病毒UL51基因及其编码蛋白的研究进展第23-35页
  1. 疱疹病毒UL51基因的特点第25-27页
   ·疱疹病毒UL51基因在基因组中定位第25-27页
   ·疱疹病毒UL51基因的类型第27页
  2. 疱疹病毒UL51基因编码蛋白的特点第27-29页
   ·UL51基因编码蛋白的表达和基本特性第27-28页
   ·UL51基因编码蛋白的定位特性第28-29页
     ·UL51蛋白的亚细胞定位第28-29页
     ·UL51蛋白在病毒自身内的定位第29页
  3. 疱疹病毒UL51蛋白的功能第29-32页
   ·疱疹病毒的装配概述第29-30页
   ·疱疹病毒皮层蛋白的功能概述第30-32页
   ·疱疹病毒UL51蛋白功能的研究进展第32页
  4. 疱疹病毒UL51蛋白与其它蛋白的相互作用第32-34页
  5. 展望第34-35页
第二部分 实验研究第35-171页
 第二章 DPV UL51基因的序列特征及密码子偏爱性分析第35-52页
  摘要第35-36页
  1. 试验数据第36页
  2. 试验方法第36-38页
   ·DPV UL51基因的生物信息学分析方法第36-37页
   ·DPV UL51基因的密码子偏爱性分析方法第37-38页
  3. 试验结果第38-48页
   ·DPV UL51蛋白质序列生物信息学分析第38-44页
     ·DPV UL51基因编码蛋白的保守结构区第38-39页
     ·DPV UL51基因的系统进化分析第39-40页
     ·DPV UL51基因编码蛋白的基本理化性质第40-41页
     ·DPV UL51基因编码蛋白的亚细胞定位分析结果第41-42页
     ·DPV UL51蛋白翻译后修饰预测第42-43页
     ·DPV UL51蛋白的疏水性分析第43页
     ·DPV UL51蛋白的抗原性分析第43-44页
     ·DPV UL51蛋白的二级结构分析第44页
     ·DPV UL51蛋白的三级结构分析第44页
   ·DPV UL51基因密码子偏爱性分析第44-48页
     ·DPV与17种疱疹病毒间UL51基因密码子使用偏爱分析第44-45页
     ·DPV UL51基因密码子使用频率和氨基酸组成偏爱分析第45-47页
     ·DPV UL51基因与大肠杆菌、酵母及人的密码子使用偏爱性比较第47-48页
  4. 讨论第48-51页
   ·DPV UL51蛋白与其它α-疱疹病毒UL51蛋白的系统进化关系第48页
   ·DPV UL51蛋白一般理化特征第48页
   ·DPV UL51蛋白亚细胞定位预测第48-49页
   ·DPV UL51蛋白翻译后修饰第49页
   ·DPV UL51蛋白的抗原性和高级结构特点第49-50页
   ·DPV UL51基因密码子偏爱性分析及其对表达的影响第50-51页
  5. 小结第51页
  Abstract第51-52页
 第三章 鸭瘟病毒UL51基因的克隆、原核表达、产物纯化及其多克隆抗体制备第52-72页
  摘要第52页
  1. 试验材料第52-56页
   ·菌株、质粒和毒株第52-54页
   ·试验动物第54页
   ·主要试剂及其配制第54-56页
     ·基因克隆表达相关试剂第54-55页
     ·SDS-PAGE电泳相关试剂第55页
     ·琼脂糖电泳相关试剂第55页
     ·弗氏佐剂第55-56页
   ·主要仪器设备第56页
  2. 试验方法第56-63页
   ·DPV UL51基因的克隆第56-58页
     ·引物设计第56页
     ·DPV基因组DNA的提取第56-57页
     ·PCR扩增DPV UL51基因第57页
     ·UL51基因PCR产物的回收第57页
     ·纯化的UL51基因与pMD18-T的连接第57页
     ·DH5a感受态细胞的制备第57-58页
     ·转化感受态细胞第58页
     ·质粒的抽提第58页
     ·重组质粒的PCR和酶切鉴定第58页
     ·UL51基因序列测定第58页
