| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-13页 |
| ·研究背景及其意义 | 第7-10页 |
| ·计算生物学的产生与发展 | 第7页 |
| ·后基因时代的基因组信息学 | 第7-8页 |
| ·从人类基因组"天书"到"百科全书"——ENCODE计划 | 第8-9页 |
| ·复杂网络中的模体发现 | 第9-10页 |
| ·网络模体的研究现状 | 第10-11页 |
| ·论文贡献和结构 | 第11-13页 |
| 第二章 网络模体发现的基本问题 | 第13-25页 |
| ·网络模体的定义 | 第13-14页 |
| ·子图搜索 | 第14-20页 |
| ·子图搜索的相关定义 | 第14页 |
| ·采样搜索算法——ESA | 第14-16页 |
| ·穷尽搜索算法——ESU | 第16-18页 |
| ·网络模式匹配算法——NetGrep | 第18-20页 |
| ·子图归类 | 第20-21页 |
| ·随机网络模型 | 第21-25页 |
| ·交换算法 | 第22-23页 |
| ·匹配算法 | 第23页 |
| ·度优先的蒙特卡罗算法 | 第23-25页 |
| 第三章 基于特征压缩方法的图同构算法 | 第25-39页 |
| ·基本问题的描述及定义 | 第25-26页 |
| ·图的重要拓扑特征 | 第26-36页 |
| ·图的有序划分 | 第26-28页 |
| ·节点不变量 | 第28-30页 |
| ·拓扑结构特征向量 | 第30-33页 |
| ·标准化邻接矩阵 | 第33-35页 |
| ·同位点 | 第35-36页 |
| ·图同构算法 | 第36-39页 |
| 第四章 实验仿真及结果分析 | 第39-47页 |
| ·实验数据介绍 | 第39-40页 |
| ·子图搜索的算法评估与比较 | 第40-41页 |
| ·FCGI算法的实验结果 | 第41-43页 |
| ·算法可靠性测试 | 第41-42页 |
| ·算法性能比较 | 第42-43页 |
| ·网络模体的实验结果与分析 | 第43-47页 |
| 第五章 总结与展望 | 第47-49页 |
| 致谢 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-53页 |
| 研究成果 | 第53页 |