| 摘 要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 1 绪 论 | 第7-11页 |
| 1.1 研究目的 | 第8页 |
| 1.2 研究内容 | 第8-9页 |
| 1.3 研究方法 | 第9页 |
| 1.4 分子进化研究的意义 | 第9-10页 |
| 1.5 基因序列获取方法设计的意义 | 第10-11页 |
| 2 理论基础 | 第11-27页 |
| 2.1 分子钟 | 第11-15页 |
| 2.2 分子进化中立论(the neutral theory of molecular evolution) | 第15-19页 |
| 2.3 系统发育分析 | 第19-26页 |
| 2.4 线性树(Linearized Tree) | 第26-27页 |
| 3 大规模基因序列获取的程序设计 | 第27-37页 |
| 3.1 前言 | 第27-28页 |
| 3.2 程序设计方法 | 第28-30页 |
| 3.3 源代码及程序运行环境 | 第30-31页 |
| 3.4 大规模序列的获取 | 第31页 |
| 3.5 讨论 | 第31-33页 |
| 3.6 小结 | 第33-37页 |
| 4 红豆杉的分子进化研究 | 第37-53页 |
| 4.1 前言 | 第37-41页 |
| 4.2 材料 | 第41页 |
| 4.3 数据分析及结果 | 第41-51页 |
| 4.4 讨论 | 第51-53页 |
| 5 总结与展望 | 第53-55页 |
| 5.1 总结 | 第53-54页 |
| 5.2 展望 | 第54-55页 |
| 致 谢 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-60页 |
| 附录 攻读硕士学位期间发表的文章 | 第60页 |