| 中文摘要 | 第10-12页 |
| ABSTRACT | 第12-13页 |
| 第一章 前言 | 第14-20页 |
| 1.1 线粒体基因组 | 第14-16页 |
| 1.1.1 线粒体概述 | 第14页 |
| 1.1.2 线粒体基因组 | 第14-15页 |
| 1.1.3 真菌线粒体基因组 | 第15-16页 |
| 1.2 被毛孢属真菌 | 第16-17页 |
| 1.3 洛斯里被毛孢 | 第17-18页 |
| 1.4 研究内容、目的与意义 | 第18-20页 |
| 第二章 洛斯里被毛孢线粒体基因组的测序及注释分析 | 第20-42页 |
| 2.1 实验材料、仪器、药品和试剂 | 第20-21页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第20页 |
| 2.1.2 实验仪器 | 第20-21页 |
| 2.1.3 实验药品和试剂 | 第21页 |
| 2.2 实验方法 | 第21-30页 |
| 2.2.1 实验试剂的配制 | 第21-22页 |
| 2.2.2 菌株培养和菌种保藏 | 第22-23页 |
| 2.2.3 高通量测序 | 第23页 |
| 2.2.4 线粒体基因组片段的筛选、组装 | 第23页 |
| 2.2.5 PCR引物设计 | 第23-25页 |
| 2.2.6 总DNA提取 | 第25页 |
| 2.2.7 总DNA的质量检测 | 第25-26页 |
| 2.2.8 PCR扩增和测序 | 第26-27页 |
| 2.2.9 序列拼接及序列分析 | 第27-30页 |
| 2.3 实验结果及分析 | 第30-41页 |
| 2.3.1 洛斯里被毛孢线粒体基因组的基本结构 | 第30-31页 |
| 2.3.2 内含子及其中的ORF | 第31-32页 |
| 2.3.3 碱基组成特征 | 第32-33页 |
| 2.3.4 密码子使用情况及氨基酸组成 | 第33-37页 |
| 2.3.5 tRNA基因及其二级结构 | 第37-38页 |
| 2.3.6 rRNA基因 | 第38-39页 |
| 2.3.7 基因间隔与重叠 | 第39页 |
| 2.3.8 重复序列 | 第39页 |
| 2.3.9 USA-87-5和OWVT-1菌株线粒体基因组序列的比较 | 第39-40页 |
| 2.3.10 系统发育分析 | 第40-41页 |
| 2.4 小结 | 第41-42页 |
| 第三章 3种被毛孢属真菌线粒体基因组的比较分析 | 第42-48页 |
| 3.1 3种被毛孢属真菌线粒体基因组的获取 | 第42页 |
| 3.2 数据整理 | 第42页 |
| 3.3 结果与分析 | 第42-47页 |
| 3.3.1 3种被毛孢线粒体基因组的大小和基本组成 | 第42-43页 |
| 3.3.2 3种被毛孢线粒体基因组的基因顺序 | 第43-44页 |
| 3.3.3 3种被毛孢线粒体基因组中内含子的插入位点 | 第44-45页 |
| 3.3.4 3种被毛孢线粒体基因组中PCGs的起始和终止密码子使用情况. | 第45页 |
| 3.3.5 3种被毛孢线粒体基因组中nad2/nad3及nad4L/nad5基因的连接模式 | 第45-46页 |
| 3.3.6 3种被毛孢线粒体基因组中独立ORF的相似性 | 第46页 |
| 3.3.7 3种被毛孢线粒体基因组的氨基酸组成 | 第46页 |
| 3.3.8 3种被毛孢线粒体基因组序列的共线性 | 第46-47页 |
| 3.4 小结 | 第47-48页 |
| 第四章 讨论 | 第48-50页 |
| 参考文献 | 第50-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
| 个人简况及联系方式 | 第57-58页 |
