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狐狸TYRP1和PMEL基因核心启动子区及转录因子结合位点研究

摘要第4-5页
abstract第5-6页
1 引言第9-15页
    1.1 影响哺乳动物黑色素形成的基因研究现状第9-10页
    1.2 TYRP1基因与毛色关系的研究现状第10-11页
    1.3 PMEL基因与毛色关系的研究现状第11页
    1.4 狐狸TYRP1和PMEL基因与毛色关系的研究现状第11-12页
    1.5 启动子研究方法第12-13页
        1.5.1 真核生物启动子结构特征第12-13页
        1.5.2 真核生物启动子研究方法第13页
    1.6 转录因子结合位点的研究方法第13-14页
        1.6.1 真核生物转录因子研究第13页
        1.6.2 真核生物转录因子结合位点的研究方法第13-14页
    1.7 主要研究内容和研究意义第14-15页
        1.7.1 研究内容第14页
        1.7.2 研究意义第14-15页
2 材料与方法第15-33页
    2.1 材料第15-20页
        2.1.1 狐狸样品采集第15页
        2.1.2 试验菌株来源第15页
        2.1.3 载体和细胞种类第15-17页
        2.1.4 数据分析工具第17页
        2.1.5 主要试验试剂及来源第17-19页
        2.1.6 试验仪器设备第19-20页
    2.2 方法第20-33页
        2.2.1 狐狸样品DNA提取第20页
        2.2.2 狐狸TYRP1基因引物设计第20-22页
        2.2.3 狐狸PMEL基因引物设计第22-23页
        2.2.4 基因5’侧翼区的PCR扩增第23-25页
        2.2.5 PCR扩增产物检测和纯化第25-26页
        2.2.6 PCR扩增产物克隆载体的构建第26-27页
        2.2.7 连接产物转化和阳性克隆载体的筛选第27页
        2.2.8 阳性质粒的小量提取第27-28页
        2.2.9 阳性质粒和pGL3-Basic质粒的双酶切和片段回收第28页
        2.2.10 酶切目的片段的表达载体构建第28-29页
        2.2.11 无内毒素阳性目的重组质粒的大量提取第29-30页
        2.2.12 转染细胞的培养第30-31页
        2.2.13 细胞的瞬时转染第31-32页
        2.2.14 重组质粒活性检测与数据处理第32-33页
3 结果与分析第33-54页
    3.1 狐狸TYRP1和PMEL基因上游序列同源性分析第33-35页
        3.1.1 狐狸TYRP1基因已知上游序列的同源性分析第33-34页
        3.1.2 狐狸PMEL基因已知上游序列的同源性分析第34-35页
    3.2 狐狸TYRP1和PMEL基因上游序列与EPD数据库比对分析第35-36页
        3.2.1 狐狸TYRP1基因已知上游序列比对分析结果第35-36页
        3.2.2 狐狸PMEL基因已知上游序列比对分析结果第36页
    3.3 狐狸TYRP1基因上游序列启动子预测第36-38页
        3.3.1 狐狸TYRP1基因上游序列Promoter2.0预测结果第36页
        3.3.2 狐狸TYRP1基因上游序列Neural Network Promoter Prediction预测结果第36-37页
        3.3.3 狐狸TYRP1基因上游序列GPMiner预测结果第37页
        3.3.4 狐狸TYRP1基因上游序列MethPrimer预测结果第37-38页
    3.4 狐狸PMEL基因上游序列启动子预测第38-40页
        3.4.1 狐狸PMEL基因上游序列Promoter2.0预测结果第38页
        3.4.2 狐狸PMEL基因上游序列Neural Network Promoter Prediction预测结果第38-39页
        3.4.3 狐狸PMEL基因上游序列GPMiner预测结果第39页
        3.4.4 狐狸PMEL基因上游序列MethPrimer预测结果第39-40页
    3.5 狐狸TYRP1和PMEL基因启动子缺失片段的载体构建第40-44页
        3.5.1 狐狸DNA的提取第40页
        3.5.2 狐狸TYRP1和PMEL基因启动子缺失片段的PCR扩增第40-42页
        3.5.3 狐狸TYRP1和PMEL基因启动子缺失片段克隆载体的构建第42页
        3.5.4 狐狸TYRP1和PMEL基因启动子缺失片段报告基因载体的构建第42-43页
        3.5.5 狐狸TYRP1和PMEL基因启动子缺失片段报告基因载体的测序鉴定第43-44页
    3.6 狐狸TYRP1和PMEL基因启动子缺失片段活性验证第44-48页
        3.6.1 瞬时转染的细胞培养第44页
        3.6.2 瞬时转染的最佳条件确定第44-46页
        3.6.3 狐狸TYRP1基因启动子缺失片段细胞转染活性分析第46-47页
        3.6.4 狐狸PMEL基因启动子缺失片段细胞转染活性分析第47-48页
    3.7 狐狸TYRP1和PMEL基因核心启动子区的转录因子结合位点研究第48-54页
        3.7.1 狐狸TYRP1基因核心启动子区的转录因子结合位点预测第48-49页
        3.7.2 狐狸PMEL基因核心启动子区的转录因子结合位点预测第49页
        3.7.3 狐狸TYRP1基因核心启动子区突变载体的构建与活性验证第49-51页
        3.7.4 狐狸PMEL基因核心启动子区突变载体的构建与活性验证第51-54页
4 讨论第54-59页
    4.1 启动子片段扩增分析第54页
    4.2 启动子表达载体的构建第54-55页
    4.3 细胞培养和转染的影响因素第55-56页
    4.4 狐狸TYRP1基因核心启动子区域分析第56-57页
    4.5 狐狸PMEL基因核心启动子区域分析第57页
    4.6 转录因子结合位点分析第57-59页
5 结论第59-60页
参考文献第60-65页
作者简历第65-66页
在读期间发表论文情况第66-67页
致谢第67-69页
详细摘要第69-70页

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