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全基因组测序与病毒捕获测序技术探讨EB病毒进化及整合规律的初步研究

摘要第5-9页
Abstract第9-12页
目录第13-15页
英文缩写注解第15-16页
第一章 EBV在癌细胞基因组上的整合第16-32页
    1.1 前言第16-18页
    1.2 实验材料和方法第18-22页
        1.2.1 实验材料第18页
        1.2.2 主要实验仪器第18页
        1.2.3 主要试剂第18-19页
        1.2.4 主要实验方法第19-22页
    1.3 实验结果第22-32页
        1.3.1 全基因组测序产出数据分析第22-23页
        1.3.2 EBV整合位点检测第23页
        1.3.3 EBV整合对宿主基因组的影响第23-32页
第二章 RAJI细胞和C666-1细胞中EBV基因组的变异和进化第32-41页
    2.1 实验方法第32页
        2.1.1 C666-1和Raji细胞中EBV基因组的组装第32页
        2.1.2 EBV基因组分析第32页
        2.1.3 EBV基因组中SNV的检测第32页
    2.2 结果第32-41页
        2.2.1 C666-1和Raji细胞中EBV基因组及病毒基因进化比较分析第32-37页
        2.2.2 C666-1和Raji细胞中EBV基因组及病毒基因SNV分析第37-41页
第三章 鼻咽癌组织中EBV的整合和进化第41-59页
    3.1 实验材料和方法第41-43页
        3.1.1 主要实验材料第41页
        3.1.2 主要仪器第41页
        3.1.3 主要实验方法第41-43页
    3.2 结果第43-59页
        3.2.1 EBV序列捕获芯片测序数据分析第43-44页
        3.2.2 18例鼻咽癌组织中EBV整合位点分析第44-46页
        3.2.3 EBV相关鼻咽癌的EBV变异和进化分析第46-59页
第四章 讨论第59-63页
总结第63-64页
参考文献第64-73页
综述第73-89页
    参考文献第81-89页
攻读学位期间主要的研究成果目录第89-90页
致谢第90页

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