| 摘要 | 第5-8页 |
| Abstract | 第8-11页 |
| 第1章 绪论 | 第18-40页 |
| 1.1 与污染物降解相关的微生物 | 第18-22页 |
| 1.1.1 固体废物木质纤维素的微生物降解 | 第18-20页 |
| 1.1.2 农药的微生物降解 | 第20-21页 |
| 1.1.3 石油的微生物降解 | 第21-22页 |
| 1.2 与污染物降解无关的微生物 | 第22-23页 |
| 1.3 分子间的相互作用 | 第23-29页 |
| 1.3.1 分子间的相互作用分析方法 -分子对接与分子动力学模拟 | 第23-27页 |
| 1.3.2 分子间的相互作用分析方法 -实验技术 | 第27-28页 |
| 1.3.3 分子模拟在环境领域的应用 | 第28-29页 |
| 1.4 微卫星概述 | 第29-36页 |
| 1.4.1 微卫星 | 第29-30页 |
| 1.4.2 微卫星分析工具 | 第30-31页 |
| 1.4.3 原核生物中的微卫星 | 第31-32页 |
| 1.4.4 真核生物中的微卫星 | 第32-35页 |
| 1.4.5 病毒中的微卫星 | 第35-36页 |
| 1.5 论文结构与主要内容 | 第36-40页 |
| 1.5.1 选题背景 | 第36-38页 |
| 1.5.2 研究内容 | 第38-40页 |
| 第2章 理解木质素降解酶的木质素降解反应：结合亲和力和相互作用轮廓 | 第40-54页 |
| 2.1 材料与方法 | 第41-42页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第42-52页 |
| 2.2.1 结合亲和力 | 第43-45页 |
| 2.2.2 相互作用分析和分子动力学模拟 | 第45-52页 |
| 2.3 本章小结 | 第52-54页 |
| 第3章 与污染物降解无关的微生物—E. coli 中的复合微卫星 | 第54-62页 |
| 3.1 材料与方法 | 第55-57页 |
| 3.1.1 基因组序列 | 第55-56页 |
| 3.1.2 复合微卫星 | 第56-57页 |
| 3.1.3 复合微卫星的显著性分析 | 第57页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第57-61页 |
| 3.2.1 复合微卫星的出现规律 | 第57-60页 |
| 3.2.2 复合微卫星的复杂性 | 第60页 |
| 3.2.3 复合微卫星的基序和结构 | 第60-61页 |
| 3.3 本章小结 | 第61-62页 |
| 第4章 与污染物降解无关的微生物—HIV-1 全基因组中相似的微卫星分布 | 第62-70页 |
| 4.1 材料与方法 | 第62-64页 |
| 4.2 结果与讨论 | 第64-69页 |
| 4.2.1 微卫星的总数和相对丰度 | 第65-67页 |
| 4.2.2 微卫星的相对密度 | 第67-68页 |
| 4.2.3 最常见的微卫星基序 | 第68页 |
| 4.2.4 最长的微卫星 | 第68-69页 |
| 4.3 本章小结 | 第69-70页 |
| 第5章 与污染物降解无关的微生物—HIV-1 全基因组中的复合微卫星 | 第70-84页 |
| 5.1 材料与方法 | 第70-73页 |
| 5.1.1 基因组序列 | 第70-71页 |
| 5.1.2 复合微卫星的分析 | 第71-73页 |
| 5.2 结果 | 第73-81页 |
| 5.2.1 dMAX 对复合微卫星数量的影响 | 第73-74页 |
| 5.2.2 复合微卫星的数量、相对丰度和相对密度 | 第74-77页 |
| 5.2.3 影响复合微卫星分布的参数 | 第77-78页 |
| 5.2.4 复合微卫星的基序和复杂性 | 第78-81页 |
| 5.3 讨论 | 第81-83页 |
| 5.4 本章小结 | 第83-84页 |
| 第6章 与污染物降解无关的微生物—HCV 基因组中微卫星是一重要组分 | 第84-106页 |
| 6.1 材料与方法 | 第85-87页 |
| 6.1.1 HCV 基因组 | 第85-86页 |
| 6.1.2 微卫星的识别 | 第86页 |
| 6.1.3 微卫星期望值的计算 | 第86-87页 |
| 6.1.4 统计分析 | 第87页 |
| 6.2 结果与讨论 | 第87-105页 |
| 6.2.1 单核苷酸重复 | 第89-94页 |
| 6.2.2 Microsatellites2-6 | 第94-100页 |
| 6.2.3 微卫星多态性的识别 | 第100-105页 |
| 6.3 本章小结 | 第105-106页 |
| 第7章 Pre-miRNAs 中的微卫星 | 第106-123页 |
| 7.1 材料与方法 | 第106-107页 |
| 7.1.1 Pre-miRNAs 序列 | 第106-107页 |
| 7.1.2 微卫星分析 | 第107页 |
| 7.2 结果 | 第107-119页 |
| 7.2.1 单核苷酸重复 | 第108-114页 |
| 7.2.2 二核苷酸重复 | 第114-118页 |
| 7.2.3 三核苷酸重复 | 第118-119页 |
| 7.2.4 四核苷酸重复 | 第119页 |
| 7.2.5 五核苷酸重复 | 第119页 |
| 7.2.6 六核苷酸重复 | 第119页 |
| 7.3 讨论 | 第119-121页 |
| 7.4 本章小结 | 第121-123页 |
| 结论 | 第123-127页 |
| 参考文献 | 第127-147页 |
| 附录 A 攻读学位期间发表的论文目录 | 第147-151页 |
| 附录 B 攻读学位期间获得的发明专利 | 第151-152页 |
| 附录 C 攻读学位期间参与和负责的研究课题 | 第152-153页 |
| 致谢 | 第153-154页 |