   ·原核表达质粒pET28a-UL51的构建、诱导表达与条件优化第58-61页
     ·原核表达质粒pET28a-UL51的构建与鉴定第58-59页
     ·重组表达质粒pET28a-UL51的诱导表达第59-60页
     ·重组质粒pET28a-UL5 1诱导条件的优化第60-61页
   ·重组UL51蛋白的大量制备、纯化与复性第61页
     ·重组UL51蛋白的大量制备(包涵体处理)第61页
     ·重组UL51蛋白的纯化第61页
     ·重组UL51蛋白的复性第61页
   ·兔抗重组UL51蛋白抗体的制备、效价测定与纯化第61-63页
     ·兔抗重组UL51蛋白高免血清的制备第61-62页
     ·兔抗重组UL51蛋白高免血清效价测定第62页
     ·兔抗重组UL51蛋白抗体IgG的纯化第62-63页
  3. 试验结果第63-69页
   ·DPV UL51基因的扩增、T-克隆与鉴定结果第63-64页
     ·UL51基因的PCR扩增结果第63页
     ·UL51基因T克隆鉴定结果第63-64页
   ·原核表达质粒pET28a-UL51的构建与鉴定、诱导表达及其优化结果第64-67页
     ·重组表达质粒pET28a-UL51的构建与酶切鉴定第64-65页
     ·重组质粒pET28a-UL51的诱导表达第65页
     ·重组质粒pET28a-UL51诱导表达条件的优化第65-67页
   ·重组UL51蛋白的纯化结果第67-68页
   ·兔抗重组UL51蛋白抗体的效价测定与纯化结果第68-69页
     ·兔抗重组UL51蛋白高免血清效价测定第68页
     ·兔抗重组UL51蛋白抗体IgG的纯化第68-69页
  4. 讨论第69-71页
   ·基因的引物设计和克隆测序第69-70页
   ·表达系统的选择第70页
   ·疱疹病毒UL51基因的原核表达第70页
   ·兔抗重组UL51蛋白抗体的制备和纯化第70-71页
  5. 小结第71页
  Abstract第71-72页
 第四章 鸭瘟病毒UL51基因在感染宿主细胞中的转录和表达特征第72-85页
  摘要第72页
  1 试验材料第72-73页
   ·病毒和抗体第72页
   ·试验动物第72页
   ·主要试剂及其配制第72-73页
     ·细胞培养相关试剂第72-73页
     ·Western blotting相关试剂第73页
   ·主要仪器和用品第73页
  2 试验方法第73-77页
   ·荧光定量RT-PCR方法检测DPV UL51基因在感染宿主细胞中的转录时相第73-76页
     ·引物设计与合成第73-74页
     ·细胞培养及采样第74页
     ·总RNA提取第74页
     ·去除RNA中的DNA第74页
     ·RNA完整性及纯度测定第74页
     ·逆转录第74-75页
     ·目的片段的PCR扩增及回收第75页
     ·荧光定量PCR第75-76页
     ·荧光定量PCR扩增标准曲线的建立第76页
     ·数据分析和处理第76页
   ·Western blotting检测DPV UL51基因在感染宿主细胞中的表达时相第76-77页
     ·细胞培养及采样时间第76页
     ·细胞样品处理和SDS-PAGE电泳第76页
     ·Western blotting检测第76-77页
   ·Westem blotting检测DPV UL51基因表达产物是否为DPV粒子的组成成分第77页
     ·细胞培养及病毒纯化第77页
     ·Westem blotting检测第77页
  3 试验结果第77-81页
   ·DPV UL51基因在宿主细胞中的转录时相分析结果第77-80页
     ·RNA完整性及纯度分析第77-78页
     ·RT-PCR检测第78页
     ·荧光定量PCR检测标准曲线的建立第78-79页
     ·DPV UL51基因在宿主细胞中的转录量分析第79-80页
   ·DPV UL51基因在宿主细胞中的表达时相分析结果第80-81页
