| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 1 前言 | 第12-21页 |
| 1.1 凡纳滨对虾 | 第12-13页 |
| 1.2 转录组测序简介 | 第13-14页 |
| 1.3 转录组测序在对虾生物学研究中的应用 | 第14页 |
| 1.4 性别相关基因 | 第14-19页 |
| 1.4.1 性别决定基因 | 第14-16页 |
| 1.4.2 性腺分化和性腺发育相关基因 | 第16-19页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第19-20页 |
| 1.6 本研究的技术路线 | 第20-21页 |
| 2 材料与方法 | 第21-28页 |
| 2.1 实验材料 | 第21-22页 |
| 2.1.1 凡纳滨对虾亲虾 | 第21页 |
| 2.1.2 主要仪器设备 | 第21页 |
| 2.1.3 主要试剂盒和试剂 | 第21页 |
| 2.1.4 相关溶液的配制方法 | 第21页 |
| 2.1.5 器具及处理 | 第21-22页 |
| 2.2 实验方法 | 第22-28页 |
| 2.2.1 亲虾暂养、处理与转录组样品采集 | 第22页 |
| 2.2.2 总RNA抽提 | 第22-23页 |
| 2.2.3 总RNA完整性和纯度检验 | 第23页 |
| 2.2.4 mRNA的纯化和cDNA文库构建 | 第23-24页 |
| 2.2.5 Illumina Hiseq2000平台测序 | 第24页 |
| 2.2.6 De novo组装 | 第24-25页 |
| 2.2.7 注释 | 第25页 |
| 2.2.8 性别特异表达和差异表达基因的鉴定 | 第25-26页 |
| 2.2.9 半定量和实时荧光定量PCR验证 | 第26-27页 |
| 2.2.10 SSR | 第27-28页 |
| 3 结果与分析 | 第28-46页 |
| 3.1 RNA质检结果 | 第28-29页 |
| 3.2 测序产量 | 第29页 |
| 3.3 序列分析与组装 | 第29-30页 |
| 3.4 转录组的完整度 | 第30-31页 |
| 3.5 注释 | 第31-36页 |
| 3.5.1 NR注释 | 第32-33页 |
| 3.5.2 COG注释 | 第33-34页 |
| 3.5.3 GO功能注释 | 第34-36页 |
| 3.5.4 代谢通路分析 | 第36页 |
| 3.6 性别差异基因鉴定和富集分析 | 第36-40页 |
| 3.7 性别差异基因的实时荧光定量PCR验证 | 第40-45页 |
| 3.8 SSRS | 第45-46页 |
| 4 讨论 | 第46-51页 |
| 4.1 性别决定基因 | 第46-47页 |
| 4.2 性腺分化和性腺发育相关基因 | 第47-50页 |
| 4.2.1 性腺组织的体细胞和生殖细胞形成 | 第47-48页 |
| 4.2.2 生殖细胞的RNA翻译调控 | 第48页 |
| 4.2.3 性腺差异表达基因 | 第48-50页 |
| 4.3 性别偏向表达基因的验证 | 第50页 |
| 4.4 SSR标记的鉴定 | 第50-51页 |
| 5 结论 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-58页 |
| 附录 | 第58-101页 |
| 致谢 | 第101-102页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第102页 |