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基于高通量测序的芥菜结构变异(SV)标记开发及应用

致谢第6-7页
缩写词第7-10页
摘要第10-12页
Abstract第12-13页
1 文献综述第16-31页
    1.1 高通量测序第16-20页
    1.2 榨菜起源与育种进展第20-22页
    1.3 榨菜膨大性状研究第22-23页
    1.4 QTL研究进展第23-28页
        1.4.1 分子标记简述第23-26页
        1.4.2 QTL研究进展第26-28页
    1.5 芥菜类作物遗传多样性研究进展第28-30页
    1.6 研究目的及意义第30-31页
2 基于高通量测序开发SV分子标记第31-40页
    2.1 材料与方法第31-33页
        2.1.1 实验材料第31页
        2.1.2 实验方法第31-33页
            2.1.2.1 DNA extraction kit第31页
            2.1.2.2 基因组文库制备第31-32页
            2.1.2.3 基因组测序和重测序第32-33页
            2.1.2.4 SV引物设计及SV-PCR扩增第33页
    2.2 结果第33-38页
        2.2.1 基因组测序及序列组装第33-34页
        2.2.2 SV检测第34-37页
        2.2.3 SV引物设计及多态性检验第37-38页
    2.3 讨论第38-40页
3 榨菜瘤状茎膨大性状遗传分析和遗传连锁图谱构建第40-51页
    3.1 材料与方法第40-44页
        3.1.1 实验材料第40-41页
        3.1.2 试验方法第41-44页
            3.1.2.1 性状统计与分析第41页
            3.1.2.2 基因组DNA提取与纯化第41-42页
            3.1.2.3 SV分子标记的筛选第42-44页
            3.1.2.4 条带数据统计及遗传图谱构建第44页
    3.2 结果与分析第44-49页
        3.2.1 基因组DNA提取第44页
        3.2.2 不同世代瘤状茎膨大性状值分布第44-46页
        3.2.3 SV引物和IP引物筛选第46-47页
        3.2.4 分子遗传连锁图谱的构建第47-48页
        3.2.5 瘤状茎膨大性状的QTL分析及定位第48-49页
    3.3 讨论第49-51页
4 芥菜种质遗传多样性分析第51-61页
    4.1 材料与方法第51-53页
        4.1.1 实验材料第51-53页
        4.1.2 实验方法第53页
            4.1.2.1 引物筛选第53页
            4.1.2.2 构建系统进化树第53页
    4.2 结果第53-59页
        4.2.1 多态性水平第53-55页
        4.2.2 构建系统进化树第55-59页
    4.3 讨论第59-61页
5 小结第61-63页
参考文献第63-73页
附录第73-75页
硕士期同发表论文第75页

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