| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 第一部分 金黄色葡萄球菌中含丝氨酸-天冬氨酸重复序列的基因的分子研究 | 第11-82页 |
| 参考文献 | 第12-13页 |
| 第一章 金黄色葡萄球菌中含丝氨酸-天冬氨酸重复序列的基因功能研究 | 第13-52页 |
| 1 前言 | 第13-16页 |
| 2 材料和方法 | 第16-24页 |
| 2.1 材料 | 第16-21页 |
| 2.2 主要试剂、常用溶液配方、常用培养基、主要实验仪器 | 第21-22页 |
| 2.3 实验方法 | 第22-24页 |
| 3 结果 | 第24-41页 |
| 3.1 加拿大奶牛乳腺炎相关金黄色葡萄球菌内sdr基因序列及突变 | 第24-32页 |
| 3.2 加拿大奶牛乳腺炎相关金黄色葡萄球菌内sdrC、sdrD、sdrE和sdrH基因分布状况和致病菌或隐性菌的关联性 | 第32-33页 |
| 3.3 加拿大奶牛乳腺炎相关金黄色葡萄球菌的sdr基因和其他21株全基因组测序的金黄色葡萄球菌的sdr基因的区别 | 第33-34页 |
| 3.4 sdrC,sdrD,sdrE和sdrH表皮粘附因子的基因进化树揭示了金黄色葡萄球菌菌株间的进化关系 | 第34-39页 |
| 3.5 Sdr蛋白同源建模结果暗示其为细菌表面粘附因子 | 第39-41页 |
| 4 讨论 | 第41-47页 |
| 5 小结 | 第47-48页 |
| 6 参考文献 | 第48-52页 |
| 第二章 金黄色葡萄球菌中丝氨酸-天冬氨酸重复序列与细菌微进化的关系 | 第52-82页 |
| 1 前言 | 第52-54页 |
| 2 材料和方法 | 第54-60页 |
| 2.1 细菌菌株和生长条件 | 第54页 |
| 2.2 DNA提取、操作和测序 | 第54页 |
| 2.3 引物 | 第54-55页 |
| 2.4 构建重组质粒和突变子策略 | 第55-57页 |
| 2.5 基于质粒的测试 | 第57页 |
| 2.6 限制性内切酶分析 | 第57页 |
| 2.7 ATCC 393感受态细胞制备(用于电转化) | 第57-58页 |
| 2.8 电转化 | 第58页 |
| 2.9 侵染乳腺上皮细胞实验 | 第58-59页 |
| 2.10 生物信息学分析 | 第59-60页 |
| 3 结果 | 第60-73页 |
| 3.1 金黄色葡萄球菌C1fA因子的SD重复序列的特征 | 第60-61页 |
| 3.2 以质粒为基础的检测系统揭示了SD重复序列的高度不稳定性 | 第61-64页 |
| 3.3 含有高拷贝SD重复序列的质粒在传代和转化期间表现出高度不稳定性 | 第64-68页 |
| 3.4 SD重复序列长度和侵染乳腺上皮细胞的关系 | 第68-69页 |
| 3.5 含长SD重复序列的蛋白质绝大部分都是金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌的表面蛋白 | 第69-71页 |
| 3.6 金黄色葡萄球菌表面蛋白大多数SD重复序列变异发生在两端 | 第71-73页 |
| 4 讨论 | 第73-78页 |
| 5 小结 | 第78-79页 |
| 6 参考文献 | 第79-82页 |
| 第二部分 11家族木聚糖酶热稳定性与结构关联性研究 | 第82-123页 |
| 1 前言 | 第82-84页 |
| 2 材料和方法 | 第84-97页 |
| 2.1 材料 | 第84-88页 |
| 2.2 实验方法 | 第88-97页 |
| 3 结果 | 第97-112页 |
| 3.1 木聚糖酶xynR8基因核心区 | 第97页 |
| 3.2 木聚糖酶XynR8_CS同源建模 | 第97-99页 |
| 3.3 木聚糖酶XynR8的全长序列XynR8_FS和核心区XynR8_CS的蛋白纯化及催化性质初分析 | 第99-100页 |
| 3.4 通过文库筛选得到三个热稳定性增强的木聚糖酶突变子 | 第100-102页 |
| 3.5 DNA改组技术鉴定位点38、104、116、137、151残基的热稳定效应 | 第102-104页 |
| 3.6 根据Rosettadesign预测结果,XynR8_CS 38、137、151位点更多突变来检测这三个位点热稳定性最高的氨基酸 | 第104-111页 |
| 3.7 XynR8_CS、XynR8_VGD、XynR8_VNE的蛋白活性动力学 | 第111-112页 |
| 4 讨论 | 第112-116页 |
| 5 小结 | 第116-117页 |
| 6 参考文献 | 第117-123页 |
| 攻读博士期间发表的论文 | 第123-124页 |
| 致谢 | 第124-125页 |
