| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 引言 | 第13-35页 |
| 1.1 SNP 遗传标记 | 第13-14页 |
| 1.1.1 概述 | 第13-14页 |
| 1.1.2 SNP 遗传标记应用 | 第14页 |
| 1.2 简化基因组测序技术 | 第14-32页 |
| 1.2.1 高通量测序技术 | 第14-16页 |
| 1.2.2 简化基因组测序技术 | 第16-18页 |
| 1.2.3 基于限制性酶切的简化基因组测序技术 | 第18-24页 |
| 1.2.4 RAD 简化基因组测序技术 | 第24-25页 |
| 1.2.5 高通量 SNPs 遗传标记开发 | 第25-32页 |
| 1.3 中国地方优良鸡品种 | 第32-33页 |
| 1.3.1 概述 | 第32页 |
| 1.3.2 优良鸡品种多态性图谱构建 | 第32-33页 |
| 1.3.3 优良鸡品种群体遗传学分析 | 第33页 |
| 1.4 研究目的与意义 | 第33-35页 |
| 第二章 材料与方法 | 第35-50页 |
| 2.1 材料 | 第35页 |
| 2.1.1 实验动物 | 第35页 |
| 2.1.2 优良鸡品种多态性图谱构建 | 第35页 |
| 2.2 试剂与仪器 | 第35-38页 |
| 2.2.1 试剂药品 | 第35-36页 |
| 2.2.2 试剂配制 | 第36-37页 |
| 2.2.3 仪器设备 | 第37-38页 |
| 2.3 实验方法 | 第38-48页 |
| 2.3.1 血液样品 DNA 提取与检测 | 第38-40页 |
| 2.3.2 全基因组限制性酶切 | 第40-41页 |
| 2.3.3 P1 接头连接 | 第41-44页 |
| 2.3.4 DNA 片段化 | 第44-45页 |
| 2.3.5 目的片段回收及末端修复 | 第45-46页 |
| 2.3.6 P2 接头连接 | 第46-47页 |
| 2.3.7 RAD 片段富集 | 第47-48页 |
| 2.4 统计分析 | 第48-50页 |
| 2.4.1 数据处理 | 第48页 |
| 2.4.2 多态性图谱构建 | 第48-49页 |
| 2.4.3 群体遗传学分析 | 第49-50页 |
| 第三章 结果分析 | 第50-61页 |
| 3.1 测序基本数据分析 | 第50-54页 |
| 3.2 多态性图谱构建 | 第54-56页 |
| 3.3 群体遗传学分析 | 第56-61页 |
| 3.3.1 Fst 统计分析 | 第56-59页 |
| 3.3.2 群体聚类分析 | 第59页 |
| 3.3.3 系统进化树分析 | 第59-61页 |
| 第四章 讨论 | 第61-66页 |
| 4.1 RAD 简化基因组测序技术在家禽上的有效性及可行性 | 第61-64页 |
| 4.2 RAD 简化基因组测序技术与中国地方鸡品种群体遗传学分析 | 第64-66页 |
| 第五章 结论 | 第66-67页 |
| 参考文献 | 第67-80页 |
| 致谢 | 第80-82页 |
| 攻读硕士学位期间已发表或录用的论文 | 第82-83页 |