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基于分子动力学分析的Mn-SOD的热稳定性研究

英文缩略词第4-5页
摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第一章 前言第13-22页
    1.1 概述第13-14页
    1.2 SOD研究进展第14-17页
        1.2.1 SOD的起源第14页
        1.2.2 SOD的类型第14页
        1.2.3 Mn-SOD的结构第14-15页
        1.2.4 Mn-SOD的理化性质与催化机制第15-16页
        1.2.5 Mn-SOD的分子生物学研究进展第16-17页
        1.2.6 Mn-SOD的应用前景第17页
    1.3 生物信息学辅助设计提高蛋白质的热稳定性第17-20页
        1.3.1 生物信息学概述第17-18页
        1.3.2 同源建模第18页
        1.3.3 虚拟氨基酸突变第18-19页
        1.3.4 分子动力学模拟第19-20页
    1.4 立题依据及研究意义第20页
        1.4.1 立题依据第20页
        1.4.2 研究意义第20页
    1.5 本课题的主要研究内容第20-22页
第二章 分子动力学模拟方法的建立第22-34页
    2.1 引言第22页
    2.2 研究对象与计算平台第22-23页
    2.3 实验方法第23-24页
        2.3.1 同源建模第23页
        2.3.2 氨基酸虚拟突变第23-24页
        2.3.3 分子动力学模拟(MD)第24页
    2.4 结果分析第24-33页
        2.4.1 小鼠Mn-SOD蛋白三维结构的建立第24-27页
        2.4.2 突变对蛋白质解折叠自由能的影响第27-30页
        2.4.3 分子动力学模拟确定待突变位点第30-33页
    2.5 本章小结第33-34页
第三章 野生型与突变型Mn-SOD基因的克隆、表达及纯化第34-52页
    3.1 引言第34页
    3.2 实验材料第34-35页
        3.2.1 实验动物第34页
        3.2.2 菌株与质粒第34页
        3.2.3 培养基第34页
        3.2.4 试剂及相关溶液配制第34-35页
        3.2.5 主要仪器及设备第35页
    3.3 实验方法第35-45页
        3.3.1 小鼠血液RNA的提取第35-36页
        3.3.2 Mn-SOD基因片段的PCR扩增第36-37页
        3.3.3 核酸电泳第37页
        3.3.4 胶回收纯化PCR产物第37页
        3.3.5 氯化钙法制备感受态细胞第37页
        3.3.6 PCR产物与载体pET-28a的双酶切第37-38页
        3.3.7 连接反应第38页
        3.3.8 连接产物的转化第38-39页
        3.3.9 重组克隆的的筛选及鉴定第39页
        3.3.10 重组质粒转化至表达宿主菌E.coliBL21(DE3)第39-40页
        3.3.11 突变型重组质粒的构建第40-43页
        3.3.12 野生型与突变型重组蛋白的诱导表达第43-44页
        3.3.13 野生型与突变型重组蛋白的纯化第44-45页
    3.4 结果与分析第45-51页
        3.4.1 野生型Mn-SOD基因的PCR扩增第45页
        3.4.2 重组质粒(pET-MnSOD)的检测第45-46页
        3.4.3 野生型Mn-SOD基因的测序第46-47页
        3.4.4 突变型重组质粒(Mut-pET-MnSOD)的构建第47-48页
        3.4.5 重组蛋白的诱导表达及纯化第48-51页
    3.5 本章小结第51-52页
第四章 野生型与突变型Mn-SOD的活性及热稳定性研究第52-58页
    4.1 引言第52页
    4.2 实验材料第52-53页
        4.2.1 菌株第52页
        4.2.2 主要试剂及相关溶液的配制第52页
        4.2.3 主要仪器第52-53页
    4.3 实验方法第53-54页
        4.3.1 重组Mn-SOD蛋白的含量测定第53页
        4.3.2 重组Mn-SOD蛋白的活性研究第53-54页
        4.3.3 重组Mn-SOD蛋白的热稳定性研究第54页
        4.3.4 数据统计与分析第54页
        4.3.5 圆二色光谱分析第54页
    4.4 结果分析第54-57页
        4.4.1 Mn-SOD蛋白含量测定第54-55页
        4.4.2 Mn-SOD蛋白热稳定性测定第55-57页
        4.4.3 Mn-SOD蛋白二级结构分析第57页
    4.5 本章小结第57-58页
第五章 讨论与展望第58-61页
    5.1 同源建模模板的选择第58页
    5.2 Mn-SOD突变位点的选择第58页
    5.3 酶活测定温度的选择第58-59页
    5.4 表达系统与表达载体的选择第59-60页
    5.5 本研究创新之处第60页
    5.6 本研究主要结果第60页
    5.7 展望第60-61页
参考文献第61-66页
在校期间研究成果及发表论文第66-67页
致谢第67页

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