     ·细胞蛋白的提取及SDS-PAGE检测第80页
     ·DPV UL51基因产物在宿主细胞中的表达时相分析第80-81页
   ·DPV UL51基因表达产物是DPV粒子的一种组成成分第81页
  4 讨论第81-84页
   ·DPV UL51基因在宿主细胞中的转录时相分析第81-83页
     ·实时荧光定量RT-PCR方法检测DPV UL51基因在宿主细胞中的转录时相方法的建立与优化第81-82页
     ·疱疹病毒UL51基因转录时相的比较第82-83页
   ·DPV UL51基因在宿主细胞中的表达时相分析第83-84页
     ·Western blotting方法检测DPV UL51基因在宿主细胞中的表达时相分析第83页
     ·疱疹病毒UL51蛋白表达时相的比较第83-84页
  5 小结第84页
  Abstract第84-85页
 第五章 鸭瘟病毒UL51蛋白在病毒感染细胞中的定位第85-97页
  摘要第85页
  1 试验材料第85-86页
   ·病毒、抗体和细胞第85页
   ·主要试剂及其配制第85-86页
     ·细胞固定液第86页
     ·封片剂第86页
   ·主要仪器和用品第86页
  2 试验方法第86-89页
   ·间接免疫荧光检测DPV UL51蛋白细胞内的定位第86-87页
     ·间接免疫荧光检测DPV UL51蛋白细胞内的定位方法的建立第86页
     ·间接免疫荧光检测DPV UL51蛋白的细胞内定位方法的条件优化第86-87页
     ·特异性检测第87页
     ·免疫荧光检测结果判定第87页
     ·间接免疫荧光检测DPV UL51蛋白的细胞内定位的动态监测第87页
   ·胶体金免疫电镜法检测DPV UL51蛋白的亚细胞定位第87-89页
     ·胶体金免疫电镜法检测DPV UL51蛋白的亚细胞定位方法的建立第87-88页
     ·胶体金免疫电镜法检测DPV UL51蛋白亚细胞定位方法的条件优化第88页
     ·特异性试验第88页
     ·胶体金免疫电镜法检测结果判定第88页
     ·胶体金免疫电镜法检测DPV UL51蛋白在病毒感染细胞中的亚细胞定位的动态监测第88-89页
  3 结果第89-94页
   ·间接免疫荧光检测DPV UL51蛋白细胞内的定位第89-92页
     ·间接免疫荧光检测DPV UL51蛋白的细胞内定位方法的建立及优化第89-90页
     ·特异性试验第90页
     ·间接免疫荧光法检测UL51蛋白在DPV感染细胞中的定位动态第90-92页
   ·胶体金免疫电镜法检测DPV UL51蛋白的亚细胞定位第92-94页
     ·胶体金免疫电镜法检测DPV UL51蛋白的亚细胞定位方法的建立及优化第92-93页
     ·特异性试验第93页
     ·胶体金免疫电镜法检测DPV UL51蛋白在DPV病毒感染的细胞中的亚细胞定位动态第93-94页
  4 讨论第94-96页
   ·特定蛋白在细胞定位的方法简介第94-95页
   ·DPV UL51基因表达产物在宿主细胞定位与病毒增殖的关系分析第95页
   ·疱疹病毒UL51蛋白的亚细胞定位与其功能的关系第95-96页
  5 小结第96页
  Abstract第96-97页
 第六章 用免疫组化方法检测DPV UL51蛋白在人工感染鸭组织中的定位和动态分布第97-123页
  摘要第97-98页
  1. 试验材料第98-99页
   ·毒株和抗体第98页
   ·试验动物第98页
   ·主要试剂及其配制第98页
     ·组织固定、脱水和包埋第98页
     ·所需主要溶液的配置第98页
     ·免疫酶组化SP法所需试剂第98页
     ·免疫荧光所需试剂第98页
   ·主要仪器设备第98-99页
  2. 试验方法第99-102页
   ·人工感染动物试验第99页
     ·试验分组第99页
     ·人工感染及样品的采集、固定、包埋和切片第99页
   ·免疫酶组织化学检测DPV UL51蛋白组织定位方法的建立及优化第99-101页
