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基于微卫星和线粒体DNA的陕西秦巴山区中华蜜蜂遗传多样性研究

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
第1章 绪论第11-23页
    1.1 中华蜜蜂的研究概况第11-13页
        1.1.1 中华蜜蜂的分类地位及品种资源第11页
        1.1.2 中华蜜蜂各生态型的分布、外形特征及生物学特性第11-13页
        1.1.3 中华蜜蜂在森林生态系统中的作用第13页
    1.2 秦巴山区自然概况第13-14页
    1.3 遗传多样性第14页
        1.3.1 遗传多样性与遗传结构的含义第14页
        1.3.2 遗传多样性的研究意义第14页
    1.4 中华蜜蜂遗传多样性的研究方法第14-20页
        1.4.1 简单重复序列SSR第15-18页
        1.4.2 线粒体DNA标记第18-20页
    1.5 研究目的和意义第20-23页
第2章 基于微卫星标记的陕西秦巴山区中华蜜蜂遗传多样性研究第23-51页
    2.1 材料与方法第23-29页
        2.1.1 样品采集使用第23页
        2.1.2 主要实验仪器第23-24页
        2.1.3 主要实验试剂第24页
        2.1.4 主要试剂配置第24页
        2.1.5 微卫星引物第24页
        2.1.6 基因组DNA提取第24-25页
        2.1.7 微卫星引物的合成第25-28页
        2.1.8 PCR扩增与基因分型第28-29页
    2.2 数据分析第29-31页
        2.2.1 数据整理第29页
        2.2.2 遗传多样性参数计算第29-30页
        2.2.3 Hardy-Weinberg平衡检测第30页
        2.2.4 连锁不平衡检测第30页
        2.2.5 分子方差分析第30页
        2.2.6 遗传距离与聚类分析第30-31页
        2.2.7 基于模型的聚类分析第31页
        2.2.8 遗传距离与地理距离的相关性(Isolation by distance,IBD)第31页
        2.2.9 种群历史动态分析第31页
    2.3 结果与分析第31-47页
        2.3.1 微卫星分型结果第31-32页
        2.3.2 微卫星位点多态性分析第32-34页
        2.3.3 种群遗传多样性第34页
        2.3.4 哈迪-温伯格平衡检验第34页
        2.3.5 连锁不平衡检验第34页
        2.3.6 瓶颈效应检测第34-35页
        2.3.7 种群遗传结构分析第35-47页
    2.4 讨论第47-51页
        2.4.1 中华蜜蜂不同地理种群遗传多样性分析第47-48页
        2.4.2 陕西秦巴山区中蜂群体遗传结构分析第48-49页
        2.4.3 陕西秦巴山区中华蜜蜂群体聚类分析第49-51页
第3章 基于线粒体标记的陕西秦巴山区中华蜜蜂遗传多样性研究第51-73页
    3.1 材料与方法第51-52页
        3.1.1 样品采集使用第51页
        3.1.2 主要实验仪器第51页
        3.1.3 主要实验试剂第51页
        3.1.4 主要试剂配置第51页
        3.1.5 基因组DNA提取第51页
        3.1.6 PCR扩增、检测与测序第51-52页
    3.2 数据分析第52页
    3.3 结果与分析第52-70页
        3.3.1 DNA提取结果和PCR扩增产物检验第52-53页
        3.3.2 20个地理种群mtDNA COⅡ基因的遗传多态性第53-56页
        3.3.3 20个地理种群mtDNA非编码区基因序列遗传多态性第56-57页
        3.3.4 20个地理种群中华蜜蜂mtDNA COⅡ遗传结构第57-58页
        3.3.5 20个地理种群中华蜜蜂mtDNA非编码区序列的遗传结构第58-67页
        3.3.6 20个地理种群中华蜜蜂mtDNA序列单倍型网络中介图第67-68页
        3.3.7 陕西秦巴山区中华蜜蜂系统进化树构建第68-70页
    3.4 讨论第70-73页
        3.4.1 20个地理种群mtDNA基因序列遗传多态性分析第70-71页
        3.4.2 20个地理种群mtDNA基因序列遗传结构分析第71-72页
        3.4.3 地理距离与群体间mtDNA遗传距离的关系第72页
        3.4.4 分子系统关系分析第72-73页
第4章 结论第73-75页
参考文献第75-85页
致谢第85页

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