| 摘要 | 第3-5页 |
| abstract | 第5-7页 |
| 前言 | 第12-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-32页 |
| 1.1 植物抗病性研究现状 | 第13-20页 |
| 1.1.1 植物抗病的表现 | 第13页 |
| 1.1.2 植物抗病的分子机制 | 第13-14页 |
| 1.1.3 抗病基因结构与功能 | 第14-16页 |
| 1.1.4 植物NBS抗病基因的结构与功能 | 第16-18页 |
| 1.1.5 植物NBS-LRR基因的起源与进化 | 第18页 |
| 1.1.6 植物抗病基因的克隆 | 第18-19页 |
| 1.1.7 R基因克隆的应用前景 | 第19-20页 |
| 1.2 植物转录组学研究概况 | 第20-24页 |
| 1.2.1 转录组学概念 | 第20页 |
| 1.2.2 常用转录组学研究方法 | 第20-22页 |
| 1.2.3 植物逆境胁迫中的转录组研究 | 第22-24页 |
| 1.2.4 转录组学在植物研究中其它应用 | 第24页 |
| 1.3 生物信息学及数据库 | 第24-26页 |
| 1.3.1 生物信息学研究内容 | 第24-25页 |
| 1.3.2 生物信息学数据库服务系统 | 第25-26页 |
| 1.4 植物病害的检测研究概况 | 第26-32页 |
| 1.4.1 病原体分离培养检测法 | 第26-27页 |
| 1.4.2 免疫学检测方法 | 第27-29页 |
| 1.4.3 分子生物学检测方法 | 第29-32页 |
| 第二章 吉林人参NBS基因家族的结构、进化及表达特征 | 第32-48页 |
| 2.1 材料 | 第32页 |
| 2.2 方法 | 第32-34页 |
| 2.2.1 人参NBS(PgNBS)基因的鉴定 | 第32-33页 |
| 2.2.2 基因注释与功能分类 | 第33页 |
| 2.2.3 进化分析 | 第33页 |
| 2.2.4 蛋白质保守基序分析 | 第33页 |
| 2.2.5 基因表达谱分析 | 第33-34页 |
| 2.3 结果 | 第34-46页 |
| 2.3.1 PgNBS基因的鉴定 | 第34页 |
| 2.3.2 PgNBS基因的分类 | 第34-35页 |
| 2.3.3 PgNBS基因的注释、功能分类和代谢通路 | 第35-36页 |
| 2.3.4 PgNBS基因推导蛋白的NBS结构域分析 | 第36-37页 |
| 2.3.5 PgNBS蛋白N-端区域的分析 | 第37-38页 |
| 2.3.6 PgNBS基因的起源、进化与系统发育 | 第38-39页 |
| 2.3.7 PgNBS转录本在不同组织中的表达特点 | 第39-42页 |
| 2.3.8 PgNBS转录本在不同年生根中的表达特点 | 第42-43页 |
| 2.3.9 PgNBS转录本在4年生人参的不同农家品种的根部表达特征 | 第43-46页 |
| 2.4 讨论 | 第46-47页 |
| 2.4.1 PgNBS基因家族是一个庞大的基因家族 | 第46-47页 |
| 2.4.2 PgNBS基因家族成员间功能差异较大,但以相互协调的方式表达 | 第47页 |
| 2.4.3 PgNBS基因家族中的基因在不同组织部位,不同发育阶段和不同基因型中的具有不同的表达特征 | 第47页 |
| 2.5 小结 | 第47-48页 |
| 第三章 人参黑斑菌侵染人参叶片的转录组及NBS类基因的表达分析 | 第48-72页 |
| 3.1 材料及菌株 | 第48页 |
| 3.2 仪器及试剂 | 第48页 |
| 3.3 方法 | 第48-50页 |
| 3.3.1 人参黑斑菌对人参叶片的侵染 | 第48-49页 |
| 3.3.2 人参叶片总RNA提取、文库构建及转录组测序 | 第49页 |
| 3.3.3 生物信息学分析 | 第49-50页 |
| 3.3.4 PgNBS基因的鉴定和表达模式分析 | 第50页 |