     ·免疫酶组织化学检测DPV UL51蛋白组织定位方法的建立第99-100页
     ·免疫酶组织化学检测DPV UL51蛋白组织定位条件的优化第100页
     ·特异性试验第100页
     ·免疫酶组织化学法的检测结果判定第100-101页
     ·免疫酶组织化学检测DPV UL51蛋白在人工感染鸭各组织中的定位和动态分布第101页
   ·间接免疫荧光检测DPV UL51蛋白组织定位方法的建立与优化第101-102页
     ·间接免疫荧光检测DPV UL51蛋白组织定位方法的建立第101页
     ·间接免疫荧光检测DPV UL51蛋白组织定位条件的优化第101页
     ·特异性试验第101-102页
     ·免疫荧光检测结果判定第102页
     ·间接免疫荧光检测石蜡切片中DPV UL51蛋白在人工感染鸭各组织中的定位和动态分布第102页
  3. 试验结果第102-118页
   ·人工感染DP强毒后鸭的临床症状及大体解剖病理变化第102-104页
   ·免疫酶组织化学检测DPV UL51蛋白在鸭组织中的定位与分布第104-111页
     ·免疫酶组化检测DPV UL51蛋白组织定位方法的优化结果第104页
     ·异性试验第104页
     ·免疫酶组织化学检测DPV UL51蛋白在人工感染鸭各组织中的定位和动态分布结果第104-111页
   ·间接免疫荧光检测DPV UL51蛋白在鸭组织中的定位与分布第111-118页
     ·间接免疫荧光检测DPV UL51蛋白组织定位方法的优化结果第111页
     ·异性试验第111页
     ·间接免疫荧光检测DPV UL51蛋白在人工感染鸭各组织中的定位和动态分布结果第111-118页
  4. 讨论第118-122页
   ·免疫酶组化和间接免疫荧光检测DPV UL51蛋白的定位方法的建立与优化第118-120页
     ·免疫酶组化法检测DPV UL51蛋白的定位方法的建立与优化第118-119页
     ·间接免疫荧光法检测DPV UL51蛋白的定位方法的建立与优化第119-120页
   ·免疫酶组化和间接免疫荧光检测DPV UL51蛋白在人工感染鸭各组织中的定位与分布结果及二者的比较第120-122页
     ·免疫酶组化法检测DPV UL51蛋白在人工感染鸭各组织中的定位与分布结果第120-121页
     ·间接免疫荧光法检测DPV UL51蛋白在人工感染鸭各组织中的定位与分布结果第121-122页
     ·不同方法检测DPV UL51蛋白在人工感染鸭体内的定位及分布规律比较第122页
  5. 小结第122页
  Abstract第122-123页
 第七章 基于重组UL51蛋白的间接ELISA法和胶体金免疫层析试纸条法检测鸭瘟病毒抗体的研究和应用第123-140页
  摘要第123-124页
  1 试验材料第124-125页
   ·菌株、毒株和血清第124页
   ·主要试剂第124页
     ·ELISA相关溶液第124页
   ·主要仪器及用品第124-125页
  2 试验方法第125-129页
   ·重组UL51蛋白的大量制备和纯化第125页
     ·菌体发酵培养第125页
     ·重组ULL51蛋白的包涵体洗涤法大量纯化第125页
     ·重组UL51蛋白的复性和检测第125页
   ·UL51-ELISA法检测DPV抗体方法的建立第125-127页
     ·最佳抗原包被浓度的确定第125-126页
     ·待检血清和酶标二抗最佳稀释度的确定第126页
     ·UL51-ELISA方法的检测程序第126页
     ·UL51-ELISA阴阳性临界值的确定第126页
     ·敏感性试验第126页
     ·特异性试验第126页
     ·重复性试验第126-127页
   ·UL51-ICS法检测DPV抗体方法的建立第127-129页
     ·ICS的组装第127页
     ·UL51-ICS法的原理和结果判定第127-128页
     ·UL51-ICS法的最佳试验条件的优化第128-129页
