| 中文摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第9-20页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第9-10页 |
| 1.2 遗传学相关知识 | 第10-15页 |
| 1.2.1 遗传物质的基础 | 第10-12页 |
| 1.2.2 可遗传变异 | 第12-13页 |
| 1.2.3 测序技术 | 第13-15页 |
| 1.3 病毒准种重建问题 | 第15-18页 |
| 1.3.1 问题描述 | 第15-16页 |
| 1.3.2 求解重建的方法 | 第16-17页 |
| 1.3.3 国内外背景及现状 | 第17-18页 |
| 1.4 论文主要研究内容 | 第18页 |
| 1.5 论文内容与安排 | 第18-20页 |
| 第2章 一种基于边权简约的改进重建算法IDsatur | 第20-32页 |
| 2.1 基本概念和符号定义 | 第20-21页 |
| 2.2 IDsatur算法设计及实现 | 第21-26页 |
| 2.2.1 错误校正 | 第21-23页 |
| 2.2.2 简化处理 | 第23页 |
| 2.2.3 构造并简约冲突图 | 第23-24页 |
| 2.2.4 冲突图着色 | 第24-25页 |
| 2.2.5 单体型组装及其比例估算 | 第25-26页 |
| 2.3 算法复杂性 | 第26页 |
| 2.4 实验结果 | 第26-31页 |
| 2.4.1 实验数据 | 第26页 |
| 2.4.2 评价指标 | 第26-28页 |
| 2.4.3 结果与分析 | 第28-31页 |
| 2.5 本章小结 | 第31-32页 |
| 第3章 一种基于边权和着色的彩色编码算法CWSS | 第32-38页 |
| 3.1 基本概念和符号定义 | 第32页 |
| 3.2 CWSS算法设计及实现 | 第32-33页 |
| 3.3 算法复杂性 | 第33-34页 |
| 3.4 实验结果与分析 | 第34-37页 |
| 3.5 本章小结 | 第37-38页 |
| 第4章 病毒准种单体型重建软件的设计与开发 | 第38-47页 |
| 4.1 功能需求分析 | 第38页 |
| 4.2 系统运行环境 | 第38页 |
| 4.3 软件总体设计 | 第38-39页 |
| 4.4 软件详细设计 | 第39-46页 |
| 4.4.1 参数设置 | 第41-42页 |
| 4.4.2 读入生物数据 | 第42-43页 |
| 4.4.3 重建准种 | 第43-44页 |
| 4.4.4 查看结果与帮助 | 第44-46页 |
| 4.5 本章小结 | 第46-47页 |
| 第5章 总结和展望 | 第47-49页 |
| 5.1 总结 | 第47-48页 |
| 5.2 展望 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-53页 |
| 攻读硕士期间发表的与学位论文有关的论文目录 | 第53-54页 |
| 致谢 | 第54-55页 |