| 摘要 | 第5-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-37页 |
| 第一节 表观遗传学 | 第14-19页 |
| 第二节 DNA甲基化 | 第19-30页 |
| 1 DNA甲基化的作用机制 | 第19-22页 |
| 1.1 DNA甲基化的概念与特点 | 第19-20页 |
| 1.2 DNA甲基化与去甲基化机制 | 第20-22页 |
| 1.3 DNA甲基化调控基因表达的机制 | 第22页 |
| 2 DNA甲基化的遗传与变异 | 第22-25页 |
| 2.1 DNA甲基化的遗传 | 第22-23页 |
| 2.2 DNA甲基化的变异 | 第23-25页 |
| 3 DNA甲基化的生物学功能 | 第25-30页 |
| 3.1 DNA甲基化与基因组防御 | 第26页 |
| 3.2 DNA甲基化与发育分化 | 第26-27页 |
| 3.3 DNA甲基化与基因印记 | 第27-28页 |
| 3.4 DNA甲基化与X染色体失活 | 第28页 |
| 3.5 DNA甲基化与疾病 | 第28-30页 |
| 第三节 DNA甲基化在水产动物中的研究进展 | 第30-35页 |
| 第四节 本研究的目标和主要研究内容 | 第35-37页 |
| 1 研究目标 | 第35页 |
| 2 研究内容 | 第35-37页 |
| 2.1 长牡蛎DNA甲基化的遗传模式 | 第35页 |
| 2.2 长牡蛎DNA甲基化的组织特异性 | 第35-36页 |
| 2.3 长牡蛎三倍体基因组DNA甲基化 | 第36页 |
| 2.4 长牡蛎三倍体生殖相关基因表达与甲基化模式 | 第36页 |
| 2.5 长牡蛎人工选育群体DNA甲基化变异 | 第36-37页 |
| 第二章 长牡蛎DNA甲基化遗传模式及组织特异性 | 第37-56页 |
| 第一节 DNA甲基化在长牡蛎亲子代间的遗传 | 第37-48页 |
| 0 引言 | 第37-38页 |
| 1 材料与方法 | 第38-43页 |
| 1.1 实验材料 | 第38页 |
| 1.2 实验方法 | 第38-41页 |
| 1.3 数据分析 | 第41-43页 |
| 2 结果 | 第43-45页 |
| 2.1 长牡蛎亲子代在CCGG位点的胞嘧啶甲基化水平 | 第43页 |
| 2.2 长牡蛎亲子代间DNA甲基化模式的遗传与变异 | 第43-45页 |
| 3 讨论 | 第45-48页 |
| 3.1 长牡蛎DNA甲基化模式分析 | 第45-46页 |
| 3.2 长牡蛎DNA甲基化模式的遗传与变异 | 第46-48页 |
| 第二节 DNA甲基化在长牡蛎不同组织中的分化 | 第48-56页 |
| 0 引言 | 第48-49页 |
| 1 材料和方法 | 第49-50页 |
| 1.1 实验材料 | 第49页 |
| 1.2 实验方法 | 第49-50页 |
| 2 结果与分析 | 第50-53页 |
| 2.1 不同组织基因组DNA甲基化水平分析 | 第50-51页 |
| 2.2 组织特异性分析 | 第51-52页 |
| 2.3 长牡蛎遗传背景分析 | 第52-53页 |
| 3 讨论 | 第53-56页 |
| 3.1 长牡蛎不同组织甲基化水平分析 | 第53-54页 |
| 3.2 组织特异性甲基化功能分析 | 第54-56页 |
| 第三章 长牡蛎三倍体DNA甲基化研究 | 第56-89页 |
| 第一节 基于微卫星标记的长牡蛎三倍体鉴定 | 第56-64页 |
| 0 引言 | 第56-57页 |
| 1 材料与方法 | 第57-58页 |
| 1.1 亲贝获取、受精、三倍体诱导及样品采集 | 第57页 |
| 1.2 DNA提取、PCR扩增及基因型分析 | 第57页 |
| 1.3 流式细胞仪倍性鉴定 | 第57-58页 |
| 2 结果 | 第58-61页 |
| 2.1 微卫星位点筛选及二倍体验证 | 第58-59页 |
| 2.2 微卫星标记及流式细胞仪方法倍性检测结果分析 | 第59-60页 |
| 2.3 倍性检测所需微卫星数目分析 | 第60-61页 |
| 3 讨论 | 第61-64页 |
| 3.1 长牡蛎倍性检测方法比较 | 第61-62页 |
| 3.2 倍性检测所需微卫星位点数与微卫星-着丝粒重组率关系 | 第62页 |
| 3.3 无效等位基因 | 第62-64页 |
| 第二节 长牡蛎三倍体基因组DNA甲基化F-MSAP分析 | 第64-74页 |
| 0 引言 | 第64页 |
| 1 材料与方法 | 第64-66页 |
| 1.1 实验材料 | 第64页 |
| 1.2 实验方法 | 第64-65页 |
| 1.3 数据分析 | 第65-66页 |
| 2 结果 | 第66-72页 |
| 2.1 长牡蛎二倍体与三倍体整体DNA甲基化水平比较 | 第66-67页 |
| 2.2 长牡蛎二倍体与三倍体的表观遗传结构分析 | 第67-68页 |
| 2.3 长牡蛎二倍体与三倍体亲子间基因分离比较 | 第68-71页 |
| 2.4 长牡蛎雄性特有甲基化位点 | 第71-72页 |
| 3 讨论 | 第72-74页 |
| 3.1 长牡蛎多倍体化过程中的DNA甲基化变异 | 第72-73页 |
| 3.2 长牡蛎性别决定与DNA甲基化 | 第73-74页 |
| 第三节 长牡蛎三倍体生殖相关基因表达与甲基化水平分析 | 第74-89页 |
| 0 引言 | 第74页 |
| 1 材料与方法 | 第74-79页 |
| 1.1 实验材料 | 第74-75页 |
| 1.2 实验方法 | 第75-79页 |
| 2 结果 | 第79-86页 |
| 2.1 DNA和RNA的提取及质量检测 | 第79页 |
| 2.2 目的基因与内参基因的扩增效率验证 | 第79页 |
| 2.3 二倍体与三倍体与三倍体长牡蛎生殖相关基因mRNA表达差异 | 第79-81页 |
| 2.4 putative Vg、caER基因CpG富集区的DNA甲基化模式 | 第81-86页 |
| 3 讨论 | 第86-89页 |
| 3.1 长牡蛎二倍体与三倍体差异表达基因分析 | 第86-88页 |
| 3.2 DNA甲基化与基因表达分析 | 第88-89页 |
| 第四章 长牡蛎人工选育群体DNA甲基化研究 | 第89-100页 |
| 0 引言 | 第89页 |
| 1 材料与方法 | 第89-92页 |
| 1.1 实验材料 | 第89-90页 |
| 1.2 实验方法 | 第90-91页 |
| 1.3 数据分析 | 第91-92页 |
| 2 结果 | 第92-98页 |
| 2.1 AFLP分析 | 第92-93页 |
| 2.2 MSAP分析 | 第93-96页 |
| 2.3 表观遗传多样性与遗传多样性相关性分析 | 第96-98页 |
| 3 讨论 | 第98-100页 |
| 3.1 选育群体遗传多样性与变异 | 第98页 |
| 3.2 人工选育过程中的DNA甲基化变异 | 第98-100页 |
| 总结 | 第100-102页 |
| 参考文献 | 第102-127页 |
| 致谢 | 第127-128页 |
| 个人简历 | 第128-129页 |
| 学术成果 | 第129页 |