     ·敏感性试验第129页
     ·特异性试验第129页
     ·重复性试验第129页
     ·稳定性试验第129页
   ·UL51-ELISA法和UL51-ICS法检测DPV抗体的应用第129页
  3 结果第129-135页
   ·纯化的重组UL51蛋白的检测结果第129-130页
   ·UL51-ELISA法的建立第130-133页
     ·最佳抗原包被浓度确定的结果第130页
     ·待检血清和酶标抗体最适度的确定第130-131页
     ·ELISA阴阳性临界值的确定第131-132页
     ·敏感性试验第132页
     ·特异性试验结果第132-133页
     ·重复性试验结果第133页
   ·UL51-ICS方法的建立第133-135页
     ·UL51-ICS法检测DPV抗体法的条件优化第133-134页
     ·敏感性试验结果第134页
     ·特异性试验结果第134-135页
     ·重复性试验结果第135页
     ·稳定性试验结果第135页
   ·地方血清样品检测结果第135页
  4 讨论第135-138页
   ·重组蛋白的优点及应用第135-136页
   ·UL51-ELISA法的建立与优化第136-137页
   ·UL51-ICS方法的建立与优化第137-138页
   ·UL51-ELISA法、UL51-ICS法、DPV-ELISA法和NT法的比较第138页
  5 小结第138-139页
  Abstract第139-140页
 第八章 基于抗重组UL51蛋白抗体的抗原捕获ELISA法和胶体金免疫层析试纸条法检测DPV的研究和应用第140-156页
  摘要第140页
  1 试验材料第140-141页
   ·蛋白、毒株和泄殖腔棉拭纸第140-141页
   ·实验动物第141页
   ·主要试剂第141页
   ·主要仪器及用品第141页
  2 试验方法第141-146页
   ·抗重组UL51蛋白多克隆抗体的制备和纯化第141-142页
     ·兔抗重组UL51蛋白多克隆抗体的制备和纯化第141页
     ·鼠抗重组UL51蛋白多克隆抗体的制备、纯化和胶体金标记第141-142页
   ·样品的处理第142页
     ·细胞培养液、鸭胚尿囊液或菌体培养液的处理第142页
     ·泄殖腔棉拭子样品的处理第142页
   ·基于抗重组UL51蛋白抗体的AC-ELISA法检测DPV方法的建立第142-143页
     ·最佳鼠抗重组UL51蛋白抗体IgG和兔抗重组UL51蛋白抗体IgG工作浓度的确定第142-143页
     ·酶标抗体最适浓度的确定第143页
     ·阴阳性临界值的确定第143页
     ·敏感性试验第143页
     ·灵敏度试验第143页
     ·重复性试验第143页
   ·基于抗重组UL51蛋白抗体的ICS法的建立第143-146页
     ·胶体金标记的兔抗重组UL51蛋白抗体的制备第143-144页
     ·ICS的组装第144页
     ·ICS法的原理和结果判定第144-145页
     ·试纸条最佳试验条件的优化第145页
     ·敏感性试验第145页
     ·特异性试验第145页
     ·重复性试验第145页
     ·稳定性试验第145-146页
   ·基于抗重组UL51蛋白抗体的AC-ELISA法和ICS法检测DPV的应用第146页
  3 结果第146-152页
   ·纯化的重组UL51蛋白抗体的检测结果第146页
   ·基于抗重组UL51蛋白抗体的AC-ELISA方法的建立第146-150页
     ·鼠抗重组UL51蛋白抗体IgG和兔抗重组UL51蛋白抗体IgG最佳工作浓度确定的结果第146-147页
     ·酶标抗体最适浓度的确定结果第147页
     ·阴阳性临界值的确定结果第147-148页
     ·特异性试验第148页
     ·敏感性检测结果第148-149页
     ·重复性试验结果第149-150页
