| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 1 引言 | 第8-13页 |
| 1.1 线粒体遗传学及线粒体基因组研究进展 | 第8-9页 |
| 1.1.1 线粒体的遗传学 | 第8页 |
| 1.1.2 线粒体基因组研究进展 | 第8-9页 |
| 1.2 线粒体单倍型测定在致病疫霉研究中的应用 | 第9-11页 |
| 1.2.1 单倍型在群体结构中的研究 | 第9-10页 |
| 1.2.2 单倍型在群体的起源、迁移及遗传图谱构建中的研究 | 第10页 |
| 1.2.3 单倍型与地理来源的关系 | 第10-11页 |
| 1.3 已建立的致病疫霉线粒体单倍型的检测方法 | 第11-12页 |
| 1.3.1 RFLP 酶切法 | 第11页 |
| 1.3.2 Southern 杂交法 | 第11页 |
| 1.3.3 PCR-RFLP 限制性片段长度法 | 第11-12页 |
| 1.4 本研究的目的及意义 | 第12-13页 |
| 2 材料与方法 | 第13-18页 |
| 2.1 材料 | 第13-14页 |
| 2.1.1 致病疫霉线粒体基因组序列 | 第13页 |
| 2.1.2 供试菌株 | 第13页 |
| 2.1.3 供试培养基 | 第13页 |
| 2.1.4 供试试剂 | 第13-14页 |
| 2.1.5 供试仪器 | 第14页 |
| 2.2 方法 | 第14-18页 |
| 2.2.1 致病疫霉的分离及纯化 | 第14页 |
| 2.2.2 致病疫霉基因组 DNA 提取及检测 | 第14-15页 |
| 2.2.3 致病疫霉线粒体基因组间多态性分析 | 第15页 |
| 2.2.4 线粒体高变区扩增子特异性引物设计 | 第15页 |
| 2.2.5 PCR 扩展体系的建立及引物特异性检测 | 第15页 |
| 2.2.6 PCR 法对致病疫霉线粒体单倍型的测定 | 第15页 |
| 2.2.7 PCR-RFLP 法对致病疫霉线粒体单倍型的测定 | 第15-17页 |
| 2.2.8 单游动孢子的分离 | 第17-18页 |
| 3 结果与分析 | 第18-33页 |
| 3.1 致病疫霉线粒体单倍型 PCR 检测方法的建立 | 第18-23页 |
| 3.1.1 致病疫霉线粒体基因组多态性分析 | 第18-19页 |
| 3.1.2 线粒体单倍型 PCR 检测方法建立的理论依据 | 第19页 |
| 3.1.3 引物设计及单倍型命名 | 第19-21页 |
| 3.1.4 PCR 体系和条件的建立 | 第21页 |
| 3.1.5 线粒体两个高变区引物特异性检测 | 第21-22页 |
| 3.1.6 以 PCR 技术为基础的致病疫霉线粒体单倍型的检测 | 第22-23页 |
| 3.2 PCR 法与 PCR-RFLP 法对致病疫霉线粒体单倍型测定的比较 | 第23-26页 |
| 3.2.1 PCR-RFLP 法对致病疫霉单倍型的测定 | 第23-24页 |
| 3.2.2 致病疫霉菌株的选择 | 第24-25页 |
| 3.2.3 以 PCR 方法发现 PCR-RFLP 方法中线粒体型 I 和 II 间的错误鉴定 | 第25-26页 |
| 3.3 中国致病疫霉线粒体单倍型的检测与分析 | 第26-30页 |
| 3.3.1 中国致病疫霉线粒体单倍型的测定 | 第26-28页 |
| 3.3.2 致病疫霉线粒体单倍型与地理位置的关系 | 第28-30页 |
| 3.4 PCR 法对致病疫霉单病斑分离物单倍型测定中杂合条带分析 | 第30-31页 |
| 3.5 线粒体高变区 HVRI 不同单倍型类型的演化关系 | 第31-33页 |
| 4 讨论 | 第33-36页 |
| 4.1 线粒体单倍型不同检测方法的比较 | 第33页 |
| 4.2 致病疫霉 MTDNA 基因组序列缺失的原因及机理 | 第33-34页 |
| 4.3 新建 PCR 法所测单倍型与表型间的相关性 | 第34页 |
| 4.4 基于线粒体基因组长度多态性所建立单倍型分型方法的生物学意义 | 第34-36页 |
| 5 结论 | 第36-37页 |
| 参考文献 | 第37-42页 |
| 附录 | 第42-44页 |
| 附录A DNA 提取所用试剂的配制 | 第42-43页 |
| 附录B 微量粗提取缓冲液 TE | 第43-44页 |
| 作者简介 | 第44-45页 |
| 致谢 | 第45-46页 |
