摘要 | 第3-4页 |
ABSTRACT | 第4页 |
第一章 苯丙胺、POPC磷脂双层膜及分子动力学模拟概论 | 第7-17页 |
1.1 苯丙胺(AT) | 第7-8页 |
1.2 POPC磷脂双层膜结构 | 第8-11页 |
1.3 分子动力学模拟 | 第11-17页 |
1.3.1 分子动力学简述 | 第11-12页 |
1.3.2 分子动力学模拟的基本概念 | 第12-13页 |
1.3.3 分子动力学模拟的基本方法 | 第13-14页 |
1.3.4 分子动力学模拟软件 | 第14-15页 |
1.3.5 分子动力学模拟实验步骤简介 | 第15-17页 |
第二章 苯丙胺分子结构优化与SAT分子力场参数 | 第17-25页 |
2.1 引言 | 第17页 |
2.2 材料与方法 | 第17页 |
2.3 结果与讨论 | 第17-25页 |
2.3.1 R型和S型苯丙胺分子的优化及相关键参数 | 第17-20页 |
2.3.2 SAT分子的力场参数 | 第20-25页 |
第三章 SAT分子在POPC磷脂双层膜中扩散和透过过程分子动力学模拟 | 第25-47页 |
3.1 引言 | 第25页 |
3.2 材料与方法 | 第25-30页 |
3.2.1 POPC-H_2O-SAT模拟体系的建立 | 第25-28页 |
3.2.2 SAT分子透过POPC磷脂双层膜的轨迹 | 第28-29页 |
3.2.3 SAT分子透过POPC磷脂双层膜自由能的势能面 | 第29-30页 |
3.3 结果与讨论 | 第30-46页 |
3.3.1 POPC-H_2O-SAT三元复合物体系分子动力学模拟 | 第30-31页 |
3.3.2 SAT分子在POPC磷脂双层膜中间层的扩散和透过运动轨迹 | 第31-36页 |
3.3.3 SAT分子运动轨迹上的伞形样本选定 | 第36-37页 |
3.3.4 SAT分子伞形样本的分子动力学模拟 | 第37-40页 |
3.3.5 SAT分子在POPC磷脂双层膜中间扩散和透过过程的自由能 | 第40-46页 |
3.4 结论 | 第46-47页 |
附录 | 第47-74页 |
参考文献 | 第74-79页 |
攻读硕士学位期间论文发表情况 | 第79-80页 |
致谢 | 第80页 |