   ·基于抗重组UL51蛋白抗体的ICS法的建立第150-151页
     ·基于抗重组UL51蛋白抗体的ICS法的条件优化第150页
     ·敏感性试验结果第150页
     ·特异性试验第150-151页
     ·重复性试验结果第151页
     ·稳定性试验结果第151页
   ·基于抗重组UL51蛋白抗体的AC-ELISA法和ICS法检测DPV的应用第151-152页
  4 讨论第152-154页
   ·样品处理方法的选择第152页
   ·基于抗重组UL51蛋白抗体的抗原捕获ELISA法的建立与优化第152页
   ·基于抗重组UL51蛋白抗体的ICS方法的建立与优化第152-154页
   ·基于抗重组UL51蛋白抗体的AC-ELISA法、ICS法和常规PCR法的比较第154页
  5 小结第154-155页
  Abstract第155-156页
 第九章 鸭瘟病毒UL51基因真核表达载体的构建及其在COS-7细胞中的瞬时转录和表达特性第156-171页
  摘要第156页
  1 试验材料第156-158页
   ·病毒、菌株、载体、细胞和抗体第156-157页
   ·主要试剂第157-158页
   ·主要仪器和用品第158页
  2 试验方法第158-164页
   ·DPV UL51基因的克隆第158-160页
     ·引物设计第158页
     ·DPV基因组DNA的提取第158页
     ·PCR扩增DPV UL51基因第158-159页
     ·UL51基因PCR产物的回收第159页
     ·纯化的UL51基因与pMD18-T的连接第159页
     ·DH5a感受态细胞的制备第159页
     ·转化感受态细胞第159页
     ·质粒的抽提第159页
     ·重组质粒的PCR和酶切鉴定第159页
     ·UL51基因序列测定第159-160页
   ·真核表达质粒pcDNA3.1-UL51的构建与鉴定第160-161页
     ·目的片段的酶切与连接第160页
     ·重组质粒的转化第160页
     ·重组质粒的酶切和PCR鉴定第160-161页
   ·UL51基因在COS-7细胞中的瞬时转录和表达特性分析第161-164页
     ·重组真核表达载体pcDNA3.1-UL51转染COS-7细胞第161页
     ·荧光定量RT-PCR方法检测UL51基因在COS-7细胞中的瞬时转录第161-163页
     ·Western blotting检测UL51基因在COS-7细胞中的瞬时表达第163页
     ·间接免疫荧光法检测UL51基因表达产物在COS-7细胞中的定位第163-164页
  3 试验结果第164-168页
   ·DPV UL51基因的扩增、T-克隆与鉴定结果第164-165页
     ·UL51基因的PCR扩增结果第164页
     ·UL51基因T克隆鉴定结果第164-165页
   ·真核表达载体pcDNA3.1-UL51的构建与酶切鉴定第165页
   ·UL51基因在COS-7细胞中的转录情况第165-166页
     ·RNA完整性及纯度分析第165-166页
     ·UL51基因在COS-7细胞中的相对转录量分析第166页
   ·UL51基因在COS-7细胞中的表达情况第166-167页
     ·细胞蛋白的提取及SDS-PAGE检测第166-167页
     ·UL51基因表达产物在在COS-7细胞中的表达时相分析第167页
   ·UL51基因表达产物在COS-7细胞中的定位第167-168页
  4 讨论第168-170页
   ·真核表达载体、转染试剂、宿主细胞的选择第168-169页
   ·UL51基因转录和表达产物的检测第169-170页
  5 小结第170页
  Abstract第170-171页
结论第171-173页
参考文献第173-186页
致谢第186-187页
作者简介以及攻读博士学位期间发表的学术论文第187-188页

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