| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第12-24页 |
| 1.2 生物钟 | 第12-15页 |
| 1.2.1 背景 | 第12-13页 |
| 1.2.2 生物钟与疾病 | 第13-14页 |
| 1.2.3 生物钟调控的分子机制 | 第14-15页 |
| 1.3 转录组 | 第15-18页 |
| 1.3.1 mRNA-Seq高通量测序技术(RNA-Seq) | 第15-17页 |
| 1.3.2 转录组测序的应用 | 第17-18页 |
| 1.4 骨骼肌 | 第18-23页 |
| 1.4.1 骨骼肌的发育 | 第19-20页 |
| 1.4.2 鱼类骨骼肌的组成 | 第20页 |
| 1.4.3 生肌调节因子(MRFs) | 第20-21页 |
| 1.4.4 肌肉生长抑制素基因(Myostatin) | 第21页 |
| 1.4.5 其他功能基因 | 第21-23页 |
| 1.5 本论文的目的、意义以及内容 | 第23-24页 |
| 第2章 鳜慢肌转录组测序及分析 | 第24-37页 |
| 2.1 引言 | 第24页 |
| 2.2 实验材料与方法 | 第24页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第24页 |
| 2.2.2 主要试剂与仪器 | 第24页 |
| 2.3 cDNA文库构建 | 第24-26页 |
| 2.3.1 RNA提取 | 第24-25页 |
| 2.3.2 cDNA链合成及测序 | 第25-26页 |
| 2.4 数据处理 | 第26-28页 |
| 2.4.1 序列拼接及分析 | 第26-27页 |
| 2.4.2 功能注释、基因分类和代谢途径分析 | 第27-28页 |
| 2.4.3 预测编码蛋白框(CDS) | 第28页 |
| 2.5 筛选转录组核心时钟基因 | 第28-29页 |
| 2.6 结果 | 第29-35页 |
| 2.6.1 RNA提取和转录组文库的构建 | 第29页 |
| 2.6.2 序列拼接和分析 | 第29-30页 |
| 2.6.3 功能注释、基因分类和代谢途径分析 | 第30-31页 |
| 2.6.4 预测编码蛋白框(CDS) | 第31-32页 |
| 2.6.5 筛选的时钟基因及其进化树分析 | 第32-35页 |
| 2.7 讨论 | 第35-36页 |
| 2.8 本章小结 | 第36-37页 |
| 第3章 鳜快慢肌时钟基因的表达及其节律性比较分析 | 第37-59页 |
| 3.1 引言 | 第37页 |
| 3.2 实验试剂与仪器 | 第37-39页 |
| 3.2.1 实验试剂 | 第37-39页 |
| 3.2.2 实验仪器 | 第39页 |
| 3.3 实验方法 | 第39-47页 |
| 3.3.1 实验材料 | 第39-40页 |
| 3.3.2 nr1d2基因的全长克隆 | 第40-44页 |
| 3.3.3 时钟基因在骨骼肌中的节律性表达比较分析 | 第44-47页 |
| 3.4 结果 | 第47-56页 |
| 3.4.1 nr1d2基因克隆实验结果分析 | 第47-49页 |
| 3.4.2 快肌中时钟基因昼夜节律性及关联性分析 | 第49-53页 |
| 3.4.3 慢肌中时钟基因昼夜节律性及关联性分析 | 第53-56页 |
| 3.5 讨论 | 第56-57页 |
| 3.6 本章小结 | 第57-59页 |
| 第4章 鳜快慢肌重要功能基因的表达及其节律性比较分析 | 第59-65页 |
| 4.1 引言 | 第59页 |
| 4.2 实验试剂、仪器与方法 | 第59页 |
| 4.2.1 实验试剂 | 第59页 |
| 4.2.3 实验仪器 | 第59页 |
| 4.3 实验方法 | 第59-60页 |
| 4.3.1 鳜快慢肌中功能基因节律性分析 | 第60页 |
| 4.4 结果 | 第60-64页 |
| 4.4.1 快肌中肌肉功能基因昼夜节律性分析 | 第60-61页 |
| 4.4.2 慢肌中肌肉功能基因昼夜节律性分析 | 第61-62页 |
| 4.4.3 快肌中节律性时钟基因与功能基因的相关性分析 | 第62-63页 |
| 4.4.4 慢肌中节律性时钟基因与功能基因的相关性分析 | 第63-64页 |
| 4.5 讨论 | 第64页 |
| 4.6 本章小结 | 第64-65页 |
| 结论 | 第65-67页 |
| 参考文献 | 第67-76页 |
| 附录 攻读学位期间所发表的学术论文目录 | 第76-77页 |
| 致谢 | 第77页 |
