摘要 | 第10-12页 |
英文摘要 | 第12-13页 |
1 前言 | 第14-22页 |
1.1 Fox家族简介 | 第14-17页 |
1.1.1 Fox的染色体定位及基因组结构 | 第14-15页 |
1.1.2 Fox蛋白的结构和转录调节机制 | 第15页 |
1.1.3 Fox蛋白的功能及其与疾病的关系 | 第15-16页 |
1.1.4 Fox家族的展望 | 第16-17页 |
1.2 Fox N1基因的研究进展 | 第17-19页 |
1.2.1 Fox N1基因的简介 | 第17页 |
1.2.2 Fox N1的基因结构和蛋白特征 | 第17页 |
1.2.3 Fox N1基因的生物学功能 | 第17-18页 |
1.2.4 Fox N1基因的研究进展 | 第18-19页 |
1.3 生物信息学分析的研究进展 | 第19-21页 |
1.3.1 生物信息学的背景 | 第19页 |
1.3.2 生物数据库介绍 | 第19-20页 |
1.3.3 生物信息学数据分析工具 | 第20页 |
1.3.4 生物信息学研究的主要内容 | 第20-21页 |
1.4 实验目的和意义 | 第21-22页 |
2 材料与方法 | 第22-33页 |
2.1 材料 | 第22-24页 |
2.1.1 实验动物 | 第22页 |
2.1.2 细胞株 | 第22页 |
2.1.3 实验试剂 | 第22页 |
2.1.4 主要仪器设备 | 第22-23页 |
2.1.5 缓冲液与主要试剂的配制 | 第23页 |
2.1.6 主要生物学软件 | 第23页 |
2.1.7 相关生物信息学网址 | 第23-24页 |
2.2 方法 | 第24-33页 |
2.2.1 模板的制备 | 第24页 |
2.2.2 民猪Fox N1基因组序列的克隆 | 第24-26页 |
2.2.3 民猪Fox N1基因完整编码区的克隆 | 第26-27页 |
2.2.4 民猪与大白猪Fox N1基因编码区序列的比对 | 第27页 |
2.2.5 民猪Fox N1蛋白序列的生物信息学分析 | 第27-28页 |
2.2.6 pEGFP-N1-Fox N1重组质粒构建 | 第28-29页 |
2.2.7 细胞的培养、转染、检测、亚细胞定位 | 第29页 |
2.2.8 民猪Fox N1基因组织表达谱的构建 | 第29-30页 |
2.2.9 Real-Time PCR检测民猪Fox N1基因 | 第30-31页 |
2.2.10 Western Blot检测民猪Fox N1表达规律 | 第31-33页 |
3 结果与分析 | 第33-50页 |
3.1 民猪FoxN1基因组序列扩增 | 第33页 |
3.1.1 民猪基因组DNA的提取 | 第33页 |
3.1.2 民猪Fox N1基因组序列扩增 | 第33页 |
3.2 民猪FoxN1基因CDS区全长扩增 | 第33-34页 |
3.3 民猪FoxN1基因的生物信息学分析 | 第34-40页 |
3.3.1 蛋白质氨基酸组成、分子量和等电点分析 | 第34页 |
3.3.2 蛋白质疏水性分析 | 第34页 |
3.3.3 蛋白质信号肽预测 | 第34-35页 |
3.3.4 跨膜区预测 | 第35-36页 |
3.3.5 亚细胞定位预测 | 第36页 |
3.3.6 蛋白质功能结构域预测 | 第36页 |
3.3.7 同源性比对和分子系统发生分析 | 第36-40页 |
3.4 民猪FoxN1基因的转录剪切变异体的发现及鉴别 | 第40页 |
3.5 民猪与大白猪FoxN1基因编码区序列的比对 | 第40-41页 |
3.6 亚细胞定位 | 第41-44页 |
3.6.1 pGM-T-Fox N1质粒和pEGFP-N1质粒双酶切 | 第41-42页 |
3.6.2 构建pEGFP-N1-Fox N1重组质粒 | 第42-43页 |
3.6.3 瞬时转染重组质粒pEGFP-N1-Fox N1-a/b/c基因的定位结果 | 第43-44页 |
3.7 民猪FoxN1基因在各组织中的扩增结果 | 第44-45页 |
3.8 Real-Time PCR鉴定Fox N1基因在民猪胸腺各阶段的表达 | 第45-48页 |
3.8.1 标准曲线的建立 | 第45-47页 |
3.8.2 Fox N1基因在胸腺组织的表达情况 | 第47-48页 |
3.9 Western blot鉴定Fox N1蛋白在民猪胸腺各阶段的表达 | 第48-50页 |
3.9.1 BSA标准曲线的建立 | 第48页 |
3.9.2 Western blot检测Fox N1蛋白在民猪胸腺不同月龄的表达 | 第48-50页 |
4 讨论 | 第50-53页 |
4.1 民猪FoxN1基因的克隆与生物信息学分析 | 第50页 |
4.2 民猪FoxN1基因的可变剪接体 | 第50-51页 |
4.3 民猪FoxN1基因的亚细胞定位 | 第51页 |
4.4 民猪和大白猪Fox N1基因的序列比对 | 第51页 |
4.5 民猪FoxN1基因的表达特异性分析 | 第51-53页 |
5 结论 | 第53-54页 |
致谢 | 第54-55页 |
参考文献 | 第55-60页 |
攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第60页 |