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家蚕体相关蛋白乙酰化修饰鉴定及其对蚕丝蛋白合成影响的研究

摘要第4-7页
ABSTRACT第7-10页
第一章 前言第14-29页
    1.1 课题背景与意义第14-15页
    1.2 蛋白质的乙酰化修饰及其功能第15-21页
        1.2.1 蛋白质的乙酰化修饰第15-16页
        1.2.2 组蛋白乙酰化酶与去乙酰化酶第16-18页
        1.2.3 非组蛋白的乙酰化修饰第18-21页
            1.2.3.1 非组蛋白乙酰化与蛋白结构的关系第18-19页
            1.2.3.2 非组蛋白的乙酰化通过与泛素化修饰竞争提高蛋白稳定性第19-21页
    1.3 家蚕蚕丝蛋白第21-25页
        1.3.1 丝素蛋白组成及结构第21-22页
        1.3.2 丝胶蛋白结构及特性第22-25页
            1.3.2.1 家蚕丝胶蛋白第22页
            1.3.2.2 非家蚕蚕丝丝胶蛋白第22-23页
            1.3.2.3 家蚕丝胶基因的结构与表达特性第23-24页
            1.3.2.4 丝胶蛋白的物理特性第24-25页
    1.4 家蚕营养储藏蛋白及其功能第25-26页
    1.5 论文研究目的和主要研究内容第26-29页
        1.5.1 研究目的第26页
        1.5.2 主要研究内容第26-28页
        1.5.3 课题创新点第28-29页
第二章 家蚕蛋白乙酰化修饰的高通量鉴定第29-52页
    2.1 材料、试剂及仪器设备第29-32页
        2.1.1 主要材料与仪器第29页
        2.1.2 主要试剂第29页
        2.1.3 主要试剂配制第29-32页
    2.2 方法第32-34页
        2.2.1 家蚕总蛋白的提取和乙酰化的Western blot检测第32页
        2.2.2 乙酰化肽段富集和高精度质谱nano-HPLC-MS/MS分析第32-33页
        2.2.3 乙酰化蛋白的注释和生物信息学功能分析第33-34页
            2.2.3.1 蛋白注释第33-34页
            2.2.3.2 功能富集分析第34页
            2.2.3.3 二级结构分析第34页
            2.2.3.4 乙酰化位点序列模式分析第34页
    2.3 结果与讨论第34-50页
        2.3.1 家蚕总蛋白乙酰化Western blot检测第34-36页
        2.3.2 高精度质谱高通量鉴定家蚕蛋白乙酰化修饰第36-37页
        2.3.3 家蚕蛋白乙酰化位点具有特定的模式和偏好性第37-39页
        2.3.4 家蚕乙酰化蛋白的功能特征第39-43页
        2.3.5 乙酰化修饰可能为家蚕营养储藏、转运和代谢调控的常见机制第43-48页
        2.3.6 乙酰化修饰可能参与家蚕幼虫期蚕丝的合成调控第48-50页
    2.4 本章结论第50-52页
第三章 家蚕各发育期营养储藏蛋白和丝蛋白乙酰化的鉴定及其功能分析第52-65页
    3.1 材料、试剂及仪器设备第52-55页
        3.1.1 主要材料与仪器第52页
        3.1.2 主要试剂第52页
        3.1.3 主要试剂配制第52-55页
    3.2 方法第55-57页
        3.2.1 家蚕的饲养第55页
        3.2.2 家蚕各发育期营养储藏蛋白乙酰化的鉴定第55页
        3.2.3 家蚕各发育期丝蛋白乙酰化的鉴定第55页
        3.2.4 SDS-PAGE鉴定第55-56页
        3.2.5 Western blot鉴定第56页
        3.2.6 PAGE胶点蛋白HPLC-MS/MS鉴定第56-57页
    3.3 结果与讨论第57-63页
        3.3.1 家蚕各发育期营养储藏蛋白乙酰化的情况第57-59页
        3.3.2 家蚕各发育期蚕丝蛋白乙酰化的情况第59-60页
        3.3.3 丝胶蛋白乙酰化的功能预测与分析第60-63页
    3.4 本章结论第63-65页
第四章 乙酰化修饰提高SP2蛋白水平的机制研究及其调控蚕丝蛋白合成的过程分析第65-75页
    4.1 材料、试剂及仪器设备第65-66页
        4.1.1 主要材料与仪器第65页
        4.1.2 主要试剂第65页
        4.1.3 主要试剂配制第65-66页
    4.2 方法第66-68页
        4.2.1 家蚕BmN细胞贴壁培养第66页
        4.2.2 TSA及C646对SP2蛋白含量的影响第66-67页
        4.2.3 CHX抑制蛋白质合成对TSA上调SP2含量的影响第67页
        4.2.4 MG132抑制蛋白质的泛素化降解途径对TSA上调SP2含量的影响第67页
        4.2.5 家蚕细胞中重组HIS-SP2蛋白的免疫共沉淀第67-68页
        4.2.6 SP2蛋白赖氨酸乙酰化及泛素化修饰的竞争鉴定第68页
    4.3 结果与讨论第68-73页
        4.3.1 乙酰化修饰对SP2蛋白表达含量的影响第68-70页
        4.3.2 乙酰化修饰通过抑制蛋白酶体降解途径来提高SP2蛋白含量第70-71页
        4.3.3 乙酰化修饰通过竞争SP2蛋白的泛素化修饰来抑制泛素介导的蛋白酶体降解途径第71-72页
        4.3.4 乙酰化修饰调控蚕丝蛋白合成的过程分析第72-73页
    4.4 本章结论第73-75页
第五章 乙酰化修饰对家蚕细胞和蚕丝合成的影响研究第75-88页
    5.1 材料、试剂及仪器设备第75-77页
        5.1.1 主要材料与仪器第75页
        5.1.2 主要试剂第75-76页
        5.1.3 主要试剂配制第76-77页
    5.2 方法第77-80页
        5.2.1 SP2蛋白真核表达载体pIEx1BmSP2的构建第77-79页
            5.2.1.1 SP2基因的PCR扩增第77-78页
            5.2.1.2 PCR产物的酶切第78页
            5.2.1.3 连接反应第78-79页
            5.2.1.4 连接产物的转化第79页
            5.2.1.5 重组质粒的筛选与鉴定第79页
            5.2.1.6 重组质粒的测序鉴定第79页
        5.2.2 乙酰化对家蚕细胞生长的影响第79-80页
        5.2.3 乙酰化蚕丝样品的制备第80页
        5.2.4 乙酰化蚕丝的性能测试第80页
    5.3 结果与讨论第80-87页
        5.3.1 SP2真核表达载体的构建第80-81页
        5.3.2 乙酰化对家蚕BmN细胞抗凋亡的作用第81-82页
        5.3.3 乙酰化蚕丝的力学性能第82-84页
        5.3.4 乙酰化蚕丝的红外光谱检测第84-85页
        5.3.5 乙酰化蚕丝的X射线衍射检测第85页
        5.3.6 乙酰化蚕丝的扫描电镜表征第85-87页
    5.4 本章结论第87-88页
第六章 结论与展望第88-91页
    6.1 结论第88-89页
    6.2 展望第89-91页
参考文献第91-99页
致谢第99-100页
博士在读期间发表论文第100-101页
附录第101-128页

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