摘要 | 第5-7页 |
Abstract | 第7-8页 |
第1章 绪论 | 第11-39页 |
1.1 细胞连接 | 第11-13页 |
1.2 黏着斑 | 第13-15页 |
1.3 VINCULIN蛋白介绍 | 第15-17页 |
1.4 细胞迁移 | 第17-19页 |
1.5 残留偶极耦合在蛋白质结构研究中的应用 | 第19-29页 |
1.6 小角散射(SMALL ANGLE X-RAY SCATTERING,SAXS)在结构生物学研究中的应用 | 第29-39页 |
第2章 CAP蛋白的串联SH3结构域的溶液结构研究 | 第39-69页 |
2.1 CAP蛋白的生物学背景介绍 | 第39-40页 |
2.2 SH3结构域的介绍 | 第40-41页 |
2.3 实验材料和方法 | 第41-54页 |
2.3.1 CAP 和 vinculin,vin837, vin857 目的基因的获得 | 第41-42页 |
2.3.2 CAP,vin837,和vin857质粒的构建 | 第42-43页 |
2.3.3 CAP,vin837,和vin857的表达纯化和定量 | 第43-44页 |
2.3.4 prr1和prr2小肽的合成与纯化 | 第44页 |
2.3.5 等温量热滴定实验(ITC) | 第44-46页 |
2.3.6 残留偶极耦合实验(RDC) | 第46-47页 |
2.3.7 核磁化学位移扰动(CHEMICAL SHIFT PERTURBATION,CSP)实验 | 第47页 |
2.3.8 主链动力学弛豫实验 | 第47-48页 |
2.3.9 CAP的核磁结构的计算和修正 | 第48-54页 |
2.4 实验结果和讨论 | 第54-69页 |
2.4.1 CAP的串联SH3结构域的溶液结构的解析 | 第54-59页 |
2.4.3 SH3A和SH3B对底物结合特异性的分析 | 第59-62页 |
2.4.4 CAP的主链动力学分析 | 第62-65页 |
2.4.5 对SH3A和SH3B结构域相对取向的研究 | 第65-66页 |
2.4.6 小结 | 第66-69页 |
第3章 CAP的串联SH3结构域与VINCULIN的复合物结构研究 | 第69-83页 |
3.1 材料和方法 | 第69-72页 |
3.1.1 SH3A,SH3B,VINCULIN的克隆表达和纯化 | 第69页 |
3.1.2 PRR1和PRR2的购买及纯化 | 第69页 |
3.1.3 SH3A-PRR2和SH3B-PRR1复合物晶体的初筛 | 第69-70页 |
3.1.4 晶体结构的解析优化 | 第70页 |
3.1.5 超速离心共沉淀实验 | 第70-71页 |
3.1.6 电镜实验 | 第71-72页 |
3.2 实验结果和分析 | 第72-83页 |
3.2.1 SH3A-PRR2和SH3B-PRRl的复合物晶体结构 | 第72-75页 |
3.2.2 PRR1和PRR2属于非传统的CLASSⅡ型SH3结构域底物序列 | 第75页 |
3.2.3 Q807SH3A和D881 SH3B使得SH3A和SH3B拥有不同的底物结合特异性 | 第75-78页 |
3.2.4 CAP与全长VINCULIN蛋白的复合物结构模型 | 第78-83页 |
第4章 人源蛋白IKAROS的表达和纯化 | 第83-93页 |
4.1 IKAROS家族蛋白介绍 | 第83页 |
4.2 在淋巴细胞中I KAROS是NuRD复合物的一个组分 | 第83-84页 |
4.3 IKAROS与染色体重塑 | 第84-86页 |
4.4 材料和方法 | 第86-89页 |
4.4.1 IKAROS蛋白N端锌指结构域的质粒的构建 | 第86-87页 |
4.4.2 突变实验 | 第87-88页 |
4.4.3 IKAROS蛋白N端锌指结构域表达纯化 | 第88-89页 |
4.5 实验结果和分析 | 第89-93页 |
4.5.1 IKAROSN末端四个锌指结构域基因的获得 | 第89页 |
4.5.2 IKAROSN末端四个锌指结构域的表达纯化 | 第89-93页 |
参考文献 | 第93-102页 |
附录 | 第102-105页 |
致谢 | 第105-107页 |
已发表论文及参加的学术会议 | 第107页 |