| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 符号与缩略语说明 | 第10-11页 |
| 前言 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-26页 |
| 1. 保护性耕作研究背景及意义 | 第12-15页 |
| 1.1 保护性耕作的概念 | 第12页 |
| 1.2 国外保护性耕作的研究进展 | 第12-13页 |
| 1.3 我国保护性耕作发展应用 | 第13-14页 |
| 1.4 保护性耕作的优缺点 | 第14页 |
| 1.5 保护性耕作的生态效应 | 第14-15页 |
| 2. 土壤微生物多样性 | 第15-21页 |
| 2.1 土壤微生物多样性研究意义 | 第15-16页 |
| 2.2 土壤微生物多样性内容 | 第16页 |
| 2.3 土壤微生物多样性常用指标 | 第16-17页 |
| 2.4 微生物多样性研究方法 | 第17-18页 |
| 2.5 宏基因组学 | 第18-19页 |
| 2.6 基于宏基因组的微生物生态学分析 | 第19-20页 |
| 2.7 宏基因组学应用以及研究现状 | 第20-21页 |
| 2.8 存在问题及发展现状 | 第21页 |
| 3. 纤维素基因研究进展 | 第21-26页 |
| 3.1 秸秆组成 | 第22页 |
| 3.2 秸秆降解相关酶 | 第22-23页 |
| 3.3 纤维素酶作用机理 | 第23-24页 |
| 3.4 纤维素酶基因的研究 | 第24-26页 |
| 第二章 基于高通量测序技术下细菌群落结构多样性研究 | 第26-42页 |
| 1. 材料与方法 | 第26-29页 |
| 1.1 采样区概况 | 第26页 |
| 1.2 长期试验设计与样品采集 | 第26-27页 |
| 1.3 土壤理化性质测定 | 第27页 |
| 1.4 土壤细菌、真菌、放线菌计数 | 第27页 |
| 1.5 土壤总DNA提取 | 第27-28页 |
| 1.6 高通量测序 | 第28-29页 |
| 2. 测序结果与分析 | 第29-39页 |
| 2.0 土壤理化性质 | 第29-30页 |
| 2.1 土壤细菌、真菌与放线菌计数 | 第30-31页 |
| 2.2 有效序列与优质序列统计 | 第31-32页 |
| 2.3 不同处理土壤微生物库容分析 | 第32-33页 |
| 2.4 不同处理土壤微生物多样性 | 第33-34页 |
| 2.5 四种处理土壤微生物OTU分析 | 第34-35页 |
| 2.6 土壤样品微生物群落组成分析 | 第35-37页 |
| 2.7 Beta多样性分析 | 第37-39页 |
| 2.8 物种群落结构图 | 第39页 |
| 3. 讨论 | 第39-40页 |
| 4. 小结 | 第40-42页 |
| 第三章 保护性耕作对纤维素降解菌群落的影响 | 第42-58页 |
| 1 材料与方法 | 第43-49页 |
| 1.1 采样区概况 | 第43页 |
| 1.2 长期试验设计与样品采集 | 第43页 |
| 1.3 土壤理化性质测定 | 第43页 |
| 1.4 土壤纤维素降解菌筛选 | 第43页 |
| 1.5 纤维素降解菌PCR-RFLP分析 | 第43-49页 |
| 2 结果与分析 | 第49-56页 |
| 2.1 土壤纤维素降解菌目的基因扩增 | 第49-50页 |
| 2.2 纤维素降解菌基因文库库容分析 | 第50页 |
| 2.3 纤维素降解菌酶切类型统计分析 | 第50-53页 |
| 2.4 纤维素降解菌多样性指数分析 | 第53页 |
| 2.5 纤维素降解菌基因测序分析和系统发育分析 | 第53-56页 |
| 2.6 环境因子与土壤纤维素降解菌群落结构分布关系的冗余分析 | 第56页 |
| 3 讨论 | 第56-57页 |
| 4 小结 | 第57-58页 |
| 第四章 纤维素降解真菌木质纤维素酶基因的遗传变异 | 第58-66页 |
| 1. 材料与方法 | 第58-60页 |
| 1.1 材料与试剂 | 第58页 |
| 1.2 真菌总DNA提取 | 第58页 |
| 1.3 引物设计 | 第58-59页 |
| 1.4 PCR扩增基因片段 | 第59-60页 |
| 2. 结果与分析 | 第60-63页 |
| 2.1 TRAP引物筛选 | 第60页 |
| 2.2 TRAP-PCR检测结果及分析 | 第60-63页 |
| 3. 讨论 | 第63-64页 |
| 4. 小结 | 第64-66页 |
| 全文总结 | 第66-68页 |
| 附录 文中所用的培养基和试剂配方 | 第68-76页 |