| 3.3.5 qReal-timeRT-PCR的验证 | 第50页 |
| 3.4 结果 | 第50-70页 |
| 3.4.1 人参黑斑菌侵染人参叶片的效果评价 | 第50-51页 |
| 3.4.2 人参叶片总RNA提取效果分析 | 第51页 |
| 3.4.3 测序数据统计及评估 | 第51-52页 |
| 3.4.4 与参考基因组比对统计 | 第52页 |
| 3.4.5 样品重复性相关检查 | 第52-54页 |
| 3.4.6 差异基因的筛选 | 第54-57页 |
| 3.4.7 差异基因分析 | 第57-58页 |
| 3.4.8 差异表达基因的聚类分析 | 第58-59页 |
| 3.4.9 差异表达基因GO功能分析 | 第59-61页 |
| 3.4.10 KEGG代谢途径分析 | 第61-64页 |
| 3.4.11 植物-病原互作途径分析 | 第64-65页 |
| 3.4.12 人参叶片中PgNBS基因的提取 | 第65-66页 |
| 3.4.13 人参叶片中PgNBS基因GO功能分析 | 第66-68页 |
| 3.4.14 人参黑斑菌诱导前后PgNBS基因表达模式的分析 | 第68-69页 |
| 3.4.15 qReal-time RT-PCR的验证 | 第69-70页 |
| 3.5 讨论 | 第70-71页 |
| 3.6 小结 | 第71-72页 |
| 第四章 人参黑斑病STNPCR-LFBA检测方法的建立 | 第72-94页 |
| 4.1 材料 | 第72页 |
| 4.1.1 实验药品 | 第72页 |
| 4.1.2 实验耗材 | 第72页 |
| 4.1.3 菌株 | 第72页 |
| 4.2 仪器 | 第72页 |
| 4.3 试剂 | 第72-74页 |
| 4.4 方法 | 第74-81页 |
| 4.4.1 人参黑斑菌样品的制备 | 第74页 |
| 4.4.2 培养物的破碎 | 第74页 |
| 4.4.3 DNA的提取 | 第74-75页 |
| 4.4.4 DNA浓度及纯度测定 | 第75页 |
| 4.4.5 人参黑斑菌16S rRNA扩增 | 第75页 |
| 4.4.6 胶体金的制备 | 第75-76页 |
| 4.4.7 最佳标记pH及蛋白浓度确定 | 第76页 |
| 4.4.8 最适标记链霉亲和素(SA)量的确定 | 第76页 |
| 4.4.9 胶体金颗粒与链酶亲和素的结合 | 第76页 |
| 4.4.10 T、C线包被蛋白浓度 | 第76-77页 |
| 4.4.11 核酸生物传感器的制备与组装 | 第77页 |
| 4.4.12 单管巢式PCR-LFBA检测原理 | 第77-78页 |
| 4.4.13 单管巢式PCR反应条件的确定 | 第78-80页 |
| 4.4.14 PCR产物的琼脂糖凝胶电泳检测 | 第80页 |
| 4.4.15 核酸杂交各条件的筛选 | 第80页 |
| 4.4.16 核酸侧向流传感器对PCR产物的检测 | 第80页 |
| 4.4.17 巢式PCR-LFBA系统性能分析 | 第80-81页 |
| 4.5 结果 | 第81-92页 |
| 4.5.1 磁珠法DNA提取研究 | 第81页 |
| 4.5.2 磁珠法、CTAB法的比较 | 第81-82页 |
| 4.5.3 人参黑斑菌16S rRNA扩增 | 第82-83页 |
| 4.5.4 两种不同DNA提取方法的经济性评价 | 第83页 |
| 4.5.5 核酸侧向流生物传感器的制备 | 第83-85页 |
| 4.5.6 单管巢式PCR-LFB检测方法的建立 | 第85-91页 |
| 4.5.7 实际样品的检测 | 第91-92页 |
| 4.6 讨论 | 第92-93页 |
| 4.7 小结 | 第93-94页 |
| 第五章 结论 | 第94-96页 |
| 创新点 | 第96-97页 |
| 参考文献 | 第97-106页 |
| 附录 | 第106-116页 |
| 作者简介 | 第116-118页 |
| 致谢 | 第118页 |
