摘要 | 第6-7页 |
Abstract | 第7-8页 |
缩略词表 | 第9-10页 |
1 前言 | 第10-18页 |
1.1 粒重研究的意义 | 第10-11页 |
1.2 种子大小的调控机理的研究进展 | 第11-14页 |
1.2.1 拟南芥中粒重基因的研究 | 第11-13页 |
1.2.2 水稻中粒重基因的研究 | 第13-14页 |
1.3 油菜粒重的遗传研究 | 第14-15页 |
1.4 复杂数量性状的研究方法 | 第15-16页 |
1.4.1 关联分析的应用 | 第15页 |
1.4.2 BAC文库辅助基因定位 | 第15-16页 |
1.4.3 转录组测序 | 第16页 |
1.5 本课题的前期研究 | 第16-17页 |
1.6 本研究的目的与意义 | 第17-18页 |
2 材料与方法 | 第18-34页 |
2.1 研究材料 | 第18页 |
2.1.1 定位群体 | 第18页 |
2.1.2 转基因材料创制 | 第18页 |
2.2 材料的种植与性状考察 | 第18-19页 |
2.3 分子标记分析 | 第19-23页 |
2.3.1 DNA提取 | 第19-20页 |
2.3.2 DNA浓度检测 | 第20-21页 |
2.3.3 PCR反应 | 第21-22页 |
2.3.4 聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第22-23页 |
2.3.5 基因型记录和电子文档保存 | 第23页 |
2.4 定位群体的构建 | 第23-24页 |
2.4.1 高世代回交群体和分离群体的构建 | 第23页 |
2.4.2 数据分析 | 第23-24页 |
2.5 遗传图谱的构建和QTL的定位 | 第24页 |
2.5.1 局部遗传连锁图的构建 | 第24页 |
2.5.2 QTL的定位和效应分析 | 第24页 |
2.6 BAC文库建库流程 | 第24-25页 |
2.7 BAC文库筛选碱裂解法提取大肠杆菌质粒 | 第25-26页 |
2.8 BAC文库建库测序流程 | 第26-32页 |
2.8.1 DNA片段化 | 第26-27页 |
2.8.2 末端修复 | 第27-28页 |
2.8.3 加“A” | 第28页 |
2.8.4 连接接头 | 第28-29页 |
2.8.5 选择片段 | 第29-30页 |
2.8.6 PCR富集 | 第30-32页 |
2.8.7 文库质检 | 第32页 |
2.9 基于BAC文库的InDel标记开发 | 第32页 |
2.10 CRISPR突变体鉴定方法 | 第32-34页 |
3 结果与分析 | 第34-46页 |
3.1 BAC文库单克隆筛选测序及生物信息学分析 | 第34-37页 |
3.1.1 目标区段BAC单克隆的筛选 | 第34-36页 |
3.1.2 测序拼接结果的分析 | 第36-37页 |
3.2 定位群体的构建 | 第37页 |
3.3 群体表型分析 | 第37-38页 |
3.4 TSWA7a位点的精细定位 | 第38-40页 |
3.4.1 BC_7F2:3群体TSWA7a位点局部遗传连锁图谱的构建及群体定位结果 | 第39页 |
3.4.2 BC_8F_2群体的定位结果 | 第39-40页 |
3.5 候选基因的筛选 | 第40-42页 |
3.6 候选基因的分析 | 第42-45页 |
3.6.1 候选基因在中双11与Darmor中的共线性分析 | 第42-43页 |
3.6.2 候选基因CRISPR载体的构建及突变单株筛选 | 第43-44页 |
3.6.3 CRISPR编辑植株突变位点的测序分析 | 第44-45页 |
3.7 新定位群体的构建及粒重表型分析 | 第45-46页 |
4 讨论 | 第46-49页 |
4.1 粒重表型的稳定性及对定位结果的影响 | 第46页 |
4.2 利用BAC文库开发精细定位标记 | 第46-47页 |
4.3 共显性标记开发的困难及其可能的原因 | 第47页 |
4.4 利用基因编辑技术研究候选基因功能 | 第47-48页 |
4.5 下一步工作展望 | 第48-49页 |
参考文献 | 第49-53页 |
致谢 | 第53页 |